More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1569 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1569  ABC transporter related  100 
 
 		 261 aa  529  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2546  ABC transporter related  83 
 
 		 255 aa  428  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587605  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0184  ATPase  77.08 
 
 		 255 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0807  ABC transporter related  70.08 
 
 		 257 aa  351  5.9999999999999994e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1760  ABC transporter related  73.25 
 
 		 252 aa  349  3e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3901  ABC transporter related  65.75 
 
 		 255 aa  345  3e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.292154  normal  0.145575 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1658  ABC transporter related  57.44 
 
 		 254 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  55.14 
 
 		 255 aa  278  7e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1365  ABC transporter-related protein  54.47 
 
 		 251 aa  273  3e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.886307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18750  ABC transporter related  53.47 
 
 		 250 aa  270  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000378719  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1436  hypothetical protein  53.25 
 
 		 247 aa  270  1e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  54.1 
 
 		 245 aa  264  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  55.7 
 
 		 250 aa  261  6.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0123  ABC transporter related protein  53.28 
 
 		 265 aa  258  9e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0029  ABC transporter related  54 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  47.93 
 
 		 244 aa  251  1e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  52.82 
 
 		 250 aa  248  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  50 
 
 		 247 aa  248  7e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  50.6 
 
 		 252 aa  248  8e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  50 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  51.19 
 
 		 256 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  48.13 
 
 		 242 aa  244  6.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1806  ABC transporter related  49.59 
 
 		 248 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  52.44 
 
 		 243 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  48.58 
 
 		 252 aa  244  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  48.13 
 
 		 240 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  50.42 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  49.79 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  50.61 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4859  ABC transporter related  47.67 
 
 		 266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.430729 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.72 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  48.39 
 
 		 247 aa  243  3e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  47.72 
 
 		 244 aa  243  3e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  49.79 
 
 		 244 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  50.61 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  48.33 
 
 		 245 aa  242  5e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.37 
 
 		 284 aa  242  5e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  48.37 
 
 		 253 aa  241  7e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  49.79 
 
 		 244 aa  241  9e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.28 
 
 		 244 aa  241  1e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  48.85 
 
 		 260 aa  240  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  48.36 
 
 		 256 aa  240  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1690  ABC transporter related  50.21 
 
 		 243 aa  240  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.653327 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  51.64 
 
 		 253 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  50.2 
 
 		 248 aa  240  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 270 aa  239  2e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.56 
 
 		 253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  50 
 
 		 244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  46.99 
 
 		 263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1011  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  49.79 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.648524  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.21 
 
 		 258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.5 
 
 		 244 aa  239  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  49.17 
 
 		 244 aa  239  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2745  ABC transporter related  53.48 
 
 		 248 aa  239  5e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394872  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  47.71 
 
 		 263 aa  238  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1445  ABC transporter related  45.68 
 
 		 249 aa  238  8e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.124868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  50.19 
 
 		 259 aa  238  8e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  50 
 
 		 256 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  53.1 
 
 		 246 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.09 
 
 		 244 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  48.19 
 
 		 254 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1298  ABC transporter component  48.59 
 
 		 263 aa  236  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.943578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  47.74 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  50.21 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.87 
 
 		 245 aa  236  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6087  ABC transporter related  47.66 
 
 		 280 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.369639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  48.03 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0299  ABC transporter-related protein  49.8 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  46.28 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  44.63 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  44.63 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  50.41 
 
 		 247 aa  236  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3458  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  50.21 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  49.58 
 
 		 252 aa  236  3e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  51.45 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  45.87 
 
 		 245 aa  236  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.09 
 
 		 244 aa  236  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  49.58 
 
 		 239 aa  236  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3103  ABC transporter related  50.21 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.209111  normal  0.482435 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  47.37 
 
 		 247 aa  236  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  49.21 
 
 		 256 aa  235  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6448  ABC transporter related  47.27 
 
 		 263 aa  235  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0465386 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0153  ABC transporter related  49.6 
 
 		 262 aa  236  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1617  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  46.91 
 
 		 247 aa  236  4e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000736916  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  50 
 
 		 263 aa  236  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  49.59 
 
 		 257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  49.17 
 
 		 252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  47.31 
 
 		 273 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  50 
 
 		 244 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  45.68 
 
 		 244 aa  235  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  50.2 
 
 		 248 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  49.18 
 
 		 247 aa  234  7e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  48.98 
 
 		 248 aa  235  7e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  48.16 
 
 		 254 aa  234  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  48.16 
 
 		 254 aa  234  7e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  46.89 
 
 		 242 aa  234  8e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  48.98 
 
 		 250 aa  234  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  46.53 
 
 		 246 aa  234  9e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  49.17 
 
 		 244 aa  234  9e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4751  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.56 
 
 		 269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00318924  hitchhiker  0.00202738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>