More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4341 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4025  ABC transporter related  100 
 
 		 251 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4341  ABC transporter related  100 
 
 		 251 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  99.6 
 
 		 251 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  86.29 
 
 		 252 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  75.52 
 
 		 248 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  76.35 
 
 		 248 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2743  ABC transporter related  76.35 
 
 		 248 aa  358  5e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  68.92 
 
 		 278 aa  346  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  71.25 
 
 		 253 aa  341  8e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  68.2 
 
 		 243 aa  327  8e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  66.25 
 
 		 244 aa  323  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  66.25 
 
 		 243 aa  322  5e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  66.67 
 
 		 243 aa  321  7e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  65 
 
 		 243 aa  318  6e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  65.83 
 
 		 243 aa  318  7e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  65.42 
 
 		 243 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  64.58 
 
 		 243 aa  307  9e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  61.25 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  60.4 
 
 		 267 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  60.83 
 
 		 240 aa  304  7e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  56.67 
 
 		 252 aa  298  7e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.54 
 
 		 252 aa  293  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  59.17 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  59.76 
 
 		 255 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  57.92 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.54 
 
 		 252 aa  292  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  58 
 
 		 256 aa  292  4e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  59.36 
 
 		 267 aa  292  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.54 
 
 		 252 aa  291  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.54 
 
 		 252 aa  291  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  58 
 
 		 250 aa  291  7e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  59.6 
 
 		 252 aa  290  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  56.67 
 
 		 240 aa  288  6e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  57.37 
 
 		 263 aa  288  6e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  57.92 
 
 		 240 aa  288  8e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  58.33 
 
 		 244 aa  288  8e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  56.8 
 
 		 250 aa  287  9e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  58.94 
 
 		 251 aa  287  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  56.8 
 
 		 254 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  59.76 
 
 		 254 aa  286  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  56.67 
 
 		 246 aa  285  5e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  57.08 
 
 		 240 aa  285  5e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  57.02 
 
 		 246 aa  284  8e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  54.17 
 
 		 241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  56.8 
 
 		 254 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.25 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  56.25 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  56.25 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.25 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  56.25 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  58.33 
 
 		 244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  58 
 
 		 254 aa  282  4.0000000000000003e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  55.83 
 
 		 240 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  59 
 
 		 249 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  56.67 
 
 		 243 aa  281  7.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  56.67 
 
 		 243 aa  281  8.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  56.4 
 
 		 260 aa  281  8.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 		 241 aa  281  9e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  56.25 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  55.83 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  56.25 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  55.83 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  59.17 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  56.25 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  55.42 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  55.42 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  55 
 
 		 242 aa  279  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.97 
 
 		 247 aa  279  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  57.92 
 
 		 248 aa  279  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  52.08 
 
 		 240 aa  278  5e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  55.83 
 
 		 246 aa  278  6e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  54.73 
 
 		 243 aa  278  6e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  55.42 
 
 		 241 aa  278  6e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  55.83 
 
 		 258 aa  278  6e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.56 
 
 		 247 aa  278  7e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 240 aa  278  7e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  56.67 
 
 		 240 aa  278  7e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  56.8 
 
 		 263 aa  278  8e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.87 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  54.58 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  56.67 
 
 		 246 aa  277  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  57.92 
 
 		 251 aa  277  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  55.83 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  55.2 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  56.8 
 
 		 263 aa  277  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  53.53 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  54.32 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  57.74 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  55.42 
 
 		 242 aa  276  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.67 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.33 
 
 		 250 aa  276  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  59.04 
 
 		 254 aa  276  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  54.44 
 
 		 254 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  54 
 
 		 259 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  56 
 
 		 273 aa  275  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>