More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0917 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0917  ABC transporter related  100 
 
 		 240 aa  488  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.834023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  66.24 
 
 		 260 aa  322  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  66.24 
 
 		 266 aa  318  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  66.67 
 
 		 258 aa  317  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  66.67 
 
 		 258 aa  317  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2258  ABC transporter related  64.56 
 
 		 286 aa  315  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21556  normal  0.633697 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4174  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.67 
 
 		 244 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481199  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  61.92 
 
 		 244 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4441  ABC transporter related  65.13 
 
 		 255 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4538  ABC transporter-like  61.25 
 
 		 244 aa  310  9e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.247485  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07290  amino acid ABC transporter, ATP binding component  63.9 
 
 		 244 aa  310  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.175528  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1547  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.25 
 
 		 241 aa  310  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46950  putative ATP-binding component of ABC transporter  62.08 
 
 		 244 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.832772  hitchhiker  0.00625095 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4046  ABC transporter ATP-binding protein  62.08 
 
 		 244 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0337  ABC transporter related  62.87 
 
 		 272 aa  308  4e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5607  ABC transporter related  64.02 
 
 		 244 aa  307  9e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0306  ABC glutamate/aspartate transporter, inner membrane subunit GltL  62.87 
 
 		 272 aa  307  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1563  ABC transporter related  63.03 
 
 		 242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0142744  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0719  ABC transporter related  63.18 
 
 		 244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.649778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0834  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  63.14 
 
 		 249 aa  305  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0446  putative polar amino acid transport system ATP-binding protein  60.42 
 
 		 244 aa  305  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3583  ABC transporter related  62.03 
 
 		 241 aa  304  9.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161673  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0679  ABC transporter related  62.87 
 
 		 288 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2090  ABC transporter component  63.87 
 
 		 247 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.810567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2005  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.56 
 
 		 241 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545359  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2136  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.56 
 
 		 241 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3005  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.56 
 
 		 241 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2609  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.56 
 
 		 241 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0775  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.56 
 
 		 241 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0460  ABC transporter related  61.09 
 
 		 244 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0402  ABC transporter-related protein  61.09 
 
 		 244 aa  299  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4070  ABC transporter-related protein  59.58 
 
 		 245 aa  299  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6962  ABC transporter related  61.76 
 
 		 241 aa  297  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4373  ABC transporter related  62.61 
 
 		 264 aa  296  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  60.08 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1100  ABC transporter related  60.5 
 
 		 241 aa  295  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0591  ABC transporter related  59.34 
 
 		 245 aa  295  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0612  ABC transporter related  59.34 
 
 		 245 aa  295  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1367  ABC transporter related  59.34 
 
 		 245 aa  295  5e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.769758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1097  ABC transporter related  61.92 
 
 		 244 aa  294  9e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  57.98 
 
 		 242 aa  294  9e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1109  ABC transporter related  61.92 
 
 		 244 aa  293  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.458635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4344  ABC transporter related  61.51 
 
 		 244 aa  293  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.379687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0593  ABC transporter related  60.08 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.180749  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  58.05 
 
 		 242 aa  293  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0567  ABC transporter related  60.08 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0987  ABC transporter related  60.42 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1068  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.09 
 
 		 256 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0655  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  58.16 
 
 		 244 aa  291  9e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205588  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0688  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  58.16 
 
 		 244 aa  291  9e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000562177  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  59.49 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4250  ABC transporter related  62.71 
 
 		 257 aa  289  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682054  normal  0.0122802 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4774  ABC transporter related  62.71 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  59.49 
 
 		 245 aa  288  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  58.4 
 
 		 247 aa  287  9e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.98 
 
 		 252 aa  286  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  56.9 
 
 		 243 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4021  ABC transporter-related protein  57.32 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000248641 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1216  ABC transporter related  58.92 
 
 		 245 aa  286  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0484  putative glutamate/aspartate transport ATP-binding ABC transporter protein  60.83 
 
 		 244 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1179  ABC transporter related  62.03 
 
 		 241 aa  285  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0654977 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  57.56 
 
 		 249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2685  ABC transporter-related protein  57.32 
 
 		 244 aa  286  2.9999999999999996e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.480561 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3058  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.56 
 
 		 241 aa  285  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1189  ABC transporter related  61.76 
 
 		 241 aa  285  5.999999999999999e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703067  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3142  ABC transporter related protein  61.76 
 
 		 241 aa  285  5.999999999999999e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  56.78 
 
 		 242 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2956  ABC transporter related  61.76 
 
 		 241 aa  284  7e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0360  ABC transporter related  60.25 
 
 		 244 aa  284  7e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0375  ABC transporter related  60.25 
 
 		 244 aa  284  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  55.93 
 
 		 242 aa  284  8e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.56 
 
 		 252 aa  284  8e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.56 
 
 		 252 aa  284  8e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0815  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  60.92 
 
 		 241 aa  284  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0766  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  60.92 
 
 		 241 aa  284  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0705  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  60.92 
 
 		 241 aa  284  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0779  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  60.92 
 
 		 241 aa  284  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1211  ABC transporter-related protein  61.76 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22901  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2260  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  57.98 
 
 		 249 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal  0.463936 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5479  ABC transporter related  61.02 
 
 		 242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  55.7 
 
 		 242 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  57.14 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  57.14 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  56.96 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  57.14 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  57.32 
 
 		 243 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  59.41 
 
 		 254 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  57.38 
 
 		 253 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0831  ABC transporter related  57.5 
 
 		 249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2974  ABC transporter related protein  61.34 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0673  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  61.34 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  58.47 
 
 		 245 aa  282  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0744  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  61.34 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  57.14 
 
 		 249 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0680  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  61.34 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0697  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  61.34 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2993  ABC transporter related  61.34 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>