More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0179 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0179  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
261 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.861568 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1168  extracellular solute-binding protein family 3  59.68 
 
 
255 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1138  extracellular solute-binding protein family 3  59.68 
 
 
255 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3449  extracellular solute-binding protein  53.41 
 
 
271 aa  265  7e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4307  family 1 extracellular solute-binding protein  48.85 
 
 
292 aa  261  8e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3321  extracellular solute-binding protein family 3  45.02 
 
 
259 aa  231  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1276  extracellular solute-binding protein  37.15 
 
 
260 aa  161  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.22 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  30.22 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.85 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  29.85 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  29.85 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  29.85 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.48 
 
 
276 aa  125  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.48 
 
 
276 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.48 
 
 
276 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  33.48 
 
 
281 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  32.61 
 
 
286 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 
275 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 
276 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  32.51 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  27.94 
 
 
286 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  27.42 
 
 
286 aa  112  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  31.05 
 
 
324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 
276 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  28.24 
 
 
319 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0999  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  33.49 
 
 
259 aa  105  6e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0928  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  33.02 
 
 
259 aa  105  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  32.11 
 
 
271 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0893  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  32.56 
 
 
259 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144905  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.9 
 
 
273 aa  102  7e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  29.07 
 
 
326 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5218  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 
290 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 
275 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2874  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 
298 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2941  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 
290 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.343687  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1134  extracellular solute-binding protein family 3  32.74 
 
 
274 aa  99.8  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0309695 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3082  glutamine/glutamate ABC transporter, periplasmic glutamine/glutamate-binding protein  28.38 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171544  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  26.36 
 
 
275 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  30.93 
 
 
271 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4441  extracellular solute-binding protein family 3  31.12 
 
 
299 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1001  CjaA protein  27.86 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  26.84 
 
 
283 aa  97.4  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1064  surface antigen, CjaA  27.86 
 
 
279 aa  96.7  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433625  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4503  extracellular solute-binding protein family 3  31.12 
 
 
299 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101015  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0228  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 
292 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.946575  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  26.4 
 
 
273 aa  95.1  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0806  CjaA protein  27.36 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.834  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  27.71 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  26.13 
 
 
340 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 
332 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0717  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.13 
 
 
266 aa  92.8  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00506919  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 
250 aa  93.2  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.89 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 
324 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 
270 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3481  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 
274 aa  92.4  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742913  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2029  extracellular solute-binding protein family 3  25.66 
 
 
275 aa  90.1  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00497658  hitchhiker  0.00148627 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1935  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.37 
 
 
288 aa  90.5  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  27.5 
 
 
318 aa  89.7  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 
276 aa  89  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3379  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 
278 aa  89  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0252504  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2669  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00514827  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1164  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  31.03 
 
 
264 aa  87.8  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00378552  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  25.6 
 
 
275 aa  86.7  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0965  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 
280 aa  86.3  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000439884  n/a   
 
 
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.34 
 
 
287 aa  86.7  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1118  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.19 
 
 
277 aa  86.7  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 
295 aa  85.5  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 
247 aa  85.1  9e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0290  acriflavine resistance protein  25.57 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  26.88 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0691  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344886  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5536  extracellular solute-binding protein family 3  27.5 
 
 
279 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.901177  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4582  extracellular solute-binding protein family 3  24.23 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000918358  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.77 
 
 
272 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0122  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.12 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1539  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.9 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4525  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.335654  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4546  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322856  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0774  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220084  hitchhiker  0.00138708 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0664  surface antigen, CjaA  25.99 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0251747  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  26.07 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0520  amino acid  27.27 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  26.82 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3092  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 
282 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.559619  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0438  antigenic protein  28.42 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.657093  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1624  extracellular solute-binding protein family 3  23.2 
 
 
344 aa  82  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.467611  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  28.16 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5258  extracellular solute-binding protein family 3  27.72 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.677856  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3951  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.87 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2222  glutamine ABC transporter (glutamine-binding protein)  25.57 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.61 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0094  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.43 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.546217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>