More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2247 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2247  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 301 aa  608  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5423  extracellular solute-binding protein  66.31 
 
 		 305 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5946  extracellular solute-binding protein  50.52 
 
 		 313 aa  298  7e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6249  extracellular solute-binding protein  51.09 
 
 		 313 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1172  extracellular solute-binding protein family 3  51.08 
 
 		 306 aa  295  9e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5607  extracellular solute-binding protein  50.91 
 
 		 313 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5971  extracellular solute-binding protein  50.91 
 
 		 313 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.480702  normal  0.0122202 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6471  extracellular solute-binding protein  50.91 
 
 		 313 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264761  normal  0.0842287 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1123  extracellular solute-binding protein  47.24 
 
 		 303 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00011354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4477  extracellular solute-binding protein family 3  42.47 
 
 		 301 aa  232  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4543  extracellular solute-binding protein  41.1 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.517654  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5821  putative ABC transporter binding protein subunit  44.48 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67130  putative binding protein component of ABC transporter  43.42 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2361  extracellular solute-binding protein  45.35 
 
 		 311 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114762  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07320  amino acid ABC transporter, perplasmic binding protein  41.46 
 
 		 302 aa  219  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3315  extracellular solute-binding protein family 3  42.65 
 
 		 298 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2255  extracellular solute-binding protein  41.97 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2540  extracellular solute-binding protein  44.24 
 
 		 310 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0334  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 330 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4438  extracellular solute-binding protein family 3  41.58 
 
 		 303 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.156595 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0303  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic binding protein GltI  39.12 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1546  extracellular solute-binding protein family 3  40.38 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3638  extracellular solute-binding protein family 3  41.9 
 
 		 302 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4612  extracellular solute-binding protein family 3  41.11 
 
 		 302 aa  209  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527898  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2089  extracellular solute-binding protein  39.52 
 
 		 306 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.881502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3961  extracellular solute-binding protein  41.3 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.323027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2000  extracellular solute-binding protein  39.12 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4737  extracellular solute-binding protein  38.23 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2212  extracellular solute-binding protein  39.52 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4738  extracellular solute-binding protein  38.79 
 
 		 299 aa  205  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4329  extracellular solute-binding protein family 3  40.94 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.240432 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0897  extracellular solute-binding protein family 3  45.39 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.529927  normal  0.529014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1475  extracellular solute-binding protein family 3  39.66 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.027912  hitchhiker  0.000000000119497 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6104  extracellular solute-binding protein  40.79 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236954  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1071  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.93 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.727682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1100  extracellular solute-binding protein  40.29 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  0.827755 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0372  extracellular solute-binding protein family 3  38.32 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.227488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4370  extracellular solute-binding protein  36.15 
 
 		 303 aa  202  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1937  extracellular solute-binding protein  37.8 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990957 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3314  extracellular solute-binding protein family 3  40.36 
 
 		 302 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0826  extracellular solute-binding protein family 3  44.65 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0682  extracellular solute-binding protein  39.07 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5289  extracellular solute-binding protein  42.18 
 
 		 300 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46910  putative binding protein component of ABC transporter  39.72 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00378951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4043  putative ABC transporter binding protein subunit  39.72 
 
 		 302 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5962  extracellular solute-binding protein family 3  39.3 
 
 		 291 aa  202  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0357  extracellular solute-binding protein family 3  37.96 
 
 		 302 aa  201  9e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305977  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05478  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  42.75 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0070  extracellular solute-binding protein  39.78 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1112  extracellular solute-binding protein  39.57 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.455507 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1127  extracellular solute-binding protein  38.51 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.164793  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1214  glutamate and aspartate transporter subunit  36.36 
 
 		 298 aa  198  9e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839124  normal  0.912461 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0973  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  38.57 
 
 		 303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00938185  normal  0.751269 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3908  extracellular solute-binding protein  38.26 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0399  extracellular solute-binding protein  36.69 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0481  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  36.3 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4341  extracellular solute-binding protein  38.49 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0457  extracellular solute-binding protein  35.49 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  38.97 
 
 		 299 aa  195  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0084  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  36.39 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.767728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2798  extracellular solute-binding protein  38.52 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.610128  normal  0.6873 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2170  extracellular solute-binding protein  39.37 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2087  extracellular solute-binding protein  36.73 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6965  extracellular solute-binding protein family 3  37.04 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2190  extracellular solute-binding protein  39.18 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0938958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1103  extracellular solute-binding protein family 3  37.32 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0608  extracellular solute-binding protein  43.17 
 
 		 296 aa  192  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3991  extracellular solute-binding protein  37.11 
 
 		 298 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.100601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0587  extracellular solute-binding protein family 3  43.17 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0597  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic ligand binding protein  37.04 
 
 		 297 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.857613  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3139  glutamate and aspartate transporter subunit  36.03 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4171  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.63 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2573  extracellular solute-binding protein  36.67 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0113062 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3396  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  35.21 
 
 		 328 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3434  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  35.21 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1560  extracellular solute-binding protein family 3  37.96 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000128549  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1225  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  35.21 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905296  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4740  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220117  normal  0.273761 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5904  extracellular solute-binding protein  38.83 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2173  extracellular solute-binding protein  38.83 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3431  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  35.21 
 
 		 328 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1237  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  38.43 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688343  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1669  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  38.43 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0214  solute-binding family 1 protein  38.43 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4455  extracellular solute-binding protein  36.77 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0304  solute-binding family 1 protein  38.43 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4578  extracellular solute-binding protein  41.13 
 
 		 296 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.575632 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1934  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  38.43 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2212  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  38.43 
 
 		 359 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3343  extracellular solute-binding protein family 3  34.81 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0949  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  38.43 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5483  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  36.64 
 
 		 306 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1284  extracellular solute-binding protein  36.39 
 
 		 298 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0396  extracellular solute-binding protein  36.45 
 
 		 302 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0906  extracellular solute-binding protein  37.27 
 
 		 304 aa  188  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.425834  normal  0.179529 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4081  extracellular solute-binding protein  36.68 
 
 		 298 aa  188  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3362  extracellular solute-binding protein family 3  36.3 
 
 		 297 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00667639  hitchhiker  0.00000266778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4420  extracellular solute-binding protein  39.22 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4074  extracellular solute-binding protein  41.99 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3666  extracellular solute-binding protein family 3  34.81 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>