More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0807 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0807  ABC transporter related  100 
 
 
257 aa  523  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0184  ATPase  71.14 
 
 
255 aa  364  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1569  ABC transporter related  70.08 
 
 
261 aa  361  7.0000000000000005e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2546  ABC transporter related  68.11 
 
 
255 aa  353  2e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587605  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1760  ABC transporter related  67.9 
 
 
252 aa  336  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3901  ABC transporter related  63.31 
 
 
255 aa  325  5e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.292154  normal  0.145575 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1365  ABC transporter-related protein  57.96 
 
 
251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.886307  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  54.77 
 
 
240 aa  270  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1658  ABC transporter related  53.47 
 
 
254 aa  266  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  51.61 
 
 
255 aa  265  5e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1436  hypothetical protein  51.44 
 
 
247 aa  263  2e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
244 aa  263  3e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0123  ABC transporter related protein  53.66 
 
 
265 aa  262  4e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18750  ABC transporter related  52.67 
 
 
250 aa  260  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000378719  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  51.65 
 
 
244 aa  258  7e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0029  ABC transporter related  54.17 
 
 
250 aa  256  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957294  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  52.42 
 
 
257 aa  256  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  52.8 
 
 
250 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  50.41 
 
 
252 aa  252  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  49.79 
 
 
245 aa  250  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  52.07 
 
 
244 aa  250  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  48.96 
 
 
240 aa  250  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  51.87 
 
 
240 aa  249  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  49.39 
 
 
252 aa  249  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  48.97 
 
 
242 aa  249  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  50.41 
 
 
262 aa  249  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  49.8 
 
 
257 aa  249  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.55 
 
 
240 aa  249  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  51.04 
 
 
250 aa  249  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  52.07 
 
 
242 aa  249  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  47.72 
 
 
244 aa  248  5e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  49.81 
 
 
261 aa  248  6e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  49.8 
 
 
267 aa  248  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  51.04 
 
 
244 aa  248  9e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  51 
 
 
254 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  55.95 
 
 
246 aa  247  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  49.02 
 
 
256 aa  246  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  50 
 
 
245 aa  246  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  48.24 
 
 
260 aa  245  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  51.04 
 
 
244 aa  245  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1298  ABC transporter component  50.59 
 
 
263 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.943578  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  49.6 
 
 
250 aa  245  6e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  48.13 
 
 
244 aa  244  6.999999999999999e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  48.76 
 
 
242 aa  244  8e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3286  ABC transporter related protein  51.65 
 
 
280 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00174942  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 
240 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 
240 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  49.79 
 
 
240 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  49.79 
 
 
240 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  49.39 
 
 
243 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 
240 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  49.79 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 
240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  48.98 
 
 
247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1806  ABC transporter related  50.83 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  49.41 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  48.21 
 
 
268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  51.48 
 
 
240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.04 
 
 
257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 
240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  49.79 
 
 
240 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.38 
 
 
240 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  48.4 
 
 
251 aa  242  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  48.13 
 
 
244 aa  242  5e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  47.64 
 
 
260 aa  242  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  48.02 
 
 
263 aa  241  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  47.52 
 
 
242 aa  241  6e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 
284 aa  241  7.999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  49.59 
 
 
241 aa  241  9e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6680  ABC transporter related  49.8 
 
 
250 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  50.81 
 
 
251 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  49.4 
 
 
257 aa  240  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 
261 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 
240 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.96 
 
 
240 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1011  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  50.21 
 
 
250 aa  241  1e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.648524  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  48.97 
 
 
258 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  47.54 
 
 
286 aa  241  1e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  47.72 
 
 
245 aa  241  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  48.8 
 
 
248 aa  240  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  48 
 
 
252 aa  239  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  48.8 
 
 
248 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  51.04 
 
 
240 aa  240  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  46.96 
 
 
253 aa  239  2e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  49.18 
 
 
244 aa  239  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  49 
 
 
259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  48.96 
 
 
241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  48.56 
 
 
241 aa  239  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.96 
 
 
253 aa  239  4e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  48.96 
 
 
265 aa  239  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  47.72 
 
 
240 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  50.62 
 
 
239 aa  238  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  48.37 
 
 
246 aa  238  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3107  ABC transporter related  51.9 
 
 
245 aa  238  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  51.67 
 
 
243 aa  238  5e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  45.04 
 
 
242 aa  238  5.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  45.04 
 
 
242 aa  238  5.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  51.67 
 
 
248 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  48.56 
 
 
270 aa  238  8e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  46.91 
 
 
248 aa  238  8e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>