More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0374 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0374  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  100 
 
 
257 aa  527  1e-149  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.293894  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.92 
 
 
244 aa  298  4e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.92 
 
 
244 aa  298  5e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.92 
 
 
244 aa  298  6e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.5 
 
 
244 aa  297  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.5 
 
 
244 aa  296  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.5 
 
 
244 aa  295  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.09 
 
 
244 aa  295  5e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  58.68 
 
 
244 aa  295  6e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.5 
 
 
244 aa  294  9e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.5 
 
 
244 aa  294  9e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  59.09 
 
 
244 aa  292  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.37 
 
 
245 aa  285  7e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  55.37 
 
 
245 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4152  ABC transporter related  55.06 
 
 
271 aa  281  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03640  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.09 
 
 
245 aa  280  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  54.44 
 
 
253 aa  279  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  55.2 
 
 
265 aa  279  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  54.44 
 
 
253 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0371  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.37 
 
 
245 aa  276  3e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  53.15 
 
 
258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00439  ABC polar amino acid transporter ATPase component  55.37 
 
 
245 aa  273  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2511  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 
245 aa  272  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000409098  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0006  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  55.19 
 
 
245 aa  271  6e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00283619  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002012  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  54.55 
 
 
245 aa  271  7e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000066278  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  56.61 
 
 
243 aa  271  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  55.51 
 
 
263 aa  270  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  56.2 
 
 
244 aa  270  2e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  54.55 
 
 
249 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  56.2 
 
 
243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  52 
 
 
252 aa  268  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  55.42 
 
 
259 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  54.1 
 
 
246 aa  266  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  53.31 
 
 
244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1617  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.13 
 
 
247 aa  265  4e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000736916  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  54.92 
 
 
247 aa  265  5.999999999999999e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1128  ABC transporter related protein  53.04 
 
 
266 aa  265  8e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.419113  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  53.09 
 
 
244 aa  264  8e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.91 
 
 
251 aa  264  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  53.53 
 
 
240 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  53.69 
 
 
244 aa  264  1e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  52.96 
 
 
267 aa  264  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  53.41 
 
 
259 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3040  ABC transporter related  51.45 
 
 
248 aa  263  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.66 
 
 
252 aa  262  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  54.1 
 
 
256 aa  262  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  53.44 
 
 
265 aa  263  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  51.85 
 
 
240 aa  262  4e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  53.91 
 
 
244 aa  262  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  51.41 
 
 
260 aa  262  4e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  51.64 
 
 
242 aa  262  4e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2781  ABC transporter related  52.44 
 
 
256 aa  262  4e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.28 
 
 
247 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  53.53 
 
 
250 aa  261  4.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  53.44 
 
 
256 aa  261  6e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2602  ABC transporter related  51.63 
 
 
248 aa  261  6e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  53.94 
 
 
240 aa  261  6e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.07 
 
 
252 aa  261  6e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  55.14 
 
 
241 aa  261  6e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.07 
 
 
252 aa  261  6e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1918  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  51.61 
 
 
255 aa  261  6e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.248915  hitchhiker  0.0037294 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  52.24 
 
 
245 aa  261  8.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  55.74 
 
 
244 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.72 
 
 
273 aa  260  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  52.65 
 
 
251 aa  259  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  50 
 
 
244 aa  259  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1011  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.25 
 
 
250 aa  259  4e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.648524  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  53.11 
 
 
242 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  55.6 
 
 
240 aa  258  6e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  51.42 
 
 
240 aa  258  9e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 
244 aa  257  1e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.46 
 
 
247 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  52.07 
 
 
242 aa  257  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1152  ABC transporter related  53.47 
 
 
247 aa  257  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.645905  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2374  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.82 
 
 
253 aa  256  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.90212  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  52.44 
 
 
246 aa  257  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.82 
 
 
253 aa  256  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18750  ABC transporter related  52.05 
 
 
250 aa  256  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000378719  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  51.44 
 
 
240 aa  256  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  52.07 
 
 
242 aa  256  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  51.57 
 
 
262 aa  256  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  52.48 
 
 
241 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.65 
 
 
247 aa  256  3e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  52.61 
 
 
256 aa  256  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  52.89 
 
 
243 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  52.48 
 
 
241 aa  256  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  51.03 
 
 
255 aa  255  4e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  49.61 
 
 
263 aa  255  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1231  ABC transporter related  51.23 
 
 
252 aa  255  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.903047  normal  0.0835348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  52.48 
 
 
241 aa  255  5e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.85 
 
 
258 aa  255  6e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  52.67 
 
 
240 aa  254  7e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3107  ABC transporter related  51.03 
 
 
245 aa  254  8e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  51.19 
 
 
257 aa  254  8e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.53 
 
 
240 aa  254  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.07 
 
 
241 aa  254  9e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.64 
 
 
250 aa  254  9e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1640  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52 
 
 
559 aa  254  9e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.588143  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  51.24 
 
 
253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2834  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  50.8 
 
 
268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>