More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3040 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3040  ABC transporter related  100 
 
 		 248 aa  498  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2602  ABC transporter related  65.15 
 
 		 248 aa  336  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2511  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.56 
 
 		 245 aa  331  6e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000409098  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002012  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  63.07 
 
 		 245 aa  322  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000066278  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00439  ABC polar amino acid transporter ATPase component  61.83 
 
 		 245 aa  315  4e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0006  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  61 
 
 		 245 aa  314  8e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00283619  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1918  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  59.17 
 
 		 255 aa  310  1e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.248915  hitchhiker  0.0037294 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  57.26 
 
 		 265 aa  293  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0219  ABC transporter related  56.43 
 
 		 253 aa  289  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 		 245 aa  288  4e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  53.33 
 
 		 245 aa  288  5.0000000000000004e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4184  ABC transporter related protein  56.02 
 
 		 253 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  56.02 
 
 		 253 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03640  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.02 
 
 		 245 aa  285  5e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  55.6 
 
 		 253 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3993  ABC transporter related  56.02 
 
 		 253 aa  285  5.999999999999999e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.564938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.09 
 
 		 244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.5 
 
 		 244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.5 
 
 		 244 aa  281  5.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0174  ABC transporter related  58.09 
 
 		 253 aa  281  7.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0313265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.91 
 
 		 244 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.09 
 
 		 244 aa  281  9e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.09 
 
 		 244 aa  280  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  53.09 
 
 		 244 aa  280  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.09 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.09 
 
 		 244 aa  278  5e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.09 
 
 		 244 aa  278  5e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  53.09 
 
 		 244 aa  278  7e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  53.53 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  53.94 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  53.53 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  52.92 
 
 		 244 aa  268  8e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  53.94 
 
 		 241 aa  268  8e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.46 
 
 		 250 aa  268  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.67 
 
 		 250 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.67 
 
 		 250 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  53.11 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.67 
 
 		 250 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.46 
 
 		 250 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  51.87 
 
 		 241 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.46 
 
 		 250 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0371  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.67 
 
 		 245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  51.87 
 
 		 241 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.46 
 
 		 250 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  53.11 
 
 		 241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  50.62 
 
 		 246 aa  265  5e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.46 
 
 		 250 aa  265  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.05 
 
 		 250 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.87 
 
 		 241 aa  265  7e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  52.05 
 
 		 250 aa  264  8e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.26 
 
 		 250 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  51.45 
 
 		 241 aa  264  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.85 
 
 		 250 aa  263  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0374  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.45 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.293894  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.64 
 
 		 250 aa  262  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4555  ABC transporter related  51.43 
 
 		 299 aa  261  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.65 
 
 		 250 aa  261  8.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  51.04 
 
 		 252 aa  258  6e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.27 
 
 		 267 aa  258  8e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.03 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  51.45 
 
 		 241 aa  257  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2343  ABC transporter related  52.7 
 
 		 245 aa  256  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185697  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.03 
 
 		 247 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  51.22 
 
 		 247 aa  256  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1152  ABC transporter related  50.82 
 
 		 247 aa  255  4e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.645905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1061  polar amino acid ABC transporter ATPase  51.43 
 
 		 300 aa  255  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.87 
 
 		 244 aa  255  4e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  51.04 
 
 		 243 aa  255  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.62 
 
 		 252 aa  255  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  53.53 
 
 		 240 aa  255  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  52.67 
 
 		 267 aa  255  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  52.7 
 
 		 241 aa  254  6e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  49.38 
 
 		 240 aa  254  6e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  51.87 
 
 		 243 aa  254  7e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.03 
 
 		 252 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2374  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.04 
 
 		 253 aa  254  9e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.90212  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.04 
 
 		 253 aa  254  9e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  52.7 
 
 		 242 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1128  ABC transporter related protein  52.72 
 
 		 266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.419113  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  51.03 
 
 		 251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2033  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.04 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.21 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  50.62 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  51.02 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.03 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.03 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 244 aa  253  3e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  52.7 
 
 		 243 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  52.19 
 
 		 261 aa  252  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  52.28 
 
 		 246 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  51.21 
 
 		 260 aa  251  5.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  49.41 
 
 		 256 aa  251  6e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  52.28 
 
 		 253 aa  251  7e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  48.96 
 
 		 240 aa  251  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  50.21 
 
 		 245 aa  251  9.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  48.96 
 
 		 240 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4152  ABC transporter related  49.59 
 
 		 271 aa  251  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0242  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  49.38 
 
 		 249 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762427  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  47.72 
 
 		 240 aa  251  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.55 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>