More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1165 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1165  ATPase  100 
 
 
246 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12291  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  95.53 
 
 
246 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.782206  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0611  ATPase  82.52 
 
 
248 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.355376  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14241  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  82.52 
 
 
248 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14761  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  69.83 
 
 
248 aa  352  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0558262 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12101  ABC transporter for amino acids, ATP binding component  68.16 
 
 
246 aa  351  8e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0850  ATPase  66.12 
 
 
246 aa  347  1e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.736744  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1806  ATPase  65.45 
 
 
247 aa  343  1e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.842088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0985  ABC transporter related  59.26 
 
 
247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.178128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  58.68 
 
 
246 aa  295  5e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  57.61 
 
 
247 aa  292  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  57.61 
 
 
247 aa  291  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  56.79 
 
 
246 aa  290  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2001  ABC transporter related  56.43 
 
 
258 aa  283  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  55.79 
 
 
249 aa  279  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  53.2 
 
 
252 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  57.81 
 
 
258 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  57.81 
 
 
258 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  54.1 
 
 
252 aa  275  4e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  56.56 
 
 
248 aa  275  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  55.88 
 
 
243 aa  274  9e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  55.46 
 
 
243 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  56.15 
 
 
248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  57.33 
 
 
258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  54.13 
 
 
252 aa  272  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.54 
 
 
269 aa  271  6e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  52.23 
 
 
259 aa  271  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  54.13 
 
 
245 aa  271  6e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.31 
 
 
240 aa  271  9e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  54.55 
 
 
245 aa  271  9e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.54 
 
 
249 aa  270  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  57.78 
 
 
268 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  54.74 
 
 
242 aa  269  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  54.13 
 
 
253 aa  269  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  54.32 
 
 
253 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  52.65 
 
 
251 aa  269  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  55.7 
 
 
269 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  55.6 
 
 
242 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  54.13 
 
 
253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  53.72 
 
 
273 aa  268  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 
284 aa  268  5e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  52.89 
 
 
247 aa  268  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  53.72 
 
 
244 aa  268  5.9999999999999995e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  57.78 
 
 
263 aa  268  7e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  55.7 
 
 
263 aa  268  7e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  55.7 
 
 
257 aa  268  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  53.53 
 
 
273 aa  267  8.999999999999999e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  55.7 
 
 
257 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0249  ATPase  52.48 
 
 
261 aa  267  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.89 
 
 
252 aa  267  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  54.51 
 
 
252 aa  267  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  55.27 
 
 
266 aa  267  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  57.33 
 
 
267 aa  267  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  53.72 
 
 
253 aa  267  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  53.72 
 
 
259 aa  267  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  53.47 
 
 
244 aa  266  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  54.1 
 
 
243 aa  266  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.89 
 
 
252 aa  266  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  53.28 
 
 
246 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.31 
 
 
252 aa  266  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.89 
 
 
252 aa  266  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.69 
 
 
253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  54.13 
 
 
253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  59.11 
 
 
244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  56.89 
 
 
256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  57.27 
 
 
243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  52.48 
 
 
252 aa  265  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  52.48 
 
 
252 aa  265  4e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.48 
 
 
252 aa  265  4e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  55.51 
 
 
250 aa  265  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  53.91 
 
 
255 aa  265  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  57.4 
 
 
242 aa  265  4e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  52.48 
 
 
252 aa  265  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  52.48 
 
 
252 aa  265  4e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  58.67 
 
 
262 aa  265  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  58.67 
 
 
262 aa  265  5e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  52.87 
 
 
245 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  53.88 
 
 
246 aa  265  5e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  52.87 
 
 
244 aa  265  5.999999999999999e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1100  ABC transporter related  54.81 
 
 
241 aa  265  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  57.27 
 
 
243 aa  265  7e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05950  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.96 
 
 
247 aa  264  8e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  54.62 
 
 
243 aa  264  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0204  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.69 
 
 
239 aa  264  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.701946  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0834  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  53.72 
 
 
249 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  57.02 
 
 
243 aa  264  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  55.46 
 
 
254 aa  263  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0299  ABC transporter-related protein  51.64 
 
 
252 aa  263  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  53.28 
 
 
253 aa  263  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  57.52 
 
 
262 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  52.87 
 
 
246 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4395  ABC transporter related  52.65 
 
 
243 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0223537  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1702  ABC transporter related  54.87 
 
 
253 aa  263  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.478201 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  52.89 
 
 
248 aa  263  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  52.87 
 
 
246 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  52.67 
 
 
255 aa  262  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  55.08 
 
 
258 aa  262  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  51.23 
 
 
262 aa  262  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1547  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.48 
 
 
241 aa  261  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1179  ABC transporter related  55.79 
 
 
241 aa  261  6e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0654977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>