More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5110 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5110  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 295 aa  610  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738161 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1225  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  56.36 
 
 		 298 aa  341  7e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3434  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  56.01 
 
 		 297 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3431  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  56.01 
 
 		 328 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3396  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  56.01 
 
 		 328 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0457  extracellular solute-binding protein  54.85 
 
 		 299 aa  338  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0481  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  56.4 
 
 		 313 aa  334  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0399  extracellular solute-binding protein  55.56 
 
 		 299 aa  333  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2714  extracellular solute-binding protein  53.95 
 
 		 297 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.784297 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3755  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  53.61 
 
 		 297 aa  323  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0357  extracellular solute-binding protein family 3  55.48 
 
 		 302 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0372  extracellular solute-binding protein family 3  55.48 
 
 		 302 aa  322  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.227488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0186  extracellular solute-binding protein  53.95 
 
 		 297 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.947811  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0564  extracellular solute-binding protein  53.61 
 
 		 297 aa  322  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0669  extracellular solute-binding protein  53.95 
 
 		 297 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0636  extracellular solute-binding protein  53.95 
 
 		 297 aa  321  8e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0590  extracellular solute-binding protein  53.26 
 
 		 297 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325477 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2573  extracellular solute-binding protein  55.23 
 
 		 297 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0113062 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0597  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic ligand binding protein  54.32 
 
 		 297 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.857613  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3362  extracellular solute-binding protein family 3  54.51 
 
 		 297 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00667639  hitchhiker  0.00000266778 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07320  amino acid ABC transporter, perplasmic binding protein  54.98 
 
 		 302 aa  308  8e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3139  glutamate and aspartate transporter subunit  51.89 
 
 		 298 aa  298  5e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1560  extracellular solute-binding protein family 3  54.58 
 
 		 302 aa  298  8e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000128549  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4455  extracellular solute-binding protein  50.51 
 
 		 298 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1214  glutamate and aspartate transporter subunit  51.01 
 
 		 298 aa  295  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839124  normal  0.912461 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4081  extracellular solute-binding protein  52.57 
 
 		 298 aa  295  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3991  extracellular solute-binding protein  50.17 
 
 		 298 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.100601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1192  glutamate and aspartate transporter subunit  53.31 
 
 		 298 aa  293  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1284  extracellular solute-binding protein  49.83 
 
 		 298 aa  291  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0783  glutamate and aspartate transporter subunit  51 
 
 		 302 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2953  extracellular solute-binding protein family 3  51.61 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00623  glutamate and aspartate transporter subunit  53.14 
 
 		 302 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00613  hypothetical protein  53.14 
 
 		 302 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0770  glutamate and aspartate transporter subunit  51.92 
 
 		 302 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0819  glutamate and aspartate transporter subunit  51.92 
 
 		 302 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0709  glutamate and aspartate transporter subunit  51.92 
 
 		 302 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0723  glutamate and aspartate transporter subunit  51.92 
 
 		 302 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0700  glutamate and aspartate transporter subunit  52.77 
 
 		 302 aa  288  7e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1103  extracellular solute-binding protein family 3  50.35 
 
 		 298 aa  288  7e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0748  glutamate and aspartate transporter subunit  52.77 
 
 		 302 aa  288  8e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2990  glutamate and aspartate transporter subunit  52.77 
 
 		 302 aa  288  8e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5742  extracellular solute-binding protein  50.74 
 
 		 298 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3806  extracellular solute-binding protein  50.74 
 
 		 298 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4562  extracellular solute-binding protein  50.74 
 
 		 298 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2261  putative amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  51.96 
 
 		 308 aa  287  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0676  glutamate and aspartate transporter subunit  52.77 
 
 		 302 aa  286  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1182  glutamate and aspartate transporter subunit  50.68 
 
 		 301 aa  287  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0683  glutamate and aspartate transporter subunit  52.4 
 
 		 302 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2971  extracellular solute-binding protein family 3  52.4 
 
 		 302 aa  285  8e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.871919  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2073  extracellular solute-binding protein family 3  51.6 
 
 		 307 aa  285  8e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00884653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2466  extracellular solute-binding protein family 3  51.25 
 
 		 307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2920  glutamate and aspartate transporter subunit  50.92 
 
 		 305 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.847133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1835  glutamate and aspartate transporter subunit  50.92 
 
 		 305 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3010  glutamate and aspartate transporter subunit  50.92 
 
 		 305 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.197195  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4740  extracellular solute-binding protein  47.42 
 
 		 302 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220117  normal  0.273761 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5962  extracellular solute-binding protein family 3  48.45 
 
 		 291 aa  278  9e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0303  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic binding protein GltI  48.32 
 
 		 319 aa  277  1e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4043  putative ABC transporter binding protein subunit  49.49 
 
 		 302 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46910  putative binding protein component of ABC transporter  49.49 
 
 		 302 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00378951 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2212  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  50.55 
 
 		 359 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1934  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  50.55 
 
 		 298 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1669  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  50.55 
 
 		 299 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0214  solute-binding family 1 protein  50.55 
 
 		 299 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1237  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  50.55 
 
 		 299 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688343  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0949  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  50.55 
 
 		 298 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0304  solute-binding family 1 protein  50.55 
 
 		 299 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3908  extracellular solute-binding protein  47.96 
 
 		 333 aa  275  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6965  extracellular solute-binding protein family 3  49.82 
 
 		 312 aa  275  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4709  extracellular solute-binding protein  47.33 
 
 		 299 aa  275  8e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866037  normal  0.0243654 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0334  extracellular solute-binding protein  48.91 
 
 		 330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0701  extracellular solute-binding protein  50.74 
 
 		 302 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4171  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.91 
 
 		 308 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67130  putative binding protein component of ABC transporter  47.06 
 
 		 299 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3343  extracellular solute-binding protein family 3  45.08 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5821  putative ABC transporter binding protein subunit  46.76 
 
 		 299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3666  extracellular solute-binding protein family 3  45.36 
 
 		 301 aa  269  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0084  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  45.02 
 
 		 301 aa  267  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.767728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0222  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  49.08 
 
 		 299 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2170  extracellular solute-binding protein  47.27 
 
 		 304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0342  extracellular solute-binding protein  45.3 
 
 		 302 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0396  extracellular solute-binding protein  46.69 
 
 		 302 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1546  extracellular solute-binding protein family 3  49.08 
 
 		 295 aa  265  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2212  extracellular solute-binding protein  46.78 
 
 		 330 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2089  extracellular solute-binding protein  46.44 
 
 		 306 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.881502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0682  extracellular solute-binding protein  46.24 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4535  extracellular solute-binding protein  49.28 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223425  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5483  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  45.79 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4370  extracellular solute-binding protein  46.8 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1112  extracellular solute-binding protein  48.04 
 
 		 305 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.455507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4737  extracellular solute-binding protein  46.58 
 
 		 296 aa  255  7e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1071  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.69 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.727682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1100  extracellular solute-binding protein  47.33 
 
 		 305 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  0.827755 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4341  extracellular solute-binding protein  47.69 
 
 		 305 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2190  extracellular solute-binding protein  46.44 
 
 		 306 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0938958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4543  extracellular solute-binding protein  45.45 
 
 		 301 aa  251  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.517654  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5289  extracellular solute-binding protein  45.48 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5904  extracellular solute-binding protein  46.1 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2173  extracellular solute-binding protein  46.1 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2087  extracellular solute-binding protein  46.64 
 
 		 305 aa  249  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1937  extracellular solute-binding protein  44.98 
 
 		 295 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>