21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1707 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1707  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  434  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1634  subunit of the multisubunit Na+/H+ antiporter-like protein  96.85 
 
 
222 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1786  hypothetical protein  27.62 
 
 
215 aa  84  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0577  hypothetical protein  27.71 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3547  hypothetical protein  26.83 
 
 
198 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.637732  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3345  hypothetical protein  28.79 
 
 
183 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135204  normal  0.416705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2757  hypothetical protein  28.79 
 
 
183 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1469  hypothetical protein  27.66 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.207552 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4790  hypothetical protein  32.74 
 
 
189 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.032096  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1619  hypothetical protein  27.88 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0599  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
285 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2567  hypothetical protein  26.72 
 
 
180 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1745  hypothetical protein  41.54 
 
 
95 aa  46.2  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1167  hypothetical protein  38.46 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.26838  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  25.51 
 
 
718 aa  43.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3757  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 
722 aa  42  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00680272 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3695  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.31 
 
 
782 aa  42  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.983526 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1842  hypothetical protein  25.84 
 
 
304 aa  42  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2443  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
222 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552006  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2449  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
222 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.553212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2403  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
222 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>