More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2511 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2511  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 245 aa  499  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000409098  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002012  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  88.52 
 
 		 245 aa  451  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000066278  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00439  ABC polar amino acid transporter ATPase component  86.48 
 
 		 245 aa  440  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0006  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  81.15 
 
 		 245 aa  420  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00283619  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3040  ABC transporter related  65.56 
 
 		 248 aa  331  6e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2602  ABC transporter related  63.64 
 
 		 248 aa  328  4e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  59.67 
 
 		 265 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  57.61 
 
 		 253 aa  298  6e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  57.2 
 
 		 253 aa  297  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1918  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  59 
 
 		 255 aa  296  3e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.248915  hitchhiker  0.0037294 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0371  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  53.88 
 
 		 245 aa  286  2e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 		 244 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 		 244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 		 244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03640  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.61 
 
 		 245 aa  281  5.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 		 244 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  55.42 
 
 		 244 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.42 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.42 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  53.94 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  55.42 
 
 		 244 aa  276  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 		 245 aa  274  9e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  53.2 
 
 		 263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  51.05 
 
 		 245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0374  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.39 
 
 		 257 aa  272  3e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.293894  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  55.37 
 
 		 240 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  54.51 
 
 		 241 aa  270  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  55.1 
 
 		 247 aa  270  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.07 
 
 		 244 aa  271  1e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  53.82 
 
 		 259 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  53.31 
 
 		 239 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  52.07 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  51.44 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  52.89 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  52.61 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  52 
 
 		 256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  50 
 
 		 248 aa  265  4e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  52.89 
 
 		 241 aa  265  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  53.31 
 
 		 252 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  52.3 
 
 		 254 aa  264  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.26 
 
 		 250 aa  264  8.999999999999999e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.26 
 
 		 250 aa  264  8.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.26 
 
 		 250 aa  264  8.999999999999999e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.26 
 
 		 250 aa  264  8.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4184  ABC transporter related protein  52.48 
 
 		 253 aa  263  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0219  ABC transporter related  53.72 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3993  ABC transporter related  52.48 
 
 		 253 aa  263  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.564938  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  51.65 
 
 		 240 aa  263  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.85 
 
 		 250 aa  264  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.05 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  52.89 
 
 		 241 aa  264  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  51.85 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.85 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.04 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  52.85 
 
 		 289 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  52.48 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  51.24 
 
 		 246 aa  263  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.26 
 
 		 250 aa  263  3e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1152  ABC transporter related  53.66 
 
 		 247 aa  262  3e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.645905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  53.25 
 
 		 288 aa  262  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  52.07 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.41 
 
 		 244 aa  262  4e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  51.81 
 
 		 267 aa  262  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  52.48 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  52.48 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  52.44 
 
 		 289 aa  262  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.64 
 
 		 240 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  50.83 
 
 		 242 aa  261  4.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.64 
 
 		 240 aa  261  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.64 
 
 		 240 aa  261  6e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.64 
 
 		 240 aa  261  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  50.83 
 
 		 240 aa  261  6e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.64 
 
 		 240 aa  261  6e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2003  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 		 243 aa  261  6.999999999999999e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  52.42 
 
 		 261 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  52.48 
 
 		 240 aa  261  6.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  53.31 
 
 		 240 aa  261  6.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.41 
 
 		 254 aa  261  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  52.94 
 
 		 262 aa  261  8e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  53.09 
 
 		 256 aa  261  8e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.23 
 
 		 240 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.89 
 
 		 240 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0174  ABC transporter related  54.55 
 
 		 253 aa  261  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0313265  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  52.07 
 
 		 243 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  53.31 
 
 		 243 aa  260  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  51 
 
 		 260 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.48 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.64 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.89 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  51.48 
 
 		 239 aa  260  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  51.24 
 
 		 256 aa  260  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  52.48 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  49.4 
 
 		 258 aa  260  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  51.65 
 
 		 243 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.48 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.23 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  53.01 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>