More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1806 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1806  ATPase  100 
 
 
247 aa  499  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.842088 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0850  ATPase  91.84 
 
 
246 aa  456  1e-127  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.736744  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12101  ABC transporter for amino acids, ATP binding component  78.78 
 
 
246 aa  387  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14241  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  71.97 
 
 
248 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0611  ATPase  70.2 
 
 
248 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.355376  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14761  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  70.25 
 
 
248 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0558262 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1165  ATPase  65.45 
 
 
246 aa  343  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12291  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  65.04 
 
 
246 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.782206  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  61.48 
 
 
247 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  63.49 
 
 
252 aa  314  8e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  63.52 
 
 
246 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  61.07 
 
 
247 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2001  ABC transporter related  61.48 
 
 
258 aa  309  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0985  ABC transporter related  61 
 
 
247 aa  307  8e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.178128 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  61.89 
 
 
246 aa  306  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  60.85 
 
 
249 aa  300  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.38 
 
 
253 aa  289  3e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  58.78 
 
 
245 aa  289  4e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.13 
 
 
284 aa  288  7e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  56.79 
 
 
253 aa  287  9e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  60.17 
 
 
253 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  58.02 
 
 
263 aa  285  4e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  56.85 
 
 
246 aa  285  4e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4395  ABC transporter related  59.84 
 
 
243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0223537  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  56.85 
 
 
243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.96 
 
 
269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  57.79 
 
 
255 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.96 
 
 
249 aa  282  4.0000000000000003e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  58.06 
 
 
251 aa  281  5.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  58.51 
 
 
250 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  56.85 
 
 
243 aa  280  2e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  56.68 
 
 
245 aa  280  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  57.26 
 
 
243 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.85 
 
 
240 aa  279  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  57.38 
 
 
244 aa  279  4e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  57.14 
 
 
269 aa  278  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  54.32 
 
 
254 aa  278  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  56.73 
 
 
258 aa  278  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  56.73 
 
 
258 aa  278  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  54.04 
 
 
248 aa  278  6e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  55.74 
 
 
242 aa  278  7e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  57.87 
 
 
259 aa  277  9e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  59.15 
 
 
251 aa  277  9e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  56.43 
 
 
243 aa  277  9e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  54.73 
 
 
249 aa  277  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  56.43 
 
 
243 aa  277  1e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  56.02 
 
 
243 aa  276  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  59.91 
 
 
252 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  58.51 
 
 
251 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  56.85 
 
 
248 aa  276  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  57.02 
 
 
242 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  58.72 
 
 
262 aa  276  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  57.87 
 
 
242 aa  276  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  56.38 
 
 
263 aa  276  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7665  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.08 
 
 
255 aa  275  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  57.26 
 
 
242 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  56.33 
 
 
258 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  56.79 
 
 
243 aa  275  4e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  56.43 
 
 
248 aa  275  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  58.85 
 
 
250 aa  275  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0358  ABC transporter related  56.38 
 
 
252 aa  275  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  57.45 
 
 
242 aa  275  6e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  58.3 
 
 
247 aa  275  7e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  54.77 
 
 
240 aa  275  7e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  54.32 
 
 
249 aa  275  7e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  57.02 
 
 
255 aa  274  8e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  56.91 
 
 
251 aa  274  8e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  57.02 
 
 
257 aa  274  8e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  55.97 
 
 
262 aa  274  9e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0443  ABC transporter related  56.15 
 
 
244 aa  274  9e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  55.97 
 
 
262 aa  274  9e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  54.89 
 
 
242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  58.62 
 
 
256 aa  273  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0249  ATPase  57.68 
 
 
261 aa  273  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  51 
 
 
263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  55.56 
 
 
258 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  57.81 
 
 
273 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  54.04 
 
 
242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  56.43 
 
 
248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  57.63 
 
 
253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4002  ABC transporter related  61 
 
 
253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410109  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  55.97 
 
 
252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3584  ABC transporter related  57.26 
 
 
255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal  0.0302261 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  53.5 
 
 
254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3694  ABC transporter related  56.02 
 
 
248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.749012  normal  0.245017 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  55.83 
 
 
259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0299  ABC transporter-related protein  56.56 
 
 
252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  53.53 
 
 
240 aa  272  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  55.74 
 
 
244 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  58.47 
 
 
254 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  55.1 
 
 
267 aa  272  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  53.91 
 
 
244 aa  272  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  55.92 
 
 
267 aa  273  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  55.1 
 
 
257 aa  272  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  58.72 
 
 
248 aa  273  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2622  ABC transporter related  59.24 
 
 
241 aa  272  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0238  ABC transporter related  55.56 
 
 
250 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  58.51 
 
 
258 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  58.47 
 
 
254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  58.47 
 
 
254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.329357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>