More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4514 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4514  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 286 aa  594  1e-169  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0322747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3008  extracellular solute-binding protein family 3  33.73 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2671  extracellular solute-binding protein family 3  31.85 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3433  extracellular solute-binding protein family 3  31.85 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2874  extracellular solute-binding protein family 3  29.15 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4441  extracellular solute-binding protein family 3  28.77 
 
 		 299 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4503  extracellular solute-binding protein family 3  28.77 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2648  extracellular solute-binding protein family 3  29.3 
 
 		 272 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3456  extracellular solute-binding protein family 3  29.3 
 
 		 272 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3405  extracellular solute-binding protein family 3  27.07 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.855565 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2247  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2029  extracellular solute-binding protein family 3  28.85 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00497658  hitchhiker  0.00148627 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  27.21 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  27.21 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0774  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220084  hitchhiker  0.00138708 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3766  extracellular solute-binding protein family 3  25.54 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.43 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5821  putative ABC transporter binding protein subunit  31.6 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  26.41 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04251  ABC transporter solute-binding protein  25.77 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  26.06 
 
 		 268 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  27.24 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.15 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.15 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  29.15 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  25.77 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3638  extracellular solute-binding protein family 3  31.98 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5423  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  27.72 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  25.38 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3314  extracellular solute-binding protein family 3  30.96 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.48 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.48 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  26.45 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.69 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1655  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  28.72 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.92194  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0017  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.822209  normal  0.141798 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  26.86 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.59 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  26.59 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.59 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.59 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4035  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.876944  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4191  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  26.72 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0122303 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4237  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4165  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  26.72 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.96 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3673  extracellular solute-binding protein family 3  25.36 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  23.43 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.09 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0999  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  24.9 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  26.09 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5607  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2089  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.881502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5971  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.480702  normal  0.0122202 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  24.7 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1182  glutamate and aspartate transporter subunit  26.19 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2255  extracellular solute-binding protein  33.14 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4222  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453219 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  26.59 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6471  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264761  normal  0.0842287 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4740  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220117  normal  0.273761 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2212  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67130  putative binding protein component of ABC transporter  28.84 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2971  extracellular solute-binding protein family 3  25.69 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.871919  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0676  glutamate and aspartate transporter subunit  25.69 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0683  glutamate and aspartate transporter subunit  25.69 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  24.76 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00623  glutamate and aspartate transporter subunit  25.69 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2990  glutamate and aspartate transporter subunit  25.69 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0748  glutamate and aspartate transporter subunit  25.69 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5946  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5962  extracellular solute-binding protein family 3  26.14 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0700  glutamate and aspartate transporter subunit  25.69 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00613  hypothetical protein  25.69 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1172  extracellular solute-binding protein family 3  26.51 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5289  extracellular solute-binding protein  32 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6249  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5483  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.77 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1742  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3343  extracellular solute-binding protein family 3  25.46 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>