More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0868 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0868  amino acid ABC transporter permease  100 
 
 		 532 aa  1063    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  99.44 
 
 		 533 aa  1058    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.429641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0885  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  99.81 
 
 		 533 aa  1061    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1640  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.04 
 
 		 559 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.588143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0599  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  45.94 
 
 		 567 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.106218 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5145  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.07 
 
 		 567 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.900628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0292  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.2 
 
 		 510 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6505  ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.24 
 
 		 536 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5151  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41 
 
 		 543 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.406316  normal  0.927008 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.29 
 
 		 597 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  38.11 
 
 		 597 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.11 
 
 		 597 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.94 
 
 		 592 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.72 
 
 		 619 aa  298  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.98 
 
 		 594 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.28 
 
 		 595 aa  296  7e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.86 
 
 		 602 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.64 
 
 		 594 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.16 
 
 		 595 aa  292  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  38.74 
 
 		 598 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4453  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.09 
 
 		 500 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3989  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.39 
 
 		 500 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.228194  normal  0.451936 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.72 
 
 		 636 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.72 
 
 		 636 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  38.72 
 
 		 636 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  38.72 
 
 		 636 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.79 
 
 		 636 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  38.72 
 
 		 636 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.53 
 
 		 636 aa  280  7e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.04 
 
 		 506 aa  277  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.95 
 
 		 510 aa  277  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.68 
 
 		 581 aa  276  6e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3313  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.38 
 
 		 502 aa  271  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571004  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5550  glutamine ABC transporter  35.21 
 
 		 507 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.67 
 
 		 516 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2799  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.87 
 
 		 510 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1311  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.66 
 
 		 512 aa  267  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00935602 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  54.18 
 
 		 260 aa  260  5.0000000000000005e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.58 
 
 		 502 aa  258  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  51.23 
 
 		 256 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  54.17 
 
 		 243 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  50.82 
 
 		 248 aa  252  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.46 
 
 		 240 aa  251  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  50.61 
 
 		 244 aa  250  5e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  53.09 
 
 		 265 aa  250  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  54.03 
 
 		 257 aa  249  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  52.46 
 
 		 243 aa  247  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  52.05 
 
 		 243 aa  247  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  48.61 
 
 		 263 aa  246  6e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  52.65 
 
 		 244 aa  246  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  51 
 
 		 259 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.77 
 
 		 240 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  47.95 
 
 		 242 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4842  ABC transporter related  53.82 
 
 		 265 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463147  normal  0.18459 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6799  ABC transporter related  53.82 
 
 		 265 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.557054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4287  ABC transporter related  53.82 
 
 		 265 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  53.41 
 
 		 245 aa  244  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3697  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.11 
 
 		 242 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270266  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.18 
 
 		 240 aa  243  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.18 
 
 		 240 aa  243  5e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  51.43 
 
 		 246 aa  243  5e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  49.6 
 
 		 246 aa  243  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  52.05 
 
 		 240 aa  243  6e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.36 
 
 		 273 aa  243  6e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  49.59 
 
 		 240 aa  243  7e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.36 
 
 		 240 aa  243  7e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.82 
 
 		 257 aa  243  7.999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2781  ABC transporter related  49.8 
 
 		 256 aa  242  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.4 
 
 		 258 aa  241  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  48.77 
 
 		 240 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  48.77 
 
 		 240 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.77 
 
 		 240 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  50.81 
 
 		 249 aa  241  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2834  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  49.6 
 
 		 268 aa  241  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  47.95 
 
 		 242 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  48.77 
 
 		 247 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  49.8 
 
 		 252 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  52.05 
 
 		 243 aa  240  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.36 
 
 		 240 aa  240  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.36 
 
 		 240 aa  240  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  50.78 
 
 		 257 aa  239  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  50.82 
 
 		 258 aa  239  5.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  51.6 
 
 		 259 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  53.05 
 
 		 262 aa  239  6.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  48.61 
 
 		 263 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12291  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  47.54 
 
 		 246 aa  239  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.782206  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  49.22 
 
 		 256 aa  239  8e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  50 
 
 		 248 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  52.53 
 
 		 256 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  50.81 
 
 		 269 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  49.59 
 
 		 240 aa  238  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  50 
 
 		 251 aa  238  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  51.23 
 
 		 243 aa  238  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  50 
 
 		 244 aa  238  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  48.16 
 
 		 242 aa  238  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  47.13 
 
 		 242 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2303  ABC transporter related protein  48.36 
 
 		 246 aa  238  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000265903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  48.16 
 
 		 242 aa  238  3e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  48.58 
 
 		 255 aa  237  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  50 
 
 		 244 aa  237  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>