More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0292 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0292  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
510 aa  1018    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429579  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6505  ABC transporter permease/ATP-binding protein  56.36 
 
 
536 aa  534  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5151  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.9 
 
 
543 aa  532  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.406316  normal  0.927008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0599  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  44.44 
 
 
567 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.106218 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5145  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.68 
 
 
567 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.900628 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1640  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.34 
 
 
559 aa  385  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.588143  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.38 
 
 
533 aa  326  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.429641  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0868  amino acid ABC transporter permease  40.38 
 
 
532 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0885  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.19 
 
 
533 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.19 
 
 
595 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.73 
 
 
595 aa  306  7e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.88 
 
 
592 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  40.43 
 
 
598 aa  303  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.52 
 
 
594 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.38 
 
 
619 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3313  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.97 
 
 
502 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571004  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.03 
 
 
597 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.77 
 
 
594 aa  300  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  39.03 
 
 
597 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.03 
 
 
597 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1311  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.37 
 
 
512 aa  296  4e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00935602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.03 
 
 
506 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.4 
 
 
581 aa  295  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2799  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.51 
 
 
510 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.13 
 
 
602 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3989  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.45 
 
 
500 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.228194  normal  0.451936 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4453  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.33 
 
 
500 aa  280  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177151  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0873  ABC transporter related protein  56.96 
 
 
240 aa  273  7e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.81 
 
 
502 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4083  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.25 
 
 
500 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.36 
 
 
516 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.09 
 
 
510 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  53.47 
 
 
256 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  53.2 
 
 
254 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  53.01 
 
 
256 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  51.37 
 
 
256 aa  251  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 
244 aa  250  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 
244 aa  249  8e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 
244 aa  249  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5550  glutamine ABC transporter  35.32 
 
 
507 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  48.8 
 
 
244 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 
244 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 
244 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 
244 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 
244 aa  248  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  53.97 
 
 
261 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  49.19 
 
 
253 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48 
 
 
244 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48 
 
 
244 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  50 
 
 
265 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  49.19 
 
 
253 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  49.6 
 
 
246 aa  244  3e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  49.02 
 
 
255 aa  243  5e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  53.72 
 
 
260 aa  243  7e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  51.82 
 
 
260 aa  243  7e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  52.42 
 
 
257 aa  243  7.999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  53.44 
 
 
267 aa  243  9e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  52.76 
 
 
258 aa  242  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  48 
 
 
244 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  52.03 
 
 
243 aa  242  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  53.31 
 
 
260 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  54.3 
 
 
256 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.78 
 
 
261 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0404  ABC transporter related  52.59 
 
 
272 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.59 
 
 
260 aa  241  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  51.67 
 
 
254 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  52.42 
 
 
254 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  47.3 
 
 
286 aa  241  2.9999999999999997e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2965  ABC transporter  50 
 
 
265 aa  240  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0568085  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  52.78 
 
 
268 aa  240  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  50.75 
 
 
274 aa  239  6.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.38 
 
 
254 aa  239  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  53.44 
 
 
264 aa  239  9e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  51.19 
 
 
246 aa  239  9e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2086  ABC transporter related  52.38 
 
 
257 aa  239  9e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  48.92 
 
 
279 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3089  ABC transporter-like  48.28 
 
 
265 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280473  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  54.33 
 
 
272 aa  239  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  50.81 
 
 
243 aa  239  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  52.48 
 
 
250 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  50.81 
 
 
252 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1184  ABC transporter-related protein  51.57 
 
 
275 aa  238  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.26 
 
 
273 aa  238  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  52.53 
 
 
274 aa  238  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2494  ABC transporter related protein  51.78 
 
 
274 aa  238  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  52.48 
 
 
250 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.18 
 
 
245 aa  238  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  46.18 
 
 
245 aa  237  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  52 
 
 
267 aa  237  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  52.48 
 
 
254 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  52.42 
 
 
267 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  50.41 
 
 
244 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  48.81 
 
 
244 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  52.03 
 
 
243 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  51.82 
 
 
263 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  51.41 
 
 
253 aa  235  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2649  ABC transporter related  50.81 
 
 
260 aa  234  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  47.39 
 
 
247 aa  234  3e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  50 
 
 
259 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  47.58 
 
 
263 aa  234  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>