More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3563 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3563  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 301 aa  619  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6783  extracellular solute-binding protein family 3  63.64 
 
 		 305 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4477  extracellular solute-binding protein family 3  59.2 
 
 		 301 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4543  extracellular solute-binding protein  59.4 
 
 		 301 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.517654  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2255  extracellular solute-binding protein  60.93 
 
 		 307 aa  364  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4438  extracellular solute-binding protein family 3  59.15 
 
 		 303 aa  359  3e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.156595 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2087  extracellular solute-binding protein  59.01 
 
 		 305 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3961  extracellular solute-binding protein  58.8 
 
 		 303 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.323027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4329  extracellular solute-binding protein family 3  58.8 
 
 		 303 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.240432 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4370  extracellular solute-binding protein  52.68 
 
 		 303 aa  334  9e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4043  putative ABC transporter binding protein subunit  48.12 
 
 		 302 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46910  putative binding protein component of ABC transporter  48.12 
 
 		 302 aa  281  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00378951 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1225  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  46.88 
 
 		 298 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905296  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3431  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  46.53 
 
 		 328 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3434  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  46.53 
 
 		 297 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3396  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  46.53 
 
 		 328 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2714  extracellular solute-binding protein  45.83 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.784297 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3755  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  45.49 
 
 		 297 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0334  extracellular solute-binding protein  46.59 
 
 		 330 aa  271  7e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0303  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic binding protein GltI  46.07 
 
 		 319 aa  270  2e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0186  extracellular solute-binding protein  46.05 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.947811  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0564  extracellular solute-binding protein  44.79 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0669  extracellular solute-binding protein  46.05 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0636  extracellular solute-binding protein  46.05 
 
 		 297 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0590  extracellular solute-binding protein  44.44 
 
 		 297 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325477 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3991  extracellular solute-binding protein  47.52 
 
 		 298 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.100601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07320  amino acid ABC transporter, perplasmic binding protein  47.62 
 
 		 302 aa  266  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4455  extracellular solute-binding protein  47.52 
 
 		 298 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3908  extracellular solute-binding protein  45.58 
 
 		 333 aa  265  8e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4081  extracellular solute-binding protein  47.62 
 
 		 298 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0457  extracellular solute-binding protein  44.56 
 
 		 299 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4171  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.1 
 
 		 308 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0597  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic ligand binding protein  46.55 
 
 		 297 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.857613  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4738  extracellular solute-binding protein  44.48 
 
 		 299 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5962  extracellular solute-binding protein family 3  46.62 
 
 		 291 aa  262  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2573  extracellular solute-binding protein  46.55 
 
 		 297 aa  262  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0113062 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1560  extracellular solute-binding protein family 3  45.49 
 
 		 302 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000128549  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3362  extracellular solute-binding protein family 3  46.18 
 
 		 297 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00667639  hitchhiker  0.00000266778 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5742  extracellular solute-binding protein  46.15 
 
 		 298 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3806  extracellular solute-binding protein  46.15 
 
 		 298 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4562  extracellular solute-binding protein  46.15 
 
 		 298 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1284  extracellular solute-binding protein  44.9 
 
 		 298 aa  258  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0481  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  44.86 
 
 		 313 aa  258  8e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2798  extracellular solute-binding protein  46.47 
 
 		 305 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.610128  normal  0.6873 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0682  extracellular solute-binding protein  44.13 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0399  extracellular solute-binding protein  43.88 
 
 		 299 aa  257  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4612  extracellular solute-binding protein family 3  44.36 
 
 		 302 aa  256  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527898  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2170  extracellular solute-binding protein  45.18 
 
 		 304 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4740  extracellular solute-binding protein  44.85 
 
 		 302 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220117  normal  0.273761 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2212  extracellular solute-binding protein  46.53 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3139  glutamate and aspartate transporter subunit  44.75 
 
 		 298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4535  extracellular solute-binding protein  46.1 
 
 		 304 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223425  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0396  extracellular solute-binding protein  44.22 
 
 		 302 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5821  putative ABC transporter binding protein subunit  45.45 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0357  extracellular solute-binding protein family 3  43.62 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2089  extracellular solute-binding protein  44.97 
 
 		 306 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.881502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0372  extracellular solute-binding protein family 3  43.62 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.227488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67130  putative binding protein component of ABC transporter  44.83 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3343  extracellular solute-binding protein family 3  42.41 
 
 		 301 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5483  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  44.9 
 
 		 306 aa  249  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3666  extracellular solute-binding protein family 3  42.51 
 
 		 301 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2953  extracellular solute-binding protein family 3  43.88 
 
 		 297 aa  249  4e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0342  extracellular solute-binding protein  44.93 
 
 		 302 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0084  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  42.56 
 
 		 301 aa  248  7e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.767728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3932  extracellular solute-binding protein family 3  42.46 
 
 		 297 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1214  glutamate and aspartate transporter subunit  43.77 
 
 		 298 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839124  normal  0.912461 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2190  extracellular solute-binding protein  45.92 
 
 		 306 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0938958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1192  glutamate and aspartate transporter subunit  43.06 
 
 		 298 aa  246  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4737  extracellular solute-binding protein  43.62 
 
 		 296 aa  244  9e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6965  extracellular solute-binding protein family 3  44.57 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0222  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  44.85 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0949  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  44.07 
 
 		 298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1934  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  44.07 
 
 		 298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5904  extracellular solute-binding protein  45.24 
 
 		 306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2173  extracellular solute-binding protein  45.24 
 
 		 306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0304  solute-binding family 1 protein  44.07 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1669  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  44.07 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2212  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  44.07 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0214  solute-binding family 1 protein  44.07 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1237  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  44.07 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5289  extracellular solute-binding protein  44.14 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3601  extracellular solute-binding protein family 3  43.27 
 
 		 304 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0485295  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1546  extracellular solute-binding protein family 3  44.4 
 
 		 295 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1071  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  44.26 
 
 		 306 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.727682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0205  extracellular solute-binding protein  42.21 
 
 		 305 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1112  extracellular solute-binding protein  44.26 
 
 		 305 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.455507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4341  extracellular solute-binding protein  43.58 
 
 		 305 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4709  extracellular solute-binding protein  42.75 
 
 		 299 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866037  normal  0.0243654 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2000  extracellular solute-binding protein  43.42 
 
 		 294 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1103  extracellular solute-binding protein family 3  42.59 
 
 		 298 aa  235  8e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0783  glutamate and aspartate transporter subunit  41.44 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2920  glutamate and aspartate transporter subunit  40.33 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.847133  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1182  glutamate and aspartate transporter subunit  41.61 
 
 		 301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1835  glutamate and aspartate transporter subunit  40.33 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3010  glutamate and aspartate transporter subunit  40.33 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.197195  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5110  extracellular solute-binding protein family 3  44.3 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738161 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00623  glutamate and aspartate transporter subunit  42.59 
 
 		 302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00613  hypothetical protein  42.59 
 
 		 302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2990  glutamate and aspartate transporter subunit  42.59 
 
 		 302 aa  232  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0723  glutamate and aspartate transporter subunit  41.99 
 
 		 302 aa  232  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>