More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1708 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1708  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 242 aa  491  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.871153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1154  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  79.25 
 
 		 246 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3697  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  77.27 
 
 		 242 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270266  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2355  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70.95 
 
 		 242 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1959  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  69.29 
 
 		 242 aa  333  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1404  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70.54 
 
 		 242 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.595222  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3156  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70.54 
 
 		 242 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.805014  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3270  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70.54 
 
 		 242 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2389  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70.54 
 
 		 242 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1124  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70.54 
 
 		 242 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2096  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70.71 
 
 		 240 aa  328  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1485  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70.71 
 
 		 240 aa  328  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  67.36 
 
 		 240 aa  328  4e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  67.36 
 
 		 240 aa  328  4e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  67.36 
 
 		 240 aa  328  4e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  67.36 
 
 		 240 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  67.36 
 
 		 240 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  67.36 
 
 		 240 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  67.36 
 
 		 240 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  67.36 
 
 		 240 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1296  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  67.36 
 
 		 240 aa  328  5.0000000000000004e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.484197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  67.36 
 
 		 240 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4282  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  69.29 
 
 		 242 aa  328  6e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3439  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  69.29 
 
 		 242 aa  328  6e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4084  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  69.29 
 
 		 242 aa  328  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2393  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  66.95 
 
 		 240 aa  325  3e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  67.78 
 
 		 240 aa  326  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  66.53 
 
 		 240 aa  324  8.000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  66.11 
 
 		 240 aa  323  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  66.11 
 
 		 240 aa  323  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  66.11 
 
 		 240 aa  323  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  66.11 
 
 		 240 aa  323  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  66.11 
 
 		 240 aa  323  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 		 240 aa  322  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  66.25 
 
 		 240 aa  320  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  65.69 
 
 		 240 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  65.27 
 
 		 240 aa  318  6e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1775  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  65.27 
 
 		 240 aa  316  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  normal  0.116362 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  57.26 
 
 		 243 aa  284  8e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  58.9 
 
 		 243 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  58.47 
 
 		 243 aa  279  4e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  58.05 
 
 		 243 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  57.32 
 
 		 240 aa  272  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  56.02 
 
 		 244 aa  272  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  56.67 
 
 		 243 aa  270  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  56.49 
 
 		 244 aa  268  5.9999999999999995e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  53.56 
 
 		 240 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  56.9 
 
 		 244 aa  268  7e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  56.67 
 
 		 249 aa  266  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  56.49 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  55.83 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  54.39 
 
 		 240 aa  265  4e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  55.65 
 
 		 239 aa  265  5e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0358  ABC transporter related  55.88 
 
 		 252 aa  265  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  57.74 
 
 		 243 aa  265  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.97 
 
 		 240 aa  265  5.999999999999999e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  56.07 
 
 		 252 aa  264  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  55.23 
 
 		 261 aa  264  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  58.23 
 
 		 251 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  54.66 
 
 		 241 aa  264  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  56.9 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  54.81 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  54.77 
 
 		 244 aa  263  3e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  54.39 
 
 		 245 aa  262  3e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  54.62 
 
 		 257 aa  262  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  54.39 
 
 		 245 aa  261  4.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  57.63 
 
 		 248 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  53.97 
 
 		 240 aa  261  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  54.58 
 
 		 243 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  56.07 
 
 		 243 aa  260  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  57.38 
 
 		 252 aa  259  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  55.83 
 
 		 262 aa  259  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  54.89 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  52.72 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  54.81 
 
 		 246 aa  259  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  57.92 
 
 		 253 aa  259  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  50.63 
 
 		 240 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  52.97 
 
 		 244 aa  258  5.0000000000000005e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  52.72 
 
 		 240 aa  258  5.0000000000000005e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  53.78 
 
 		 263 aa  258  6e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1117  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.32 
 
 		 255 aa  258  6e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000186599  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  53.97 
 
 		 243 aa  258  8e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  52.5 
 
 		 251 aa  258  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  52.54 
 
 		 240 aa  258  8e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  53.56 
 
 		 242 aa  258  8e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  53.97 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  56.78 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  54.55 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0299  ABC transporter-related protein  56.71 
 
 		 252 aa  257  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  56.49 
 
 		 243 aa  256  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  53.94 
 
 		 242 aa  256  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  56.22 
 
 		 267 aa  256  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.5 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  53.14 
 
 		 240 aa  256  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  54.98 
 
 		 254 aa  256  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  54.01 
 
 		 244 aa  256  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  50.63 
 
 		 242 aa  256  3e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0238  ABC transporter related  55.6 
 
 		 250 aa  256  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  54.36 
 
 		 246 aa  256  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  51.88 
 
 		 265 aa  256  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>