More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_14100 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1253  putative amino acid-binding protein  95.89 
 
 		 341 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14100  putative amino acid-binding protein  100 
 
 		 341 aa  698    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.111954  normal  0.0628834 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3560  extracellular solute-binding protein  69.59 
 
 		 342 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.801082 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1072  extracellular solute-binding protein  64.33 
 
 		 342 aa  488  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1255  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  64.04 
 
 		 342 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1297  general amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  66.77 
 
 		 342 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0904  extracellular solute-binding protein  67.08 
 
 		 342 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.700259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4428  extracellular solute-binding protein  66.46 
 
 		 342 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4552  extracellular solute-binding protein  66.15 
 
 		 342 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0229  extracellular solute-binding protein family 3  63.96 
 
 		 341 aa  465  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0973  extracellular solute-binding protein  62.68 
 
 		 343 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.846042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3857  extracellular solute-binding protein family 3  65.62 
 
 		 343 aa  462  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.164094  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3701  extracellular solute-binding protein family 3  63.96 
 
 		 343 aa  458  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3707  extracellular solute-binding protein  62.76 
 
 		 341 aa  455  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.371845 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0233  extracellular solute-binding protein family 3  62.76 
 
 		 341 aa  457  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3754  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  64.38 
 
 		 341 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.248765  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3462  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  64.69 
 
 		 341 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0438  extracellular solute-binding protein  64.69 
 
 		 341 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.503691 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4587  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  64.38 
 
 		 341 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3563  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  64.69 
 
 		 341 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3652  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  64.38 
 
 		 341 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03126  predicted amino-acid transporter subunit  63.93 
 
 		 305 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03077  hypothetical protein  63.93 
 
 		 305 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1004  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  61.11 
 
 		 340 aa  427  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.670148  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02361  hypothetical protein  55.56 
 
 		 350 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1113  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  57.36 
 
 		 340 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2818  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  58.18 
 
 		 337 aa  408  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2822  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  58.18 
 
 		 337 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1760  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  56.46 
 
 		 341 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003418  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  55.26 
 
 		 342 aa  404  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.49248  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0948  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  57.94 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0890  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  57.94 
 
 		 339 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2549  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  56.93 
 
 		 350 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216585  normal  0.482695 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2558  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  58.38 
 
 		 338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1108  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  57.78 
 
 		 341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1563  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  55.69 
 
 		 341 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0975  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  58.86 
 
 		 342 aa  402  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0561977  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2912  extracellular solute-binding protein  58.62 
 
 		 337 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.392971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6377  extracellular solute-binding protein family 3  56.02 
 
 		 337 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1529  extracellular solute-binding protein  57.01 
 
 		 346 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2071  extracellular solute-binding protein  56.48 
 
 		 344 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0757625  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2832  extracellular solute-binding protein family 3  57.06 
 
 		 353 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169864  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0736  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  55.23 
 
 		 343 aa  395  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1705  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  57.06 
 
 		 340 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.402619 
 
 
-
 
NC_004310  BR0741  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  55.23 
 
 		 343 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1406  extracellular solute-binding protein  55.86 
 
 		 339 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2057  general L-amino acid-binding periplasmic protein precursor  55.15 
 
 		 342 aa  395  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5870  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  57.37 
 
 		 340 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.297557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3923  putative amino-acid ABC transporter, substrate-binding protein  55.86 
 
 		 338 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2557  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  55.52 
 
 		 343 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.584097  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0120  extracellular solute-binding protein  54.55 
 
 		 342 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2551  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  57.73 
 
 		 341 aa  388  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4546  extracellular solute-binding protein  54.49 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1602  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  53.47 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4393  extracellular solute-binding protein  54.75 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2324  extracellular solute-binding protein  53.15 
 
 		 344 aa  371  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2946  extracellular solute-binding protein family 3  55.03 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2579  extracellular solute-binding protein  55.73 
 
 		 336 aa  362  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.171917  normal  0.200935 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2503  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  51.48 
 
 		 338 aa  360  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1747  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, periplasmic substrate-binding protein  53.65 
 
 		 338 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.913718  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2892  extracellular solute-binding protein  52.06 
 
 		 345 aa  359  3e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0042428 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0393  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  53.33 
 
 		 338 aa  359  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0323019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2984  extracellular solute-binding protein  55.35 
 
 		 367 aa  359  4e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47136 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1640  extracellular solute-binding protein  53.7 
 
 		 337 aa  359  4e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.521048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0705  general L-amino acid-binding periplasmic protein  52.06 
 
 		 345 aa  357  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4484  extracellular solute-binding protein  54.29 
 
 		 335 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0793  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  52.37 
 
 		 341 aa  355  5.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0819733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3679  extracellular solute-binding protein  51.75 
 
 		 345 aa  353  2e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.520079  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4673  extracellular solute-binding protein  52.06 
 
 		 341 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4382  extracellular solute-binding protein  52.38 
 
 		 341 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.98504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5283  extracellular solute-binding protein family 3  51.75 
 
 		 344 aa  346  4e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2136  extracellular solute-binding protein  51.89 
 
 		 339 aa  343  2.9999999999999997e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0627  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  50.59 
 
 		 338 aa  338  7e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0318  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transporter  53.35 
 
 		 338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.762797 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7860  extracellular solute-binding protein family 3  48.49 
 
 		 341 aa  335  5e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3606  extracellular solute-binding protein  49.21 
 
 		 345 aa  328  6e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020858 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0294  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  51.43 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1998  extracellular solute-binding protein  45.22 
 
 		 343 aa  317  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0149  extracellular solute-binding protein  46.46 
 
 		 343 aa  315  6e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0394116  decreased coverage  0.0000000197566 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4667  extracellular solute-binding protein family 3  45.68 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0715  extracellular solute-binding protein family 3  46.3 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.337122 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0740  extracellular solute-binding protein  43.02 
 
 		 356 aa  309  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0246  extracellular solute-binding protein  45.05 
 
 		 359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0338  extracellular solute-binding protein family 3  44.48 
 
 		 389 aa  305  6e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000810551  normal  0.021176 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4005  extracellular solute-binding protein  44.2 
 
 		 389 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431376  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2522  family 1 extracellular solute-binding protein  43.66 
 
 		 355 aa  303  3.0000000000000004e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1454  extracellular solute-binding protein  43.89 
 
 		 389 aa  302  7.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.758875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2086  extracellular solute-binding protein family 3  42.9 
 
 		 363 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2062  extracellular solute-binding protein family 3  42.9 
 
 		 363 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4094  extracellular solute-binding protein  44.58 
 
 		 339 aa  299  5e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0267267 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0779  extracellular solute-binding protein  45.51 
 
 		 350 aa  298  6e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2051  extracellular solute-binding protein  44.31 
 
 		 347 aa  289  4e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4179  extracellular solute-binding protein family 3  44.38 
 
 		 350 aa  286  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5881  extracellular solute-binding protein  44.92 
 
 		 345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3397  hypothetical protein  48.43 
 
 		 345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167886  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3988  extracellular solute-binding protein family 3  43.77 
 
 		 350 aa  282  7.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3587  extracellular solute-binding protein  43.93 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0949603 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2415  extracellular solute-binding protein  45.4 
 
 		 365 aa  278  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12151  ABC transporter for amino acids, substrate binding protein  42.06 
 
 		 349 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14271  extracellular solute-binding protein  38.39 
 
 		 353 aa  272  7e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>