More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2546 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2546  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587605  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1569  ABC transporter related  83 
 
 		 261 aa  428  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0184  ATPase  76.08 
 
 		 255 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1760  ABC transporter related  70.8 
 
 		 252 aa  344  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3901  ABC transporter related  65.75 
 
 		 255 aa  343  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.292154  normal  0.145575 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0807  ABC transporter related  68.11 
 
 		 257 aa  342  5e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  54.8 
 
 		 255 aa  287  1e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1365  ABC transporter-related protein  55.38 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.886307  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1658  ABC transporter related  57.02 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1436  hypothetical protein  53.09 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18750  ABC transporter related  52.24 
 
 		 250 aa  265  8e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000378719  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0029  ABC transporter related  52.78 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  53.88 
 
 		 245 aa  259  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  55.27 
 
 		 250 aa  255  5e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0123  ABC transporter related protein  52.78 
 
 		 265 aa  254  9e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.72 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  47.52 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  50.81 
 
 		 252 aa  251  5.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1806  ABC transporter related  52.63 
 
 		 248 aa  251  7e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  49.58 
 
 		 240 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  55.11 
 
 		 246 aa  250  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  50.62 
 
 		 244 aa  249  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  53.88 
 
 		 248 aa  248  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  50.79 
 
 		 260 aa  248  8e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  54.03 
 
 		 250 aa  248  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  53.57 
 
 		 243 aa  247  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  47.13 
 
 		 244 aa  247  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  46.67 
 
 		 240 aa  246  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  50 
 
 		 247 aa  246  4e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.25 
 
 		 240 aa  245  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  50.8 
 
 		 257 aa  245  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  50.82 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  50.82 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  50.2 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  49.41 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  47.81 
 
 		 257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  52.65 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  48.18 
 
 		 252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  48.33 
 
 		 360 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 		 244 aa  243  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  49.58 
 
 		 252 aa  242  3e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  48.82 
 
 		 263 aa  242  5e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  50 
 
 		 245 aa  241  6e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 		 244 aa  241  7e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  50.8 
 
 		 253 aa  241  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  49.59 
 
 		 256 aa  241  7e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.5 
 
 		 240 aa  241  9e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  48.78 
 
 		 260 aa  241  9e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  46.5 
 
 		 244 aa  241  9e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.5 
 
 		 244 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1445  ABC transporter related  47.11 
 
 		 249 aa  241  1e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.124868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  50.42 
 
 		 268 aa  240  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.5 
 
 		 244 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  50 
 
 		 250 aa  240  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  50.63 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  47.58 
 
 		 247 aa  239  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.5 
 
 		 244 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  49.58 
 
 		 242 aa  239  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.5 
 
 		 244 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  50.4 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  51.03 
 
 		 247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  44.81 
 
 		 242 aa  239  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  50.62 
 
 		 242 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  44.81 
 
 		 242 aa  239  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.09 
 
 		 244 aa  238  5e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0153  ABC transporter related  51.64 
 
 		 262 aa  238  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  46.89 
 
 		 246 aa  238  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  48.54 
 
 		 263 aa  238  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  50 
 
 		 244 aa  238  5.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  49.79 
 
 		 244 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  50.59 
 
 		 256 aa  238  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  54.47 
 
 		 262 aa  238  8e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2745  ABC transporter related  51.21 
 
 		 248 aa  238  8e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394872  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  50.81 
 
 		 256 aa  238  9e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  49.58 
 
 		 244 aa  238  9e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3103  ABC transporter related  49.79 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.209111  normal  0.482435 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  46.91 
 
 		 244 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3458  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  49.79 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.98 
 
 		 258 aa  237  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.97 
 
 		 284 aa  237  1e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  50 
 
 		 263 aa  236  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  49.58 
 
 		 244 aa  237  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  49.59 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.72 
 
 		 253 aa  236  3e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4859  ABC transporter related  49.4 
 
 		 266 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.430729 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  51.87 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  51.79 
 
 		 243 aa  235  4e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.09 
 
 		 244 aa  235  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.09 
 
 		 244 aa  235  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  50 
 
 		 254 aa  236  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  49.78 
 
 		 242 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  48.58 
 
 		 247 aa  236  4e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2063  ABC transporter related  48.96 
 
 		 246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0300144  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  46.75 
 
 		 253 aa  235  6e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  48.96 
 
 		 255 aa  234  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  52.08 
 
 		 258 aa  234  7e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  51.67 
 
 		 253 aa  234  8e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 245 aa  234  8e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  50 
 
 		 248 aa  234  8e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1690  ABC transporter related  48.97 
 
 		 243 aa  234  9e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.653327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>