More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_03640 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_03640  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
245 aa  495  1e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  60.33 
 
 
265 aa  317  9e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  59.5 
 
 
253 aa  314  7e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  59.5 
 
 
253 aa  314  7e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.91 
 
 
245 aa  310  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  60.91 
 
 
245 aa  309  2e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.26 
 
 
244 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.26 
 
 
244 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.26 
 
 
244 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  59.26 
 
 
244 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.67 
 
 
244 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.85 
 
 
244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.85 
 
 
244 aa  306  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.44 
 
 
244 aa  304  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2602  ABC transporter related  58.2 
 
 
248 aa  304  9.000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.85 
 
 
244 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.85 
 
 
244 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0371  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  59.92 
 
 
245 aa  300  1e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3040  ABC transporter related  56.02 
 
 
248 aa  299  3e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2511  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.61 
 
 
245 aa  297  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000409098  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002012  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  56.61 
 
 
245 aa  296  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000066278  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00439  ABC polar amino acid transporter ATPase component  56.61 
 
 
245 aa  296  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  58.44 
 
 
244 aa  295  6e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0374  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.85 
 
 
257 aa  294  9e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.293894  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1918  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  58.92 
 
 
255 aa  291  7e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.248915  hitchhiker  0.0037294 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0006  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  54.96 
 
 
245 aa  291  7e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00283619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.47 
 
 
247 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  55.74 
 
 
252 aa  285  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.5 
 
 
252 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.28 
 
 
252 aa  284  9e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.28 
 
 
252 aa  284  9e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.06 
 
 
247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  55.28 
 
 
251 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.28 
 
 
252 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0242  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.51 
 
 
249 aa  278  7e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762427  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  58.68 
 
 
263 aa  277  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.1 
 
 
250 aa  275  4e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  54.1 
 
 
251 aa  275  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.1 
 
 
250 aa  275  7e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.1 
 
 
250 aa  275  7e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  56.38 
 
 
240 aa  275  7e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.1 
 
 
250 aa  275  7e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  55.1 
 
 
250 aa  274  9e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.1 
 
 
250 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.1 
 
 
250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  55.1 
 
 
247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0139  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56.2 
 
 
260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  54.8 
 
 
268 aa  271  6e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  55.37 
 
 
248 aa  271  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  54.55 
 
 
245 aa  270  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  54.12 
 
 
274 aa  270  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  55.56 
 
 
247 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.04 
 
 
250 aa  270  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4025  ABC transporter related  54.1 
 
 
251 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4341  ABC transporter related  54.1 
 
 
251 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.88 
 
 
250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.94 
 
 
254 aa  268  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  54.55 
 
 
248 aa  268  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  54.55 
 
 
250 aa  268  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1011  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.87 
 
 
250 aa  268  8e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.648524  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.23 
 
 
250 aa  268  8.999999999999999e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  53.6 
 
 
256 aa  267  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.85 
 
 
240 aa  267  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.47 
 
 
250 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  53.09 
 
 
241 aa  267  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  54.55 
 
 
243 aa  267  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.47 
 
 
250 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.47 
 
 
250 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  53.17 
 
 
261 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  52.99 
 
 
263 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  54.62 
 
 
279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  53.09 
 
 
246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  53.5 
 
 
241 aa  265  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  53.5 
 
 
240 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  51.85 
 
 
240 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  52 
 
 
267 aa  265  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  53.41 
 
 
242 aa  265  4e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.26 
 
 
240 aa  265  4e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.67 
 
 
240 aa  265  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.26 
 
 
240 aa  265  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1231  ABC transporter related  53.69 
 
 
252 aa  265  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.903047  normal  0.0835348 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.26 
 
 
240 aa  265  4e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.26 
 
 
240 aa  265  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4922  ABC transporter related  50.81 
 
 
253 aa  265  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0024396 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1128  ABC transporter related protein  53.47 
 
 
266 aa  265  5e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.419113  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  51.03 
 
 
241 aa  265  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  51.03 
 
 
241 aa  265  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1152  ABC transporter related  53.85 
 
 
247 aa  265  5.999999999999999e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.645905  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.06 
 
 
250 aa  264  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  53.2 
 
 
250 aa  264  8e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.44 
 
 
240 aa  264  8e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  51.03 
 
 
241 aa  264  8e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  51.03 
 
 
241 aa  264  8e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  51.03 
 
 
241 aa  264  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.85 
 
 
240 aa  264  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  52.26 
 
 
240 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  52.61 
 
 
258 aa  263  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1617  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.46 
 
 
247 aa  264  1e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000736916  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2343  ABC transporter related  53.91 
 
 
245 aa  263  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185697  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  53.2 
 
 
254 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>