More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1345 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1345  CjaC  100 
 
 		 259 aa  525  1e-148  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000213382  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1729  CjaC  40.15 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  31.15 
 
 		 238 aa  125  5e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1233  CjaC  32.92 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  30.13 
 
 		 252 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000143889  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  29.17 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0834  CjaC  30.42 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0757  cjaC protein  30 
 
 		 251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.943565  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1277  cjaC protein  28.21 
 
 		 251 aa  111  9e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  31.67 
 
 		 256 aa  108  6e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  31.12 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  31.12 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  31.12 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3038  extracellular solute-binding protein  35.48 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2908  cystine transporter subunit  29.05 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647057  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  29.63 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2600  extracellular solute-binding protein  35.23 
 
 		 252 aa  105  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  29.88 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1920  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  36.78 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.541755  hitchhiker  0.00384825 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  32.69 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2377  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.31 
 
 		 243 aa  99.4  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2452  extracellular solute-binding protein family 3  28.1 
 
 		 259 aa  98.6  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  26.25 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  27.8 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.22 
 
 		 503 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 247 aa  97.1  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1655  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.15 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.568539 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  28.15 
 
 		 247 aa  95.9  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  27.5 
 
 		 266 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  27.5 
 
 		 266 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  27.5 
 
 		 266 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  29.37 
 
 		 244 aa  95.5  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.39 
 
 		 503 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  27.08 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  27.08 
 
 		 266 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  27.08 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  31.93 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  27.08 
 
 		 266 aa  94.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  30.08 
 
 		 502 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  30.08 
 
 		 502 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  31.93 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1454  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.64 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00353635  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  31.93 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3091  ABC transporter, substrate binding component  32.35 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.33 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  29.34 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.35 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  28.69 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  27.73 
 
 		 272 aa  94  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2380  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.44 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  25.83 
 
 		 266 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  25.83 
 
 		 266 aa  93.2  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  32.35 
 
 		 315 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  25.83 
 
 		 266 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3056  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  32.35 
 
 		 320 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114315  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  32.12 
 
 		 266 aa  92.8  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1440  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 273 aa  93.2  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.34 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  29.05 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 260 aa  92.4  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  27.08 
 
 		 265 aa  92.4  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0581  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.51 
 
 		 278 aa  92  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143423  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1028  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 250 aa  92  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  26.25 
 
 		 265 aa  92  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  26.67 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1379  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.44 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2733  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0727882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0588  extracellular solute-binding protein family 3  30.04 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00341778  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.81 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0567  amino acid ABC transporter  30.08 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  26.56 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0434  arginine-binding periplasmic protein 1  28.46 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0891  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  24.62 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437353  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00868  arginine transporter subunit  24.62 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.208844  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2779  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0967  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  24.62 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2280  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.15 
 
 		 244 aa  89.7  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2468  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  24.62 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381979  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 264 aa  89.4  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0936  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  24.62 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.570643  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00874  hypothetical protein  24.62 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2277  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25 
 
 		 243 aa  89.4  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 284 aa  89  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  32.52 
 
 		 266 aa  89  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  25.11 
 
 		 247 aa  89  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1259  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 295 aa  89  7e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  28.63 
 
 		 489 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.63 
 
 		 489 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>