More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0447 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0447  ABC transporter related  100 
 
 		 251 aa  509  1e-143  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0093  amino acid ABC transporter ATPase  61.75 
 
 		 263 aa  305  6e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2670  ABC transporter related  60.73 
 
 		 251 aa  292  3e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00350307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0610  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  58.06 
 
 		 255 aa  292  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000852902  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1540  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.6 
 
 		 252 aa  288  7e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00340374  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0462  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.85 
 
 		 255 aa  286  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1540  ABC transporter related protein  57.49 
 
 		 256 aa  284  9e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000346949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4583  ABC transporter related  56.15 
 
 		 259 aa  278  7e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000093937  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2942  ABC transporter  54.69 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.769587  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3083  glutamine/glutamate ABC transporter, ATP-binding protein  53.88 
 
 		 253 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262111  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0692  conserved hypothetical protein, ABC transporter, His/Glu/Gln/Arg/opine family (ATP-binding protein)  52.23 
 
 		 245 aa  258  5.0000000000000005e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.611773  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0519  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 		 245 aa  256  3e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0494  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 		 245 aa  256  3e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000537818  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0121  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  50.2 
 
 		 246 aa  254  7e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0663  SMR family multidrug efflux pump  52.42 
 
 		 245 aa  254  8e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1470  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 		 245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000837617  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0289  general L-amino acid transport ATP-binding protein AapP  51.21 
 
 		 245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  51 
 
 		 265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  50.2 
 
 		 247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  48.96 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  51.67 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  49.8 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  48.96 
 
 		 242 aa  233  3e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  51.27 
 
 		 240 aa  232  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5219  ABC transporter related  52.03 
 
 		 257 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  49.79 
 
 		 253 aa  232  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  52.67 
 
 		 240 aa  231  7.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  51.01 
 
 		 244 aa  231  7.000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.58 
 
 		 240 aa  230  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  49.8 
 
 		 247 aa  230  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.58 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.58 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.58 
 
 		 240 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.58 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0443  ABC transporter related  51.82 
 
 		 244 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.58 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  47.67 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  52.07 
 
 		 244 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  49.38 
 
 		 253 aa  228  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  50.63 
 
 		 240 aa  228  6e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  49.17 
 
 		 240 aa  228  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1061  polar amino acid ABC transporter ATPase  48.83 
 
 		 300 aa  228  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  51.46 
 
 		 240 aa  228  6e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.17 
 
 		 240 aa  228  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  49.58 
 
 		 252 aa  228  7e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 247 aa  228  9e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.95 
 
 		 251 aa  227  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  48.54 
 
 		 241 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.75 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  47.43 
 
 		 267 aa  226  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  53.45 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  51.45 
 
 		 243 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  51.88 
 
 		 243 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0629  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.67 
 
 		 244 aa  226  3e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  49.37 
 
 		 242 aa  226  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  49.39 
 
 		 265 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  48.15 
 
 		 247 aa  226  4e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4555  ABC transporter related  49.01 
 
 		 299 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  48.55 
 
 		 249 aa  224  7e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  48.74 
 
 		 241 aa  224  9e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0718  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.06 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000110627  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  52.7 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  52.47 
 
 		 242 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  48.13 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0745  ABC transporter related  47.43 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0713  ABC transporter related  47.43 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  48.13 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  48.79 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  50 
 
 		 249 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  54.05 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  47.62 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  48.33 
 
 		 243 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  52.25 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1936  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  50.41 
 
 		 245 aa  223  3e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0352158  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  50.41 
 
 		 244 aa  222  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0593  ABC transporter related  48.12 
 
 		 241 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.180749  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0567  ABC transporter related  48.12 
 
 		 241 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67030  ABC transporter ATP-binding protein  50.62 
 
 		 244 aa  222  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  52.52 
 
 		 248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  48.76 
 
 		 249 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1012  ABC transporter-related protein  49.36 
 
 		 264 aa  221  6e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  48.95 
 
 		 246 aa  221  6e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  47.52 
 
 		 259 aa  221  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  49.37 
 
 		 246 aa  221  7e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07290  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 245 aa  221  7e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  47.72 
 
 		 249 aa  221  7e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.83 
 
 		 240 aa  221  8e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  51.12 
 
 		 242 aa  221  8e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0210  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.53 
 
 		 248 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.770881  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  47.52 
 
 		 246 aa  220  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  51.44 
 
 		 249 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  48.98 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4373  ABC transporter related  49.15 
 
 		 264 aa  220  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  52.25 
 
 		 247 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  52.52 
 
 		 248 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0257  ATP-binding protein  46.53 
 
 		 248 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000197314 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0595  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.9 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.062853  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  48.75 
 
 		 243 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1048  ABC transporter related protein  50.43 
 
 		 249 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>