More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6505 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5151  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  71.88 
 
 		 543 aa  742    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.406316  normal  0.927008 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6505  ABC transporter permease/ATP-binding protein  100 
 
 		 536 aa  1072    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0292  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.93 
 
 		 510 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0599  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  46.4 
 
 		 567 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.106218 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5145  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.63 
 
 		 567 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.900628 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1640  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.86 
 
 		 559 aa  365  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.588143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0873  ABC transporter related protein  67.67 
 
 		 240 aa  327  4.0000000000000003e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0868  amino acid ABC transporter permease  42.26 
 
 		 532 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.5 
 
 		 533 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.429641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0885  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.08 
 
 		 533 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.07 
 
 		 597 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  39.89 
 
 		 597 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.89 
 
 		 597 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.08 
 
 		 592 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.35 
 
 		 619 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.71 
 
 		 602 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.09 
 
 		 595 aa  302  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.71 
 
 		 636 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  39.71 
 
 		 636 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.71 
 
 		 636 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.71 
 
 		 636 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  39.71 
 
 		 636 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.28 
 
 		 595 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.07 
 
 		 594 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.64 
 
 		 581 aa  295  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  39.34 
 
 		 636 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.34 
 
 		 636 aa  293  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  39.54 
 
 		 598 aa  289  8e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2799  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.37 
 
 		 510 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  59.44 
 
 		 256 aa  277  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1311  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.68 
 
 		 512 aa  275  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00935602 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4453  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.8 
 
 		 500 aa  274  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3989  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.59 
 
 		 500 aa  274  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.228194  normal  0.451936 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3313  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.13 
 
 		 502 aa  268  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571004  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.28 
 
 		 502 aa  265  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5550  glutamine ABC transporter  36.65 
 
 		 507 aa  263  4.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.28 
 
 		 506 aa  263  6e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  56.8 
 
 		 264 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.21 
 
 		 244 aa  262  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.84 
 
 		 516 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.81 
 
 		 244 aa  261  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.81 
 
 		 244 aa  261  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.81 
 
 		 244 aa  261  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.81 
 
 		 244 aa  260  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.81 
 
 		 244 aa  260  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.09 
 
 		 510 aa  260  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  55.95 
 
 		 258 aa  260  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.81 
 
 		 244 aa  259  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  51.81 
 
 		 244 aa  259  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  55.02 
 
 		 259 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  55.42 
 
 		 268 aa  257  5e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.41 
 
 		 244 aa  256  7e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.41 
 
 		 244 aa  256  7e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  51.81 
 
 		 244 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  55.56 
 
 		 256 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2453  ABC transporter related  56.22 
 
 		 250 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  54.8 
 
 		 267 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  53.82 
 
 		 259 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  54.88 
 
 		 252 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  54.32 
 
 		 256 aa  251  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  55.16 
 
 		 272 aa  250  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  56.33 
 
 		 252 aa  250  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0118  ABC transporter related  55.02 
 
 		 250 aa  249  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4083  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.45 
 
 		 500 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1184  ABC transporter-related protein  54.18 
 
 		 275 aa  247  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0404  ABC transporter related  50.93 
 
 		 272 aa  246  6e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.22 
 
 		 260 aa  245  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  51.18 
 
 		 253 aa  245  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  53.23 
 
 		 253 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  52.44 
 
 		 260 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  51.98 
 
 		 256 aa  244  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52 
 
 		 251 aa  244  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  52.76 
 
 		 264 aa  244  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  57.55 
 
 		 243 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  54.13 
 
 		 260 aa  243  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  52.76 
 
 		 274 aa  243  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  54.55 
 
 		 254 aa  242  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  51.81 
 
 		 265 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  53.01 
 
 		 263 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  56.5 
 
 		 243 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1778  ABC transporter related  50.19 
 
 		 271 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  56.4 
 
 		 279 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  53.82 
 
 		 254 aa  241  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  53.23 
 
 		 243 aa  241  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  56.45 
 
 		 243 aa  241  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  52.21 
 
 		 263 aa  240  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  51.44 
 
 		 255 aa  240  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  54.98 
 
 		 248 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  52.63 
 
 		 263 aa  240  5.999999999999999e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  53.25 
 
 		 243 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  52.87 
 
 		 262 aa  240  5.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  54.07 
 
 		 243 aa  239  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  53.57 
 
 		 261 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3138  ABC transporter related  52.94 
 
 		 253 aa  239  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.709242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  52.85 
 
 		 254 aa  239  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.85 
 
 		 250 aa  239  8e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13310  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 		 255 aa  238  2e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2606  ABC transporter related  52.57 
 
 		 254 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.0103017 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  51.82 
 
 		 257 aa  238  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  52.59 
 
 		 274 aa  238  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>