More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002012 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002012  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  100 
 
 		 245 aa  499  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000066278  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00439  ABC polar amino acid transporter ATPase component  96.73 
 
 		 245 aa  486  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2511  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  88.52 
 
 		 245 aa  451  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000409098  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0006  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  82.38 
 
 		 245 aa  421  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00283619  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3040  ABC transporter related  63.07 
 
 		 248 aa  322  3e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2602  ABC transporter related  63.22 
 
 		 248 aa  321  6e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  58.44 
 
 		 265 aa  295  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1918  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  58.16 
 
 		 255 aa  294  8e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.248915  hitchhiker  0.0037294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  55.97 
 
 		 253 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  56.38 
 
 		 253 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0371  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  53.47 
 
 		 245 aa  282  3.0000000000000004e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03640  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.61 
 
 		 245 aa  281  5.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55 
 
 		 244 aa  276  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55 
 
 		 244 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55 
 
 		 244 aa  275  6e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 244 aa  274  9e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  54.58 
 
 		 244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.17 
 
 		 244 aa  272  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  53.2 
 
 		 263 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0374  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.55 
 
 		 257 aa  271  7e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.293894  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  55.42 
 
 		 244 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.48 
 
 		 244 aa  271  8.000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.26 
 
 		 250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.26 
 
 		 250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.26 
 
 		 250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.85 
 
 		 250 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  51.85 
 
 		 250 aa  268  8e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.85 
 
 		 250 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.26 
 
 		 250 aa  267  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  54.13 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  50.63 
 
 		 245 aa  265  4e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.63 
 
 		 245 aa  265  5.999999999999999e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  52.48 
 
 		 240 aa  264  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  51.81 
 
 		 259 aa  263  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  51.24 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  50.81 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  52.07 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  52.23 
 
 		 244 aa  263  3e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  52.48 
 
 		 251 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.62 
 
 		 250 aa  262  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  53.31 
 
 		 243 aa  262  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  50.8 
 
 		 256 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 244 aa  261  6e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  51 
 
 		 260 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  52.48 
 
 		 241 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  51.65 
 
 		 246 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2003  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 243 aa  260  1e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  50.62 
 
 		 244 aa  260  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  52.02 
 
 		 261 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  51.03 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  50.63 
 
 		 254 aa  259  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  52.07 
 
 		 252 aa  259  3e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  52.89 
 
 		 240 aa  258  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  51.81 
 
 		 267 aa  259  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.23 
 
 		 250 aa  259  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  52.24 
 
 		 247 aa  258  5.0000000000000005e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0219  ABC transporter related  52.48 
 
 		 253 aa  258  7e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  52.89 
 
 		 240 aa  258  7e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  51.41 
 
 		 268 aa  258  8e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.03 
 
 		 250 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0139  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  49.38 
 
 		 260 aa  258  8e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.03 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  53.01 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  51.65 
 
 		 241 aa  257  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.03 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.03 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1152  ABC transporter related  52.03 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.645905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  49.39 
 
 		 243 aa  256  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  49 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  52.21 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  49.39 
 
 		 243 aa  256  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  52.21 
 
 		 254 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  48.35 
 
 		 248 aa  256  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  50.2 
 
 		 267 aa  256  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4025  ABC transporter related  52.48 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4341  ABC transporter related  52.48 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  51.24 
 
 		 240 aa  255  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  49.59 
 
 		 240 aa  255  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.6 
 
 		 254 aa  255  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  49.59 
 
 		 248 aa  255  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1011  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  50.62 
 
 		 250 aa  255  5e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.648524  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  50.62 
 
 		 263 aa  254  7e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  50.83 
 
 		 243 aa  254  7e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  50 
 
 		 240 aa  254  7e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  50.84 
 
 		 254 aa  254  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  49.4 
 
 		 260 aa  254  7e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  52.07 
 
 		 243 aa  254  8e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.65 
 
 		 244 aa  254  8e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.62 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  51.65 
 
 		 240 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  51.65 
 
 		 243 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  49.59 
 
 		 259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  49.18 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  48.76 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.59 
 
 		 284 aa  253  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>