More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3405 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3405  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 276 aa  567  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.855565 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3456  extracellular solute-binding protein family 3  65.93 
 
 		 272 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2648  extracellular solute-binding protein family 3  65.93 
 
 		 272 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4441  extracellular solute-binding protein family 3  38.91 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4503  extracellular solute-binding protein family 3  38.91 
 
 		 299 aa  205  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2874  extracellular solute-binding protein family 3  40.78 
 
 		 298 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0774  extracellular solute-binding protein  40.16 
 
 		 303 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220084  hitchhiker  0.00138708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2671  extracellular solute-binding protein family 3  38.06 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3433  extracellular solute-binding protein family 3  37.9 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3008  extracellular solute-binding protein family 3  36.77 
 
 		 243 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3766  extracellular solute-binding protein family 3  33.2 
 
 		 300 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1492  extracellular solute-binding protein family 3  37.17 
 
 		 302 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.315517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3640  extracellular solute-binding protein family 3  31.35 
 
 		 303 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.906324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1465  extracellular solute-binding protein family 3  37.17 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3279  extracellular solute-binding protein family 3  32.71 
 
 		 295 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2138  extracellular solute-binding protein family 3  31.52 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.670173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3636  extracellular solute-binding protein family 3  29.96 
 
 		 306 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 		 295 aa  122  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2573  extracellular solute-binding protein  33.2 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0113062 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0597  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic ligand binding protein  31.6 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.857613  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3362  extracellular solute-binding protein family 3  31.2 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00667639  hitchhiker  0.00000266778 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2971  extracellular solute-binding protein family 3  30 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.871919  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3983  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0683  glutamate and aspartate transporter subunit  30 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0676  glutamate and aspartate transporter subunit  30 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1546  extracellular solute-binding protein family 3  31.3 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0709  glutamate and aspartate transporter subunit  29.76 
 
 		 302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0723  glutamate and aspartate transporter subunit  29.76 
 
 		 302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0783  glutamate and aspartate transporter subunit  29.76 
 
 		 302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2073  extracellular solute-binding protein family 3  31.87 
 
 		 307 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00884653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2466  extracellular solute-binding protein family 3  31.87 
 
 		 307 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0819  glutamate and aspartate transporter subunit  29.76 
 
 		 302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0770  glutamate and aspartate transporter subunit  29.76 
 
 		 302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0070  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 		 293 aa  108  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0700  glutamate and aspartate transporter subunit  29.76 
 
 		 302 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00623  glutamate and aspartate transporter subunit  29.6 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0748  glutamate and aspartate transporter subunit  29.6 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2990  glutamate and aspartate transporter subunit  29.6 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00613  hypothetical protein  29.6 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1475  extracellular solute-binding protein family 3  29.68 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.027912  hitchhiker  0.000000000119497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2261  putative amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  32.54 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0396  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0304  solute-binding family 1 protein  31.3 
 
 		 299 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0214  solute-binding family 1 protein  31.3 
 
 		 299 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1669  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  31.3 
 
 		 299 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2212  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  31.08 
 
 		 359 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1237  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  31.3 
 
 		 299 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688343  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0949  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  30.74 
 
 		 298 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1934  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  30.74 
 
 		 298 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4737  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 		 296 aa  105  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2361  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114762  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4583  glutamate/aspartate ABC transporter periplasmic solute-binding protein  28.93 
 
 		 304 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.8955  decreased coverage  0.00199709 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1214  glutamate and aspartate transporter subunit  28.15 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839124  normal  0.912461 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4709  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866037  normal  0.0243654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46910  putative binding protein component of ABC transporter  30.16 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00378951 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1937  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990957 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1103  extracellular solute-binding protein family 3  28.4 
 
 		 298 aa  102  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1182  glutamate and aspartate transporter subunit  28.57 
 
 		 301 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0990  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 		 304 aa  102  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2953  extracellular solute-binding protein family 3  29.55 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1071  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.1 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.727682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2920  glutamate and aspartate transporter subunit  28 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.847133  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6104  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236954  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1100  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  0.827755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4043  putative ABC transporter binding protein subunit  29.76 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3010  glutamate and aspartate transporter subunit  28 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.197195  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0334  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 		 330 aa  101  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1835  glutamate and aspartate transporter subunit  28 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3666  extracellular solute-binding protein family 3  29.74 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0303  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic binding protein GltI  29.1 
 
 		 319 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2089  extracellular solute-binding protein  29.77 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.881502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2714  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.784297 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4341  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0342  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1112  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 305 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.455507 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3343  extracellular solute-binding protein family 3  29.37 
 
 		 301 aa  99.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67130  putative binding protein component of ABC transporter  28.47 
 
 		 299 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4171  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.71 
 
 		 308 aa  99  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2170  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 304 aa  99  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0222  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  29.67 
 
 		 299 aa  99  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2212  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 330 aa  99  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0682  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 334 aa  98.6  9e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0590  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325477 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0701  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5110  extracellular solute-binding protein family 3  30.43 
 
 		 295 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738161 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0636  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2000  extracellular solute-binding protein  28.62 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4420  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4222  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 303 aa  96.7  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453219 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3755  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.32 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0564  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4578  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 296 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.575632 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3139  glutamate and aspartate transporter subunit  28.52 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4535  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 304 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223425  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0973  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.49 
 
 		 303 aa  95.5  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00938185  normal  0.751269 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0372  extracellular solute-binding protein family 3  29.07 
 
 		 302 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.227488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5821  putative ABC transporter binding protein subunit  29.13 
 
 		 299 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0186  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 297 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.947811  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0669  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 297 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3908  extracellular solute-binding protein  30.16 
 
 		 333 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.385814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>