More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4859 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4859  ABC transporter related  100 
 
 		 266 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.430729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4751  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  72.76 
 
 		 269 aa  361  8e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00318924  hitchhiker  0.00202738 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6343  ABC transporter related  62.87 
 
 		 274 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.279645 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3103  ABC transporter related  56.56 
 
 		 246 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.209111  normal  0.482435 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3458  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  56.56 
 
 		 246 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2063  ABC transporter related  55.33 
 
 		 246 aa  274  9e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0300144  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  55.92 
 
 		 260 aa  273  1.0000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  54.73 
 
 		 242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  54.73 
 
 		 245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  55.56 
 
 		 245 aa  268  5e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  57.38 
 
 		 246 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  50.82 
 
 		 360 aa  266  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  56.54 
 
 		 257 aa  267  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  53.04 
 
 		 246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  58.02 
 
 		 250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.84 
 
 		 244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2258  ABC transporter related  53.09 
 
 		 286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21556  normal  0.633697 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  53.5 
 
 		 242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  53.91 
 
 		 265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  54.32 
 
 		 260 aa  265  8e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  56.33 
 
 		 252 aa  264  8.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  53.91 
 
 		 266 aa  264  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  55.56 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  53.88 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  55.56 
 
 		 258 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  53.12 
 
 		 254 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  53.94 
 
 		 244 aa  262  4e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  56.38 
 
 		 248 aa  262  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  52.67 
 
 		 242 aa  262  4.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  53.5 
 
 		 253 aa  262  4.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  52.67 
 
 		 242 aa  262  4.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  53.04 
 
 		 244 aa  261  6e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  52.67 
 
 		 240 aa  261  8e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  53.5 
 
 		 252 aa  261  8e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  53.09 
 
 		 251 aa  261  8.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  51.52 
 
 		 265 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4441  ABC transporter related  55.14 
 
 		 255 aa  260  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103673 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  51.85 
 
 		 242 aa  260  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  56.38 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  50.41 
 
 		 363 aa  260  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  56.54 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.38 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  52.67 
 
 		 244 aa  259  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  54.73 
 
 		 244 aa  259  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4373  ABC transporter related  53.28 
 
 		 264 aa  259  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  55.13 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  50.41 
 
 		 363 aa  259  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  53.78 
 
 		 254 aa  259  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4538  ABC transporter-like  52.65 
 
 		 244 aa  259  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.247485  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2090  ABC transporter component  53.69 
 
 		 247 aa  259  4e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.810567  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  52.73 
 
 		 254 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5607  ABC transporter related  52.65 
 
 		 244 aa  258  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  54.88 
 
 		 248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.67 
 
 		 240 aa  258  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  52.67 
 
 		 242 aa  258  6e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  55.32 
 
 		 240 aa  258  7e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.67 
 
 		 240 aa  258  8e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  53.5 
 
 		 242 aa  258  8e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46950  putative ATP-binding component of ABC transporter  53.06 
 
 		 244 aa  258  8e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.832772  hitchhiker  0.00625095 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  55.92 
 
 		 247 aa  258  9e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  53.28 
 
 		 247 aa  258  9e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  55.1 
 
 		 247 aa  258  9e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.92 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.03 
 
 		 240 aa  258  1e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.32 
 
 		 251 aa  257  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  51.84 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  52.63 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  55.6 
 
 		 251 aa  257  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4046  ABC transporter ATP-binding protein  53.06 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  51.85 
 
 		 243 aa  256  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  53.5 
 
 		 241 aa  257  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  51.39 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  54.58 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  54.25 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  55.33 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  49.6 
 
 		 255 aa  256  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0152  ABC transporter related  52.89 
 
 		 256 aa  256  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0734345  hitchhiker  0.0000445687 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.17 
 
 		 273 aa  256  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  54.25 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  52.67 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  54.51 
 
 		 245 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4174  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.84 
 
 		 244 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  55.51 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  52.46 
 
 		 252 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  55.6 
 
 		 254 aa  256  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  53.01 
 
 		 255 aa  256  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  51 
 
 		 254 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.67 
 
 		 253 aa  256  4e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  51.03 
 
 		 242 aa  256  4e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  55.83 
 
 		 259 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  53.5 
 
 		 243 aa  255  4e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  56.17 
 
 		 249 aa  255  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0719  ABC transporter related  52.65 
 
 		 244 aa  256  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.649778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  51.52 
 
 		 259 aa  255  5e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  54.92 
 
 		 244 aa  255  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  51.84 
 
 		 244 aa  255  6e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.09 
 
 		 284 aa  254  7e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0238  ABC transporter related  55.98 
 
 		 250 aa  254  8e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0358  ABC transporter related  54.66 
 
 		 252 aa  254  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1775  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.26 
 
 		 240 aa  254  8e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  normal  0.116362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>