More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2745 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2745  ABC transporter related  100 
 
 
248 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394872  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5550  glutamine ABC transporter  59.4 
 
 
507 aa  280  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  59 
 
 
246 aa  276  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  58.4 
 
 
256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  56.78 
 
 
249 aa  272  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.79 
 
 
258 aa  272  4.0000000000000004e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.26 
 
 
251 aa  271  8.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  55.23 
 
 
246 aa  270  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  56.15 
 
 
265 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  53.97 
 
 
247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  52.3 
 
 
242 aa  268  4e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  55.83 
 
 
244 aa  268  5e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  54.31 
 
 
242 aa  267  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.7 
 
 
502 aa  267  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  51.46 
 
 
242 aa  265  4e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  52.72 
 
 
240 aa  265  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  55.6 
 
 
257 aa  265  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  54.66 
 
 
257 aa  265  7e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  55.32 
 
 
240 aa  265  7e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  54.62 
 
 
247 aa  264  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  53.97 
 
 
241 aa  264  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  53.14 
 
 
240 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  49.79 
 
 
246 aa  263  1e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.3 
 
 
240 aa  264  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  53.97 
 
 
241 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4870  ABC transporter related  55.92 
 
 
256 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933928  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3865  ABC transporter related protein  58.7 
 
 
249 aa  263  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  52.1 
 
 
363 aa  263  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  52.1 
 
 
363 aa  263  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  53.97 
 
 
241 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  55.56 
 
 
269 aa  263  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6048  ABC transporter-related protein  56.38 
 
 
243 aa  263  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0164038  normal  0.602445 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.23 
 
 
240 aa  263  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  56.33 
 
 
258 aa  262  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  53.56 
 
 
241 aa  263  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  50.4 
 
 
250 aa  262  3e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  56.33 
 
 
258 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1806  ABC transporter related  56.3 
 
 
248 aa  262  4e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  51.88 
 
 
242 aa  262  4e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  51.45 
 
 
246 aa  261  4.999999999999999e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1365  ABC transporter-related protein  53.31 
 
 
251 aa  261  6e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.886307  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  54.36 
 
 
286 aa  261  6e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  54.29 
 
 
273 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  55.98 
 
 
244 aa  261  8e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.97 
 
 
510 aa  261  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.88 
 
 
240 aa  260  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.3 
 
 
240 aa  260  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.88 
 
 
240 aa  260  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.88 
 
 
240 aa  260  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.88 
 
 
240 aa  260  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  52.63 
 
 
255 aa  260  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  52.65 
 
 
260 aa  260  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.88 
 
 
240 aa  260  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  55.19 
 
 
273 aa  259  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1445  ABC transporter related  49.59 
 
 
249 aa  259  2e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.124868  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  51.91 
 
 
243 aa  259  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  55.13 
 
 
240 aa  259  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  51.91 
 
 
243 aa  260  2e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.88 
 
 
240 aa  259  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  55.65 
 
 
246 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  53.56 
 
 
241 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  55.56 
 
 
240 aa  259  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.1 
 
 
240 aa  259  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  52.65 
 
 
247 aa  259  4e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.46 
 
 
240 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  52.72 
 
 
240 aa  258  5.0000000000000005e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 
269 aa  258  5.0000000000000005e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2484  ABC transporter related  56.96 
 
 
245 aa  258  6e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000266476 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.1 
 
 
240 aa  258  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  56.64 
 
 
248 aa  257  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.14 
 
 
254 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  53.14 
 
 
254 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 
249 aa  257  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  52.5 
 
 
261 aa  257  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  54.81 
 
 
245 aa  257  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  52.72 
 
 
242 aa  257  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  52.72 
 
 
241 aa  257  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  53.14 
 
 
254 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  50 
 
 
269 aa  257  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  52.72 
 
 
241 aa  257  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.72 
 
 
241 aa  256  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  53.14 
 
 
254 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  53.14 
 
 
244 aa  256  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.42 
 
 
516 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0029  ABC transporter related  50.63 
 
 
250 aa  257  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957294  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.45 
 
 
246 aa  257  2e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  53.56 
 
 
244 aa  256  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  49.59 
 
 
262 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  53.23 
 
 
248 aa  256  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  52.72 
 
 
246 aa  256  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  51.49 
 
 
243 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.52 
 
 
240 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  53.23 
 
 
248 aa  256  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.52 
 
 
240 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  52.3 
 
 
241 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  51.88 
 
 
253 aa  256  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  50.21 
 
 
240 aa  256  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.52 
 
 
240 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5760  ABC transporter related  53.82 
 
 
247 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  54.17 
 
 
262 aa  256  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>