More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0213 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0213  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  100 
 
 		 246 aa  497  1e-140  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0135  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  86.94 
 
 		 246 aa  420  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0181638  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  68.05 
 
 		 247 aa  347  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  67.49 
 
 		 246 aa  346  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1059  hypothetical protein  64.2 
 
 		 245 aa  328  4e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0085  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  63.75 
 
 		 254 aa  327  1.0000000000000001e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000203236  normal  0.523772 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1533  ABC transporter related  63.22 
 
 		 246 aa  326  2.0000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534266  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0750  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  64.2 
 
 		 248 aa  326  2.0000000000000001e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0599  ABC transporter related protein  62.81 
 
 		 243 aa  308  4e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2303  ABC transporter related protein  60 
 
 		 246 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000265903  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  58.26 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  59.58 
 
 		 265 aa  297  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 251 aa  295  5e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  56.97 
 
 		 257 aa  291  5e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  56.22 
 
 		 260 aa  291  6e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  57.92 
 
 		 257 aa  289  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  57.92 
 
 		 269 aa  288  8e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.96 
 
 		 244 aa  287  1e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  57.5 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.94 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  55.83 
 
 		 253 aa  285  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  57.08 
 
 		 363 aa  281  5.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  57.08 
 
 		 363 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.1 
 
 		 244 aa  278  4e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  55.65 
 
 		 363 aa  278  5e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  55.65 
 
 		 363 aa  278  5e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  54.77 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  56.61 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  54.77 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  55.19 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  54.55 
 
 		 360 aa  276  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  58.85 
 
 		 240 aa  275  5e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  54.96 
 
 		 246 aa  275  7e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  54.69 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.36 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  56.85 
 
 		 242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.7 
 
 		 240 aa  272  3e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.75 
 
 		 258 aa  272  3e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  51.43 
 
 		 244 aa  271  5.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  53.97 
 
 		 256 aa  271  6e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.01 
 
 		 273 aa  271  8.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  54.77 
 
 		 242 aa  270  1e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  58.26 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  56.02 
 
 		 241 aa  269  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  57.85 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  55.42 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.56 
 
 		 245 aa  269  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0414  putative ABC transporter, ATP-binding protein  54.36 
 
 		 242 aa  269  2.9999999999999997e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  56.56 
 
 		 245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0598  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.69 
 
 		 242 aa  268  5e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00132309  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  56.38 
 
 		 252 aa  268  5e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  53.69 
 
 		 250 aa  268  8e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  53.53 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  53.91 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  51.23 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3307  ABC transporter related  55.42 
 
 		 256 aa  266  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  54.22 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  51.04 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  55.79 
 
 		 244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  56.02 
 
 		 240 aa  265  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  55.6 
 
 		 241 aa  265  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.47 
 
 		 267 aa  265  5e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.36 
 
 		 241 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  53.69 
 
 		 243 aa  265  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  54.51 
 
 		 248 aa  264  8e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  54.36 
 
 		 241 aa  264  8e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  54.36 
 
 		 241 aa  264  8e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  53.94 
 
 		 240 aa  264  8.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2063  ABC transporter related  52.46 
 
 		 246 aa  263  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0300144  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  54.77 
 
 		 270 aa  264  1e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.13 
 
 		 247 aa  263  1e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0981  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.53 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7501  ABC transporter related  52.38 
 
 		 273 aa  262  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  53.53 
 
 		 240 aa  262  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  52.46 
 
 		 245 aa  262  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  53.94 
 
 		 241 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.53 
 
 		 242 aa  262  4e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.233716  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  55.19 
 
 		 243 aa  261  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  54.36 
 
 		 240 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  54.36 
 
 		 240 aa  261  6e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 		 244 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  52.28 
 
 		 244 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  53.5 
 
 		 252 aa  261  6.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 		 244 aa  261  8e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  53.53 
 
 		 243 aa  261  8e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1789  ABC transporter related  53.85 
 
 		 263 aa  261  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  52.08 
 
 		 249 aa  261  8e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 		 244 aa  261  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 		 244 aa  260  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 		 244 aa  260  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 		 244 aa  260  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  54.1 
 
 		 249 aa  260  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  52.05 
 
 		 250 aa  260  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2166  ABC transporter related  52.99 
 
 		 261 aa  260  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000000402922  hitchhiker  0.000000271628 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1540  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.46 
 
 		 252 aa  260  1e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00340374  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  55.27 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  51.65 
 
 		 242 aa  260  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3393  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  53.85 
 
 		 259 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>