More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5673 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5673  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 299 aa  616  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0311  extracellular solute-binding protein family 3  70.85 
 
 		 301 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0788  extracellular solute-binding protein  55.91 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00176914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4024  extracellular solute-binding protein  62.28 
 
 		 298 aa  360  2e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000078041 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2688  extracellular solute-binding protein  54.93 
 
 		 300 aa  335  3.9999999999999995e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.606467 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3904  extracellular solute-binding protein  58.19 
 
 		 298 aa  332  5e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000111161  normal  0.107896 
 
 
 
NC_009379  Pnuc_0990  extracellular solute-binding protein  55.56 
 
 		 304 aa  325  4.0000000000000003e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0609  extracellular solute-binding protein  57.14 
 
 		 299 aa  321  7e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.157443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3458  extracellular solute-binding protein  54.13 
 
 		 299 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0588  extracellular solute-binding protein family 3  57.14 
 
 		 299 aa  317  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4073  extracellular solute-binding protein  56.69 
 
 		 300 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0443  amino-acid ABC transporter binding protein  54.08 
 
 		 297 aa  310  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398144  normal  0.303306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1364  extracellular solute-binding protein  55.44 
 
 		 299 aa  308  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0828  extracellular solute-binding protein family 3  54.84 
 
 		 300 aa  305  6e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1219  extracellular solute-binding protein  51.16 
 
 		 373 aa  301  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5026  extracellular solute-binding protein family 3  51.82 
 
 		 303 aa  286  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4738  extracellular solute-binding protein  47.32 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4737  extracellular solute-binding protein  48.3 
 
 		 296 aa  276  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0659  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  45.27 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147361  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0691  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  45.27 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000300559  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0658  putative glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein/periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  44.88 
 
 		 460 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000641362  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1546  extracellular solute-binding protein family 3  48.91 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4612  extracellular solute-binding protein family 3  48.91 
 
 		 302 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527898  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3431  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  47.49 
 
 		 328 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3434  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  47.49 
 
 		 297 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3396  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  47.49 
 
 		 328 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1225  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  47.16 
 
 		 298 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905296  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3991  extracellular solute-binding protein  43.73 
 
 		 298 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.100601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1284  extracellular solute-binding protein  43.73 
 
 		 298 aa  262  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4455  extracellular solute-binding protein  43.73 
 
 		 298 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2798  extracellular solute-binding protein  47.6 
 
 		 305 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.610128  normal  0.6873 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4081  extracellular solute-binding protein  45.08 
 
 		 298 aa  258  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2714  extracellular solute-binding protein  46.15 
 
 		 297 aa  256  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.784297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1214  glutamate and aspartate transporter subunit  44.26 
 
 		 298 aa  256  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839124  normal  0.912461 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07320  amino acid ABC transporter, perplasmic binding protein  45.14 
 
 		 302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0457  extracellular solute-binding protein  43.33 
 
 		 299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3601  extracellular solute-binding protein family 3  49.64 
 
 		 304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0485295  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0597  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic ligand binding protein  47.35 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.857613  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0564  extracellular solute-binding protein  45.82 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3755  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  45.82 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0590  extracellular solute-binding protein  45.48 
 
 		 297 aa  252  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3362  extracellular solute-binding protein family 3  47 
 
 		 297 aa  251  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00667639  hitchhiker  0.00000266778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3932  extracellular solute-binding protein family 3  43.92 
 
 		 297 aa  251  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0636  extracellular solute-binding protein  45.48 
 
 		 297 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0303  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic binding protein GltI  44.75 
 
 		 319 aa  251  9.000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2000  extracellular solute-binding protein  44.44 
 
 		 294 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0186  extracellular solute-binding protein  45.48 
 
 		 297 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.947811  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0669  extracellular solute-binding protein  45.48 
 
 		 297 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2089  extracellular solute-binding protein  44.29 
 
 		 306 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.881502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3139  glutamate and aspartate transporter subunit  43.64 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5483  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  43.29 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0334  extracellular solute-binding protein  47.58 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2212  extracellular solute-binding protein  43.6 
 
 		 330 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5742  extracellular solute-binding protein  44.07 
 
 		 298 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3806  extracellular solute-binding protein  44.07 
 
 		 298 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4562  extracellular solute-binding protein  44.07 
 
 		 298 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1937  extracellular solute-binding protein  44.3 
 
 		 295 aa  248  7e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990957 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0481  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  43.88 
 
 		 313 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0399  extracellular solute-binding protein  43.05 
 
 		 299 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2573  extracellular solute-binding protein  45.94 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0113062 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1192  glutamate and aspartate transporter subunit  44.17 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2953  extracellular solute-binding protein family 3  44.17 
 
 		 297 aa  245  8e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0205  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4740  extracellular solute-binding protein  42.81 
 
 		 302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220117  normal  0.273761 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3666  extracellular solute-binding protein family 3  42.12 
 
 		 301 aa  242  6e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0682  extracellular solute-binding protein  44.14 
 
 		 334 aa  241  7.999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5904  extracellular solute-binding protein  43.6 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2173  extracellular solute-binding protein  43.6 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0396  extracellular solute-binding protein  41.84 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2190  extracellular solute-binding protein  43.25 
 
 		 306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0938958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1103  extracellular solute-binding protein family 3  44.37 
 
 		 298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0372  extracellular solute-binding protein family 3  42.35 
 
 		 302 aa  238  9e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.227488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4709  extracellular solute-binding protein  43.62 
 
 		 299 aa  238  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866037  normal  0.0243654 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0701  extracellular solute-binding protein  45.22 
 
 		 302 aa  238  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0084  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  40.07 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.767728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5962  extracellular solute-binding protein family 3  40.07 
 
 		 291 aa  237  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0357  extracellular solute-binding protein family 3  42.35 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0070  extracellular solute-binding protein  44.65 
 
 		 293 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4043  putative ABC transporter binding protein subunit  44.33 
 
 		 302 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4543  extracellular solute-binding protein  42.65 
 
 		 301 aa  235  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.517654  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46910  putative binding protein component of ABC transporter  44 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00378951 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0723  glutamate and aspartate transporter subunit  43.1 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0783  glutamate and aspartate transporter subunit  43.1 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1182  glutamate and aspartate transporter subunit  42.14 
 
 		 301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0709  glutamate and aspartate transporter subunit  43.1 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3343  extracellular solute-binding protein family 3  41.99 
 
 		 301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0770  glutamate and aspartate transporter subunit  43.1 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0700  glutamate and aspartate transporter subunit  44.57 
 
 		 302 aa  232  5e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0819  glutamate and aspartate transporter subunit  42.76 
 
 		 302 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00623  glutamate and aspartate transporter subunit  44.69 
 
 		 302 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00613  hypothetical protein  44.69 
 
 		 302 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1100  extracellular solute-binding protein  45.16 
 
 		 305 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  0.827755 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0748  glutamate and aspartate transporter subunit  44.69 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0342  extracellular solute-binding protein  40.68 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2990  glutamate and aspartate transporter subunit  44.69 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3908  extracellular solute-binding protein  41.61 
 
 		 333 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.385814 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2971  extracellular solute-binding protein family 3  44 
 
 		 302 aa  229  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.871919  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6104  extracellular solute-binding protein  40.07 
 
 		 289 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0676  glutamate and aspartate transporter subunit  44 
 
 		 302 aa  229  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0683  glutamate and aspartate transporter subunit  44 
 
 		 302 aa  228  7e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>