More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3993 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3993  ABC transporter related  100 
 
 		 253 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.564938  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4184  ABC transporter related protein  98.02 
 
 		 253 aa  505  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0219  ABC transporter related  85.38 
 
 		 253 aa  450  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0174  ABC transporter related  88.93 
 
 		 253 aa  443  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0313265  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  60.91 
 
 		 265 aa  293  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  57.85 
 
 		 245 aa  291  8e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  59.26 
 
 		 253 aa  289  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.44 
 
 		 245 aa  289  3e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  58.85 
 
 		 253 aa  288  8e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3040  ABC transporter related  56.02 
 
 		 248 aa  285  5.999999999999999e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2602  ABC transporter related  53.31 
 
 		 248 aa  280  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  56.79 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.79 
 
 		 244 aa  276  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.38 
 
 		 244 aa  275  5e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.38 
 
 		 244 aa  274  9e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  56.38 
 
 		 243 aa  274  9e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.79 
 
 		 244 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.38 
 
 		 244 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.38 
 
 		 244 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  57.44 
 
 		 244 aa  272  3e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.97 
 
 		 244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.33 
 
 		 252 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.33 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.33 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  55.97 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.56 
 
 		 244 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.56 
 
 		 244 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  54.96 
 
 		 251 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.92 
 
 		 252 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1918  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  56.54 
 
 		 255 aa  268  8.999999999999999e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.248915  hitchhiker  0.0037294 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  56.2 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.33 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  54.66 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.33 
 
 		 250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.33 
 
 		 250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.33 
 
 		 250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.33 
 
 		 250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0006  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  52.89 
 
 		 245 aa  265  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00283619  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  54.25 
 
 		 248 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2511  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.48 
 
 		 245 aa  263  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000409098  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.02 
 
 		 250 aa  264  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3633  ABC transporter related  52.96 
 
 		 263 aa  262  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.33 
 
 		 250 aa  261  6.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  54.62 
 
 		 263 aa  261  8e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.66 
 
 		 250 aa  261  8.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.96 
 
 		 244 aa  260  1e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  54.13 
 
 		 252 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  54.92 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  52.36 
 
 		 253 aa  260  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.92 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  55.79 
 
 		 243 aa  259  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.92 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4025  ABC transporter related  54.96 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.92 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4341  ABC transporter related  54.96 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.92 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.92 
 
 		 250 aa  258  7e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.41 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2374  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.41 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.90212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.2 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4922  ABC transporter related  51.02 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024396 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  52.03 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2743  ABC transporter related  54.25 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  54.55 
 
 		 243 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  55.37 
 
 		 243 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  53.88 
 
 		 247 aa  254  9e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  55.51 
 
 		 258 aa  254  9e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3138  ABC transporter related  48.05 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.709242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.79 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  54.69 
 
 		 251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  52.46 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  54.55 
 
 		 239 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  53.69 
 
 		 241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0242  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.29 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762427  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  52.03 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2033  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.01 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  53.72 
 
 		 242 aa  252  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.47 
 
 		 257 aa  252  5.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2653  polar amino acid ABC transporter ATPase  50.4 
 
 		 267 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002012  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  50 
 
 		 245 aa  252  5.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000066278  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.44 
 
 		 241 aa  251  6e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  52.44 
 
 		 241 aa  251  7e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  52.44 
 
 		 241 aa  251  7e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3837  ABC transporter related  49.59 
 
 		 253 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00439  ABC polar amino acid transporter ATPase component  51.02 
 
 		 245 aa  250  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  52.03 
 
 		 241 aa  249  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  54.32 
 
 		 242 aa  249  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  53.97 
 
 		 249 aa  249  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1152  ABC transporter related  51.82 
 
 		 247 aa  249  3e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.645905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2910  ABC transporter related  53.28 
 
 		 246 aa  249  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  52.48 
 
 		 243 aa  249  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3810  ABC transporter related  50 
 
 		 253 aa  249  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  53.11 
 
 		 257 aa  249  4e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  52.07 
 
 		 240 aa  248  5e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  53.72 
 
 		 278 aa  248  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0152  ABC transporter related  51.04 
 
 		 256 aa  248  6e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0734345  hitchhiker  0.0000445687 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0371  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  50.62 
 
 		 245 aa  248  6e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  52.26 
 
 		 246 aa  248  7e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  53.5 
 
 		 257 aa  248  7e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  53.01 
 
 		 255 aa  248  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>