More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3901 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3901  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  525  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.292154  normal  0.145575 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1569  ABC transporter related  65.75 
 
 		 261 aa  345  3e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0184  ATPase  65.61 
 
 		 255 aa  345  5e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2546  ABC transporter related  65.75 
 
 		 255 aa  343  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587605  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0807  ABC transporter related  63.31 
 
 		 257 aa  316  3e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1760  ABC transporter related  60.8 
 
 		 252 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  58.5 
 
 		 255 aa  311  5.999999999999999e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18750  ABC transporter related  57.55 
 
 		 250 aa  296  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000378719  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1436  hypothetical protein  58.65 
 
 		 247 aa  288  7e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1365  ABC transporter-related protein  55.56 
 
 		 251 aa  284  8e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.886307  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  55.33 
 
 		 250 aa  281  9e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  54.03 
 
 		 245 aa  278  6e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1658  ABC transporter related  53.63 
 
 		 254 aa  275  4e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0029  ABC transporter related  52.63 
 
 		 250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0123  ABC transporter related protein  54.07 
 
 		 265 aa  272  3e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  51 
 
 		 256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  53.59 
 
 		 240 aa  269  4e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  50.2 
 
 		 267 aa  266  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1690  ABC transporter related  52.05 
 
 		 243 aa  265  7e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.653327 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  49.6 
 
 		 268 aa  261  8.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  49.37 
 
 		 240 aa  261  8.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  51.84 
 
 		 261 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  49.8 
 
 		 263 aa  260  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1806  ABC transporter related  52.05 
 
 		 248 aa  259  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.76 
 
 		 244 aa  258  4e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  53.09 
 
 		 250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  52.32 
 
 		 244 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  48.21 
 
 		 273 aa  256  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  49.38 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7665  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.8 
 
 		 255 aa  255  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  49.8 
 
 		 252 aa  255  5e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  51.85 
 
 		 252 aa  254  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  50.62 
 
 		 253 aa  254  7e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  51.05 
 
 		 242 aa  254  8e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  49.79 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0238  ABC transporter related  48.77 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  48.96 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  48.21 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  47.26 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  47.52 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0244  ABC transporter related  48.77 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  46.25 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  49 
 
 		 263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  46.37 
 
 		 257 aa  253  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  48.83 
 
 		 260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  48.4 
 
 		 260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  45.42 
 
 		 244 aa  251  5.000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  50.63 
 
 		 242 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  49.4 
 
 		 256 aa  251  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  48.97 
 
 		 245 aa  251  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0249  ATPase  48.13 
 
 		 261 aa  251  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  48.18 
 
 		 258 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  50.21 
 
 		 242 aa  251  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  50.63 
 
 		 242 aa  251  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  47.76 
 
 		 250 aa  249  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  47.33 
 
 		 256 aa  250  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  50.21 
 
 		 242 aa  250  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  49.21 
 
 		 254 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 240 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2606  ABC transporter related  50.2 
 
 		 254 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.0103017 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  49.59 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  48.58 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0153  ABC transporter related  48.95 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  48.79 
 
 		 246 aa  249  3e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  49.38 
 
 		 244 aa  249  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  47.93 
 
 		 246 aa  249  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  48.59 
 
 		 263 aa  249  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.89 
 
 		 245 aa  249  4e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  48.35 
 
 		 244 aa  249  4e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  48.75 
 
 		 241 aa  249  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  49.39 
 
 		 257 aa  249  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 257 aa  249  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  47.6 
 
 		 263 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  46.56 
 
 		 247 aa  248  5e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.42 
 
 		 240 aa  248  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.42 
 
 		 240 aa  248  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.42 
 
 		 240 aa  248  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  49.59 
 
 		 286 aa  248  5e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.42 
 
 		 240 aa  248  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  49.38 
 
 		 244 aa  248  5e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  48.96 
 
 		 254 aa  248  5e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.1 
 
 		 240 aa  248  5e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  47.41 
 
 		 259 aa  248  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  48.96 
 
 		 254 aa  248  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.52 
 
 		 240 aa  248  6e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 240 aa  248  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.52 
 
 		 240 aa  248  6e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  49.19 
 
 		 258 aa  248  6e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  46.74 
 
 		 262 aa  248  6e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.52 
 
 		 240 aa  248  7e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.52 
 
 		 240 aa  248  7e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.42 
 
 		 240 aa  248  7e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.1 
 
 		 241 aa  248  8e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  48.52 
 
 		 240 aa  248  8e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  48.52 
 
 		 240 aa  248  8e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.52 
 
 		 240 aa  248  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  48.1 
 
 		 241 aa  248  8e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  48.1 
 
 		 241 aa  248  8e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6448  ABC transporter related  48.99 
 
 		 263 aa  248  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0465386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>