More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0611 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0611  ATPase  100 
 
 		 248 aa  508  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.355376  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14241  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  98.39 
 
 		 248 aa  504  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1165  ATPase  82.52 
 
 		 246 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12291  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  80.89 
 
 		 246 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.782206  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14761  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  72.95 
 
 		 248 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0558262 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0850  ATPase  71.97 
 
 		 246 aa  372  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.736744  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1806  ATPase  70.2 
 
 		 247 aa  369  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.842088 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12101  ABC transporter for amino acids, ATP binding component  69.8 
 
 		 246 aa  353  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  60.74 
 
 		 246 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0985  ABC transporter related  58.2 
 
 		 247 aa  307  9e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.178128 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  58.44 
 
 		 246 aa  304  9.000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  58.44 
 
 		 247 aa  303  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  58.44 
 
 		 247 aa  303  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2001  ABC transporter related  56.85 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  55.74 
 
 		 249 aa  288  6e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0249  ATPase  54.92 
 
 		 261 aa  283  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  54.92 
 
 		 252 aa  283  1.0000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  54.29 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  55.6 
 
 		 242 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  54.1 
 
 		 253 aa  280  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  54.1 
 
 		 253 aa  281  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  55.14 
 
 		 255 aa  279  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4395  ABC transporter related  55.51 
 
 		 243 aa  279  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0223537  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  55.46 
 
 		 243 aa  278  4e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  53.88 
 
 		 242 aa  278  7e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.1 
 
 		 284 aa  277  9e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  57.14 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.28 
 
 		 253 aa  276  2e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  54.92 
 
 		 245 aa  276  2e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  55.04 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  53.31 
 
 		 253 aa  276  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  53.31 
 
 		 253 aa  275  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  53.31 
 
 		 253 aa  275  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.37 
 
 		 240 aa  275  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  55.6 
 
 		 258 aa  275  6e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  53.69 
 
 		 252 aa  275  6e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  56.38 
 
 		 248 aa  275  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  56.38 
 
 		 248 aa  274  8e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  53.31 
 
 		 253 aa  274  9e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  56.43 
 
 		 254 aa  274  9e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  54.85 
 
 		 258 aa  273  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  53.69 
 
 		 248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  52.89 
 
 		 248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  54.85 
 
 		 258 aa  273  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  52.57 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  53.69 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0299  ABC transporter-related protein  53.91 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  54.62 
 
 		 242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  51.64 
 
 		 252 aa  273  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.43 
 
 		 269 aa  272  4.0000000000000004e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  54.2 
 
 		 242 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  55.97 
 
 		 248 aa  272  5.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  52 
 
 		 259 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  55.04 
 
 		 243 aa  271  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  53.31 
 
 		 247 aa  271  8.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1547  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.89 
 
 		 241 aa  270  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  52.87 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2005  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.31 
 
 		 241 aa  269  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545359  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.43 
 
 		 249 aa  270  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  53.28 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  54.13 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2136  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.31 
 
 		 241 aa  269  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68203  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  52.05 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1702  ABC transporter related  54.74 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.478201 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  53.09 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2609  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.31 
 
 		 241 aa  269  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  51.85 
 
 		 273 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0775  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.31 
 
 		 241 aa  269  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3005  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.31 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0834  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  55.56 
 
 		 249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  51.2 
 
 		 263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  51.85 
 
 		 273 aa  269  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  52.05 
 
 		 248 aa  268  4e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3583  ABC transporter related  52.89 
 
 		 241 aa  268  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161673  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  53.31 
 
 		 245 aa  268  5e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  54.01 
 
 		 263 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  53.28 
 
 		 251 aa  268  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  54.24 
 
 		 256 aa  268  5.9999999999999995e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0443  ABC transporter related  53.47 
 
 		 244 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  55.1 
 
 		 246 aa  268  8e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  53.88 
 
 		 263 aa  268  8.999999999999999e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  54.69 
 
 		 244 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  53.59 
 
 		 269 aa  268  8.999999999999999e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4002  ABC transporter related  54.1 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  53.69 
 
 		 246 aa  267  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  53.78 
 
 		 242 aa  267  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  53.5 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.24 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1100  ABC transporter related  54.73 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67030  ABC transporter ATP-binding protein  54.69 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  51.64 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  54.1 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.24 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.87 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  54.07 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.65 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  53.28 
 
 		 245 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  51.64 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  54.31 
 
 		 262 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  53.45 
 
 		 268 aa  266  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>