More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0587 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0587  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 296 aa  614  1e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0608  extracellular solute-binding protein  99.32 
 
 		 296 aa  611  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4420  extracellular solute-binding protein  67.11 
 
 		 297 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4074  extracellular solute-binding protein  63.64 
 
 		 314 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2361  extracellular solute-binding protein  53.73 
 
 		 311 aa  295  7e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114762  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2540  extracellular solute-binding protein  52.61 
 
 		 310 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0973  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  46.96 
 
 		 303 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00938185  normal  0.751269 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3315  extracellular solute-binding protein family 3  49.25 
 
 		 298 aa  275  9e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05478  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  47.39 
 
 		 298 aa  266  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0897  extracellular solute-binding protein family 3  49.64 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.529927  normal  0.529014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0826  extracellular solute-binding protein family 3  49.64 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3314  extracellular solute-binding protein family 3  45.96 
 
 		 302 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3638  extracellular solute-binding protein family 3  45.19 
 
 		 302 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1546  extracellular solute-binding protein family 3  45.26 
 
 		 295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4737  extracellular solute-binding protein  43.82 
 
 		 296 aa  241  9e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  42.7 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2255  extracellular solute-binding protein  44.94 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4477  extracellular solute-binding protein family 3  44.06 
 
 		 301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4543  extracellular solute-binding protein  41.96 
 
 		 301 aa  231  9e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.517654  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1937  extracellular solute-binding protein  41.67 
 
 		 295 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990957 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2000  extracellular solute-binding protein  42.56 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0334  extracellular solute-binding protein  41.03 
 
 		 330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2089  extracellular solute-binding protein  40.21 
 
 		 306 aa  225  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.881502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07320  amino acid ABC transporter, perplasmic binding protein  40.89 
 
 		 302 aa  225  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0682  extracellular solute-binding protein  40.58 
 
 		 334 aa  225  8e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3983  extracellular solute-binding protein  40.91 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2212  extracellular solute-binding protein  39.86 
 
 		 330 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3362  extracellular solute-binding protein family 3  40.79 
 
 		 297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00667639  hitchhiker  0.00000266778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0070  extracellular solute-binding protein  42.59 
 
 		 293 aa  221  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0303  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic binding protein GltI  39.93 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0597  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic ligand binding protein  40.43 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.857613  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2573  extracellular solute-binding protein  40.43 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0113062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4043  putative ABC transporter binding protein subunit  39.72 
 
 		 302 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46910  putative binding protein component of ABC transporter  39.37 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00378951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4738  extracellular solute-binding protein  37.72 
 
 		 299 aa  216  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2714  extracellular solute-binding protein  39.66 
 
 		 297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.784297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4438  extracellular solute-binding protein family 3  40.59 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.156595 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2087  extracellular solute-binding protein  38.13 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2170  extracellular solute-binding protein  38.81 
 
 		 304 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1123  extracellular solute-binding protein  39.57 
 
 		 303 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00011354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5962  extracellular solute-binding protein family 3  37.59 
 
 		 291 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3961  extracellular solute-binding protein  40.79 
 
 		 303 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.323027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4583  glutamate/aspartate ABC transporter periplasmic solute-binding protein  40.15 
 
 		 304 aa  211  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.8955  decreased coverage  0.00199709 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4171  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.78 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4370  extracellular solute-binding protein  37.94 
 
 		 303 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1475  extracellular solute-binding protein family 3  39.72 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.027912  hitchhiker  0.000000000119497 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4329  extracellular solute-binding protein family 3  40.43 
 
 		 303 aa  209  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.240432 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5904  extracellular solute-binding protein  38.83 
 
 		 306 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2173  extracellular solute-binding protein  38.83 
 
 		 306 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2190  extracellular solute-binding protein  38.83 
 
 		 306 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0938958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3908  extracellular solute-binding protein  38.68 
 
 		 333 aa  208  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4535  extracellular solute-binding protein  40.51 
 
 		 304 aa  208  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223425  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0396  extracellular solute-binding protein  37.85 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3755  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  38.28 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1225  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  37.24 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905296  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0186  extracellular solute-binding protein  38.62 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.947811  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0669  extracellular solute-binding protein  38.62 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0636  extracellular solute-binding protein  38.62 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3434  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  37.24 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4024  extracellular solute-binding protein  37.85 
 
 		 298 aa  206  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000078041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0342  extracellular solute-binding protein  37.41 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4740  extracellular solute-binding protein  37.67 
 
 		 302 aa  205  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220117  normal  0.273761 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0783  glutamate and aspartate transporter subunit  39.24 
 
 		 302 aa  205  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1103  extracellular solute-binding protein family 3  40.3 
 
 		 298 aa  205  7e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3431  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  37.24 
 
 		 328 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3396  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  37.24 
 
 		 328 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0457  extracellular solute-binding protein  35.64 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1192  glutamate and aspartate transporter subunit  40.22 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0564  extracellular solute-binding protein  37.59 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4612  extracellular solute-binding protein family 3  35.69 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527898  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1214  glutamate and aspartate transporter subunit  38.3 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839124  normal  0.912461 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3139  glutamate and aspartate transporter subunit  38.41 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2798  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 305 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.610128  normal  0.6873 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0770  glutamate and aspartate transporter subunit  39.02 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0819  glutamate and aspartate transporter subunit  39.02 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0590  extracellular solute-binding protein  36.49 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325477 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0709  glutamate and aspartate transporter subunit  39.02 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0723  glutamate and aspartate transporter subunit  39.02 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0399  extracellular solute-binding protein  36.14 
 
 		 299 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3991  extracellular solute-binding protein  37.93 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.100601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0443  amino-acid ABC transporter binding protein  40.62 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398144  normal  0.303306 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0700  glutamate and aspartate transporter subunit  38.38 
 
 		 302 aa  202  7e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00623  glutamate and aspartate transporter subunit  38.43 
 
 		 302 aa  201  8e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00613  hypothetical protein  38.43 
 
 		 302 aa  201  8e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4455  extracellular solute-binding protein  37.93 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3563  extracellular solute-binding protein  39.27 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0748  glutamate and aspartate transporter subunit  38.43 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2990  glutamate and aspartate transporter subunit  38.43 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2953  extracellular solute-binding protein family 3  39.41 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5673  extracellular solute-binding protein  36.3 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1182  glutamate and aspartate transporter subunit  37.41 
 
 		 301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5483  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  36.24 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3904  extracellular solute-binding protein  39.34 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000111161  normal  0.107896 
 
 
 
NC_007336  Reut_C6104  extracellular solute-binding protein  39.35 
 
 		 289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236954  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0357  extracellular solute-binding protein family 3  38.29 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5607  extracellular solute-binding protein  39.46 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5971  extracellular solute-binding protein  39.46 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.480702  normal  0.0122202 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0372  extracellular solute-binding protein family 3  38.29 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.227488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0676  glutamate and aspartate transporter subunit  37.92 
 
 		 302 aa  199  7e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1127  extracellular solute-binding protein  40.82 
 
 		 297 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.164793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>