More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1760 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1760  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  511  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0184  ATPase  73.28 
 
 		 255 aa  364  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1569  ABC transporter related  73.25 
 
 		 261 aa  349  3e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2546  ABC transporter related  70.8 
 
 		 255 aa  344  1e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587605  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0807  ABC transporter related  67.9 
 
 		 257 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3901  ABC transporter related  60.8 
 
 		 255 aa  312  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.292154  normal  0.145575 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1365  ABC transporter-related protein  56.67 
 
 		 251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.886307  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  53.6 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18750  ABC transporter related  54.32 
 
 		 250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000378719  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1658  ABC transporter related  52.26 
 
 		 254 aa  256  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1436  hypothetical protein  53.39 
 
 		 247 aa  255  4e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  54.92 
 
 		 250 aa  251  8.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  53.31 
 
 		 245 aa  248  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.54 
 
 		 244 aa  245  4.9999999999999997e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  51.38 
 
 		 256 aa  244  8e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  48.35 
 
 		 244 aa  244  8e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0029  ABC transporter related  52.28 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0123  ABC transporter related protein  51.67 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  50.21 
 
 		 245 aa  241  7.999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  50.62 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  47.13 
 
 		 244 aa  238  5e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  48.62 
 
 		 268 aa  238  9e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  49.38 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  50.42 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  51.2 
 
 		 250 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  51 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  49.59 
 
 		 245 aa  236  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  49.17 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  50.62 
 
 		 250 aa  235  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  48.41 
 
 		 263 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  47.74 
 
 		 246 aa  235  6e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0629  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  47.72 
 
 		 244 aa  235  6e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  46.59 
 
 		 247 aa  234  7e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  50 
 
 		 244 aa  235  7e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3697  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  50.83 
 
 		 242 aa  234  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270266  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  48.47 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  50.62 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  48.21 
 
 		 264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  46.91 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  47.76 
 
 		 244 aa  233  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  47.52 
 
 		 247 aa  233  3e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  49 
 
 		 257 aa  232  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  48.99 
 
 		 259 aa  231  7.000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  46.47 
 
 		 242 aa  231  7.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.09 
 
 		 244 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  46.89 
 
 		 242 aa  231  8.000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.68 
 
 		 244 aa  230  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  50.41 
 
 		 244 aa  231  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1806  ABC transporter related  48.75 
 
 		 248 aa  231  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.68 
 
 		 244 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  50.62 
 
 		 243 aa  230  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  50.42 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.68 
 
 		 244 aa  230  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.68 
 
 		 244 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  49.38 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  50.2 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.04 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.68 
 
 		 244 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1690  ABC transporter related  48.77 
 
 		 243 aa  229  3e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.653327 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  49.79 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  47.74 
 
 		 252 aa  229  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0834  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  47.79 
 
 		 249 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.04 
 
 		 240 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  50.21 
 
 		 251 aa  228  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.68 
 
 		 244 aa  228  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  49.38 
 
 		 256 aa  229  5e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1154  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.71 
 
 		 246 aa  228  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4158  ABC transporter related  47.98 
 
 		 254 aa  228  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  46.83 
 
 		 263 aa  228  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.59 
 
 		 257 aa  228  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2745  ABC transporter related  49.79 
 
 		 248 aa  228  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394872  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  49.19 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1298  ABC transporter component  48.4 
 
 		 263 aa  228  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.943578  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.8 
 
 		 597 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  45.04 
 
 		 240 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  48.96 
 
 		 258 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  48.96 
 
 		 258 aa  227  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1427  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  43.15 
 
 		 254 aa  228  1e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.798316  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  46.67 
 
 		 360 aa  227  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.39 
 
 		 592 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2685  ABC transporter-related protein  47.13 
 
 		 244 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.480561 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  46.28 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  47.13 
 
 		 254 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6680  ABC transporter related  47.58 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  47.2 
 
 		 253 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  49.33 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3286  ABC transporter related protein  51.02 
 
 		 280 aa  226  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00174942  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  52.08 
 
 		 248 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  46.31 
 
 		 252 aa  227  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2258  ABC transporter related  47.35 
 
 		 286 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21556  normal  0.633697 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  48.13 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  48.76 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  47.11 
 
 		 242 aa  226  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  49.8 
 
 		 597 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.8 
 
 		 597 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  45.64 
 
 		 244 aa  226  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  48.98 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  46.77 
 
 		 247 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4070  ABC transporter-related protein  47.76 
 
 		 245 aa  226  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>