More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2799 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_2799  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
510 aa  1032    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.38 
 
 
506 aa  606  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1311  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.92 
 
 
512 aa  582  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00935602 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4453  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.32 
 
 
500 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177151  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3989  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.93 
 
 
500 aa  571  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.228194  normal  0.451936 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4083  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.89 
 
 
500 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3313  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.84 
 
 
502 aa  548  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571004  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0599  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.01 
 
 
567 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.106218 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5145  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.56 
 
 
567 aa  295  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.900628 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.38 
 
 
581 aa  293  4e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.04 
 
 
592 aa  293  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.16 
 
 
636 aa  293  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  38.26 
 
 
598 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.84 
 
 
595 aa  291  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  35.98 
 
 
636 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.67 
 
 
595 aa  290  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.2 
 
 
602 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1640  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.78 
 
 
559 aa  286  8e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.588143  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.66 
 
 
594 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.65 
 
 
619 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.44 
 
 
597 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.16 
 
 
636 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.16 
 
 
636 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  36.16 
 
 
636 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  36.16 
 
 
636 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.91 
 
 
594 aa  280  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0292  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.65 
 
 
510 aa  279  9e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429579  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.16 
 
 
636 aa  279  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  39.56 
 
 
597 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.56 
 
 
597 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.71 
 
 
502 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5550  glutamine ABC transporter  38.91 
 
 
507 aa  270  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.05 
 
 
516 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6505  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.99 
 
 
536 aa  266  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.28 
 
 
510 aa  264  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5151  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.45 
 
 
543 aa  262  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.406316  normal  0.927008 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.59 
 
 
533 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.429641  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0885  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.32 
 
 
533 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0868  amino acid ABC transporter permease  37.32 
 
 
532 aa  253  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  52.65 
 
 
244 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  54.47 
 
 
252 aa  243  9e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3973  ABC transporter related  50 
 
 
282 aa  240  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  51.38 
 
 
246 aa  240  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12101  ABC transporter for amino acids, ATP binding component  53.22 
 
 
246 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  48.78 
 
 
263 aa  236  8e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  53.19 
 
 
246 aa  235  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0850  ATPase  53.02 
 
 
246 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.736744  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  53.28 
 
 
246 aa  234  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  49.8 
 
 
278 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1806  ATPase  49.4 
 
 
247 aa  233  5e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.842088 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  51.1 
 
 
248 aa  233  5e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  52.16 
 
 
258 aa  233  6e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  54.02 
 
 
243 aa  233  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  50.6 
 
 
253 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  49.61 
 
 
243 aa  233  7.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  51.8 
 
 
262 aa  233  8.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.65 
 
 
240 aa  232  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  49.6 
 
 
242 aa  232  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.83 
 
 
269 aa  232  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0238  ABC transporter related  50.2 
 
 
250 aa  232  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  50.66 
 
 
248 aa  232  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0244  ABC transporter related  50.2 
 
 
250 aa  232  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  51.27 
 
 
249 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  50.63 
 
 
245 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  53.1 
 
 
244 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  52.21 
 
 
239 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  50.85 
 
 
249 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  55.61 
 
 
243 aa  231  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  48.39 
 
 
263 aa  231  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  50 
 
 
241 aa  231  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  51.77 
 
 
255 aa  231  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  50 
 
 
241 aa  231  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  51.52 
 
 
240 aa  230  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  51.97 
 
 
249 aa  230  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  51.07 
 
 
268 aa  230  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  52.38 
 
 
273 aa  230  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  50.6 
 
 
273 aa  230  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  47.76 
 
 
242 aa  230  5e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  51.02 
 
 
268 aa  230  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
241 aa  230  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  52.4 
 
 
243 aa  229  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  48.95 
 
 
258 aa  230  6e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  51.79 
 
 
242 aa  229  7e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  48.78 
 
 
243 aa  229  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  50 
 
 
242 aa  229  7e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  48.78 
 
 
262 aa  229  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  48.75 
 
 
242 aa  229  9e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  49.18 
 
 
243 aa  229  9e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  49.56 
 
 
241 aa  229  9e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  50.83 
 
 
240 aa  229  9e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 
249 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0595  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.11 
 
 
259 aa  229  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.062853  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  48.78 
 
 
262 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  51.3 
 
 
248 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  49.19 
 
 
269 aa  229  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  48.35 
 
 
260 aa  229  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  52.21 
 
 
247 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 
240 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  51.3 
 
 
248 aa  229  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  53.33 
 
 
250 aa  229  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>