More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3989 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4453  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  99.2 
 
 		 500 aa  1001    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3989  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 500 aa  1013    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.228194  normal  0.451936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1311  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.34 
 
 		 512 aa  667    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00935602 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4083  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  91 
 
 		 500 aa  874    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3313  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.68 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571004  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.59 
 
 		 506 aa  589  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2799  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.93 
 
 		 510 aa  567  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.63 
 
 		 592 aa  329  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  41.03 
 
 		 598 aa  327  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.58 
 
 		 595 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  39.19 
 
 		 597 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.19 
 
 		 597 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.19 
 
 		 597 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.92 
 
 		 595 aa  310  5e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.16 
 
 		 581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.53 
 
 		 602 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.25 
 
 		 594 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.45 
 
 		 619 aa  300  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.92 
 
 		 594 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1640  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.76 
 
 		 559 aa  296  4e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.588143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5145  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.22 
 
 		 567 aa  296  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.900628 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  37.5 
 
 		 636 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.5 
 
 		 636 aa  289  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.32 
 
 		 636 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0599  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.58 
 
 		 567 aa  289  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.106218 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.31 
 
 		 510 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.74 
 
 		 516 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 		 502 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0292  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.48 
 
 		 510 aa  278  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5550  glutamine ABC transporter  37.32 
 
 		 507 aa  274  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.61 
 
 		 533 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.429641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0868  amino acid ABC transporter permease  39.02 
 
 		 532 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0885  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.02 
 
 		 533 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5151  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.17 
 
 		 543 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.406316  normal  0.927008 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6505  ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.72 
 
 		 536 aa  257  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  52.67 
 
 		 251 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  52.46 
 
 		 261 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  56.5 
 
 		 242 aa  249  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  50.62 
 
 		 242 aa  243  6e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  49.8 
 
 		 243 aa  243  9e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  51.03 
 
 		 253 aa  242  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  48.86 
 
 		 262 aa  242  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1708  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  50.82 
 
 		 242 aa  240  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.871153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  52.44 
 
 		 270 aa  240  4e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  51.22 
 
 		 256 aa  239  5.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  51.45 
 
 		 248 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  51.85 
 
 		 244 aa  239  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.3 
 
 		 240 aa  238  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  55.04 
 
 		 256 aa  238  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3973  ABC transporter related  49.58 
 
 		 282 aa  238  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  50.4 
 
 		 255 aa  238  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0152  ABC transporter related  48.21 
 
 		 256 aa  237  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0734345  hitchhiker  0.0000445687 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.56 
 
 		 240 aa  236  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1296  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.64 
 
 		 240 aa  236  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.484197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  51.04 
 
 		 251 aa  236  8e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  50.83 
 
 		 244 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  51.01 
 
 		 263 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  49.38 
 
 		 246 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  52.21 
 
 		 247 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  50.62 
 
 		 248 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 		 262 aa  234  3e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  50.41 
 
 		 255 aa  234  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  52.81 
 
 		 252 aa  234  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  47.74 
 
 		 240 aa  234  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  48.13 
 
 		 239 aa  234  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.05 
 
 		 240 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3694  ABC transporter related  52.42 
 
 		 248 aa  234  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.749012  normal  0.245017 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.74 
 
 		 240 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.26 
 
 		 251 aa  233  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  51.87 
 
 		 258 aa  233  5e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  51.45 
 
 		 257 aa  233  5e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  52.91 
 
 		 251 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  50.62 
 
 		 278 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  49.38 
 
 		 252 aa  233  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  49.8 
 
 		 245 aa  232  9e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  51.44 
 
 		 249 aa  232  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  50.62 
 
 		 242 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  54.26 
 
 		 252 aa  232  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  50.62 
 
 		 254 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  55.2 
 
 		 242 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3697  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  50.61 
 
 		 242 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270266  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  47.74 
 
 		 242 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  47.74 
 
 		 242 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  50.62 
 
 		 261 aa  231  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  52.32 
 
 		 250 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  50.62 
 
 		 254 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.64 
 
 		 240 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.56 
 
 		 241 aa  231  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  51.04 
 
 		 247 aa  231  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  48.56 
 
 		 241 aa  231  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 245 aa  230  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  48.56 
 
 		 241 aa  231  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  50.41 
 
 		 240 aa  230  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 240 aa  230  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  50 
 
 		 246 aa  230  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  49.57 
 
 		 240 aa  230  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  50.65 
 
 		 246 aa  230  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 240 aa  230  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 240 aa  230  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 240 aa  230  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>