More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4751 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4751  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 269 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00318924  hitchhiker  0.00202738 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4859  ABC transporter related  72.76 
 
 		 266 aa  361  8e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.430729 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6343  ABC transporter related  60.3 
 
 		 274 aa  318  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.279645 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  57.38 
 
 		 246 aa  280  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  56.5 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  55.37 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  53.25 
 
 		 244 aa  271  6e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  53.69 
 
 		 265 aa  270  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.74 
 
 		 258 aa  269  4e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  51.85 
 
 		 360 aa  268  8e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  52.89 
 
 		 242 aa  267  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  55.79 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.24 
 
 		 244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  54.88 
 
 		 256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  55.69 
 
 		 245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  53.88 
 
 		 244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  53.28 
 
 		 242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  53.66 
 
 		 245 aa  266  4e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  53.75 
 
 		 252 aa  265  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  55.69 
 
 		 250 aa  265  5.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.85 
 
 		 268 aa  265  5.999999999999999e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.38 
 
 		 240 aa  265  7e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  55.51 
 
 		 260 aa  265  7e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  54.92 
 
 		 254 aa  265  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  51.81 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  54.55 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  53.88 
 
 		 242 aa  263  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.24 
 
 		 244 aa  263  3e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  49.61 
 
 		 253 aa  263  3e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  53.88 
 
 		 242 aa  263  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  51.13 
 
 		 260 aa  262  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  54.47 
 
 		 245 aa  262  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  54.51 
 
 		 254 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  53.97 
 
 		 242 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  54.81 
 
 		 242 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  54.58 
 
 		 242 aa  261  6e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4538  ABC transporter-like  54.1 
 
 		 244 aa  261  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.247485  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  52.85 
 
 		 244 aa  261  6.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  56.91 
 
 		 244 aa  261  8e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  53.63 
 
 		 257 aa  260  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.07 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  52.67 
 
 		 245 aa  260  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  53.23 
 
 		 247 aa  260  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  53.56 
 
 		 244 aa  260  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  53.85 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  52.08 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  52.12 
 
 		 266 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  48.68 
 
 		 265 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  55.56 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.31 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  51.34 
 
 		 262 aa  259  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  55.27 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.31 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  54.84 
 
 		 266 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  54.32 
 
 		 241 aa  259  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.24 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  50.83 
 
 		 242 aa  259  4e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  54.44 
 
 		 266 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  52.87 
 
 		 247 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  53.2 
 
 		 248 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.65 
 
 		 240 aa  258  6e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  54.47 
 
 		 244 aa  258  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  54.33 
 
 		 260 aa  258  8e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.61 
 
 		 246 aa  258  9e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  51.41 
 
 		 246 aa  258  9e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.24 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4174  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.05 
 
 		 244 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481199  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.24 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.24 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.82 
 
 		 284 aa  257  1e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.24 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  52.46 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.24 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  55.51 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.24 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  54.13 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  52.82 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.43 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  54.85 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  51.65 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  53.2 
 
 		 251 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1806  ABC transporter related  52.23 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.31 
 
 		 240 aa  256  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  54.83 
 
 		 262 aa  256  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  55.24 
 
 		 261 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  54.03 
 
 		 247 aa  256  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1775  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.89 
 
 		 240 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  normal  0.116362 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  52.48 
 
 		 241 aa  256  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3458  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  52.63 
 
 		 246 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  52.02 
 
 		 255 aa  256  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  51.65 
 
 		 241 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  52.38 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  52.71 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  51.65 
 
 		 241 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.83 
 
 		 240 aa  256  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  51.03 
 
 		 244 aa  256  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  52.72 
 
 		 242 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3103  ABC transporter related  52.63 
 
 		 246 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.209111  normal  0.482435 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4373  ABC transporter related  50.56 
 
 		 264 aa  256  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  53.16 
 
 		 240 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>