More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4453 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4083  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  91.8 
 
 		 500 aa  884    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3989  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  99.2 
 
 		 500 aa  1001    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.228194  normal  0.451936 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4453  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 500 aa  1010    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1311  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  67.13 
 
 		 512 aa  677    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00935602 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3313  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.48 
 
 		 502 aa  593  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571004  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.59 
 
 		 506 aa  590  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2799  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.32 
 
 		 510 aa  571  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.63 
 
 		 592 aa  332  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  41.22 
 
 		 598 aa  330  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.38 
 
 		 595 aa  322  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  39.38 
 
 		 597 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.38 
 
 		 597 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.38 
 
 		 597 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.92 
 
 		 595 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.37 
 
 		 581 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.34 
 
 		 602 aa  306  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 		 594 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.73 
 
 		 619 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.42 
 
 		 594 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1640  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.95 
 
 		 559 aa  298  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.588143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5145  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.03 
 
 		 567 aa  296  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.900628 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  37.68 
 
 		 636 aa  292  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.68 
 
 		 636 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.5 
 
 		 636 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0599  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.24 
 
 		 567 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.106218 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.95 
 
 		 516 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.51 
 
 		 510 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.42 
 
 		 502 aa  279  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0292  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.35 
 
 		 510 aa  278  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5550  glutamine ABC transporter  37.53 
 
 		 507 aa  277  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.35 
 
 		 533 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.429641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0868  amino acid ABC transporter permease  38.74 
 
 		 532 aa  263  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0885  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.74 
 
 		 533 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5151  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.31 
 
 		 543 aa  260  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.406316  normal  0.927008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  53.5 
 
 		 251 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6505  ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.94 
 
 		 536 aa  257  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  53.94 
 
 		 242 aa  250  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  52.46 
 
 		 261 aa  249  9e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  51.03 
 
 		 242 aa  246  6e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  49.24 
 
 		 262 aa  245  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  50.2 
 
 		 243 aa  246  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0152  ABC transporter related  49 
 
 		 256 aa  243  6e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0734345  hitchhiker  0.0000445687 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  52.85 
 
 		 270 aa  243  7.999999999999999e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  51.44 
 
 		 253 aa  242  9e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3973  ABC transporter related  50 
 
 		 282 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  52.02 
 
 		 256 aa  242  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  51.87 
 
 		 248 aa  242  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1708  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.23 
 
 		 242 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.871153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  52.26 
 
 		 244 aa  241  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  53.17 
 
 		 256 aa  240  4e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.6 
 
 		 240 aa  240  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  51.21 
 
 		 255 aa  240  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  51.45 
 
 		 251 aa  239  6.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  52.28 
 
 		 257 aa  237  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  52.61 
 
 		 247 aa  237  4e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  51.25 
 
 		 244 aa  237  4e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  50.79 
 
 		 262 aa  236  6e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1296  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.84 
 
 		 240 aa  236  7e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.484197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  47.95 
 
 		 240 aa  236  7e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.1 
 
 		 251 aa  236  8e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  52.52 
 
 		 258 aa  236  9e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.15 
 
 		 240 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  52.26 
 
 		 249 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  51.01 
 
 		 263 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  50.62 
 
 		 251 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 240 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3694  ABC transporter related  52.42 
 
 		 248 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.749012  normal  0.245017 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  50.62 
 
 		 248 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  49.38 
 
 		 246 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  52.81 
 
 		 252 aa  234  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  51.04 
 
 		 261 aa  234  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 		 240 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  52.1 
 
 		 242 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 		 240 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.24 
 
 		 240 aa  233  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  49.8 
 
 		 245 aa  233  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  50 
 
 		 240 aa  233  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  52.94 
 
 		 242 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  51.03 
 
 		 242 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  51.03 
 
 		 240 aa  233  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  51.03 
 
 		 254 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  51.03 
 
 		 254 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 242 aa  233  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  50.86 
 
 		 246 aa  233  7.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3307  ABC transporter related  51.85 
 
 		 259 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  47.74 
 
 		 239 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  49.38 
 
 		 243 aa  233  7.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  52.08 
 
 		 250 aa  232  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  51.03 
 
 		 254 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 240 aa  232  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 240 aa  232  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1775  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 240 aa  232  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  normal  0.116362 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 240 aa  232  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  51.04 
 
 		 247 aa  232  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 240 aa  232  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 240 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  50.41 
 
 		 240 aa  232  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 		 240 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  50.41 
 
 		 244 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  50.21 
 
 		 259 aa  231  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>