More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_12101 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_12101  ABC transporter for amino acids, ATP binding component  100 
 
 		 246 aa  497  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1806  ATPase  78.78 
 
 		 247 aa  387  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.842088 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0850  ATPase  77.64 
 
 		 246 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.736744  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14761  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  73.03 
 
 		 248 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0558262 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12291  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  68.16 
 
 		 246 aa  355  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.782206  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14241  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  70.2 
 
 		 248 aa  355  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0611  ATPase  69.8 
 
 		 248 aa  353  2e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.355376  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1165  ATPase  68.16 
 
 		 246 aa  351  8e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0985  ABC transporter related  62.3 
 
 		 247 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.178128 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  63.11 
 
 		 247 aa  316  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  63.11 
 
 		 247 aa  316  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  65.29 
 
 		 246 aa  314  6e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2001  ABC transporter related  62.96 
 
 		 258 aa  311  4.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  64.68 
 
 		 249 aa  310  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  62.3 
 
 		 246 aa  308  6.999999999999999e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0249  ATPase  60.74 
 
 		 261 aa  298  8e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4395  ABC transporter related  62.34 
 
 		 243 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0223537  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  59.11 
 
 		 251 aa  291  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  59.92 
 
 		 251 aa  291  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  58.61 
 
 		 246 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.85 
 
 		 269 aa  289  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  58.85 
 
 		 258 aa  288  6e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  58.85 
 
 		 258 aa  288  6e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.85 
 
 		 252 aa  287  9e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.85 
 
 		 252 aa  287  9e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.85 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.85 
 
 		 252 aa  287  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  59.43 
 
 		 252 aa  287  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.43 
 
 		 252 aa  286  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  59.43 
 
 		 253 aa  286  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  59.92 
 
 		 244 aa  286  2.9999999999999996e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  58.02 
 
 		 267 aa  285  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  58.44 
 
 		 258 aa  285  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  56.56 
 
 		 255 aa  285  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  60.49 
 
 		 254 aa  285  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.38 
 
 		 253 aa  285  5e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  57.61 
 
 		 269 aa  285  5.999999999999999e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  60.43 
 
 		 252 aa  284  7e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  60.43 
 
 		 252 aa  284  7e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  60.43 
 
 		 252 aa  284  7e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.43 
 
 		 252 aa  284  7e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  60.43 
 
 		 252 aa  284  7e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  57.85 
 
 		 247 aa  284  9e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  60 
 
 		 253 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  59.58 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.61 
 
 		 284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  59.24 
 
 		 247 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  58.85 
 
 		 268 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  58.68 
 
 		 245 aa  282  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  57.38 
 
 		 253 aa  282  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  57.61 
 
 		 263 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  57.61 
 
 		 256 aa  281  7.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  57.2 
 
 		 263 aa  281  8.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  57.79 
 
 		 252 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  59.57 
 
 		 253 aa  281  8.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  57.02 
 
 		 243 aa  281  9e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  57.43 
 
 		 252 aa  280  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  59.15 
 
 		 267 aa  280  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  56.15 
 
 		 246 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  58.26 
 
 		 244 aa  280  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2622  ABC transporter related  59.18 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  57.2 
 
 		 262 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  58.85 
 
 		 266 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  60.62 
 
 		 273 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  56.56 
 
 		 246 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  58.68 
 
 		 245 aa  280  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  58.72 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  57.2 
 
 		 262 aa  279  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  56.5 
 
 		 242 aa  279  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  59.57 
 
 		 250 aa  279  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  57.2 
 
 		 262 aa  279  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  56.38 
 
 		 257 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  57.61 
 
 		 257 aa  279  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  56.79 
 
 		 257 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  58.75 
 
 		 259 aa  278  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  56.56 
 
 		 253 aa  279  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  59.15 
 
 		 253 aa  278  4e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.85 
 
 		 254 aa  278  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  57.85 
 
 		 254 aa  278  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  57.85 
 
 		 254 aa  278  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0299  ABC transporter-related protein  58.02 
 
 		 252 aa  278  5e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  56.15 
 
 		 246 aa  278  6e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  56.73 
 
 		 244 aa  278  6e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  56.56 
 
 		 245 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  54.13 
 
 		 242 aa  277  9e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  58.61 
 
 		 245 aa  277  9e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  56.38 
 
 		 258 aa  277  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  57.38 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  58.26 
 
 		 242 aa  276  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  54.96 
 
 		 240 aa  276  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  57.44 
 
 		 254 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  56.97 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  55.74 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  55.33 
 
 		 246 aa  276  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  55.93 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  56.15 
 
 		 247 aa  276  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.72 
 
 		 240 aa  275  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  57.63 
 
 		 244 aa  275  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0443  ABC transporter related  56.73 
 
 		 244 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  54.92 
 
 		 262 aa  275  4e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>