More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3757 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3757  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 722 aa  1467    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00680272 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3001  extracellular solute-binding protein  79.22 
 
 		 725 aa  1199    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.620966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3213  extracellular solute-binding protein  82.13 
 
 		 722 aa  1219    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3583  extracellular solute-binding protein  82.08 
 
 		 738 aa  1229    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1239  extracellular solute-binding protein  39.33 
 
 		 736 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4167  sodium/dicarboxylate symporter family protein  33.29 
 
 		 721 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2113  extracellular solute-binding protein family 3  30.46 
 
 		 764 aa  364  2e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12331  DAACS family glutamate/aspartate/dicarboxylate symporter  26.86 
 
 		 737 aa  277  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  28.21 
 
 		 412 aa  90.9  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  27.84 
 
 		 409 aa  89.7  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  27.84 
 
 		 416 aa  89  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  27.84 
 
 		 416 aa  89  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  27.84 
 
 		 416 aa  89  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 		 250 aa  89  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  27.47 
 
 		 409 aa  88.6  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  27.84 
 
 		 416 aa  87.8  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  27.47 
 
 		 409 aa  87.4  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  28.33 
 
 		 434 aa  86.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0145  sodium:dicarboxylate symporter  27.21 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  25.09 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1116  sodium:dicarboxylate symporter  26.55 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  25.09 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  25.09 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  25.09 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  24.03 
 
 		 430 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3625  sodium:dicarboxylate symporter  27.21 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  25.68 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1046  sodium:dicarboxylate symporter  25.09 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  22.38 
 
 		 435 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  22.38 
 
 		 440 aa  77  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  22.38 
 
 		 440 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  28.51 
 
 		 272 aa  76.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  24.57 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  27 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  22.38 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1570  sodium:dicarboxylate symporter  27.37 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  21.8 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  23.43 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  26.81 
 
 		 417 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05952  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  24.89 
 
 		 272 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  25.31 
 
 		 273 aa  72.8  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  25.63 
 
 		 435 aa  72  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  25.63 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 266 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  23.86 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000216  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  25.42 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.909844  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4898  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0941  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  27.93 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0934769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  25.61 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3279  polar amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.93 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  23.13 
 
 		 419 aa  70.5  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  25.88 
 
 		 419 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5074  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 266 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  23.23 
 
 		 433 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  23.79 
 
 		 266 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  25.52 
 
 		 266 aa  70.5  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  21.77 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5024  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.41 
 
 		 266 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0714  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  27.31 
 
 		 256 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0236853 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  24.81 
 
 		 439 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 247 aa  69.7  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  25.86 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3547  sodium:dicarboxylate symporter  23.55 
 
 		 454 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280524 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3995  sodium:dicarboxylate symporter  27.37 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.845603  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3959  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  25 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  25.72 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0515  sodium:dicarboxylate symporter  23.18 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3412  arogenate dehydratase  27.48 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40472  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02547  proton/glutamate symporter  25.23 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  23.35 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1539  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.3 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0477  extracellular solute-binding protein family 3  22.13 
 
 		 278 aa  66.6  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.225572 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2779  Arogenate dehydratase  33.88 
 
 		 270 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  24.38 
 
 		 441 aa  67.4  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  24.92 
 
 		 445 aa  67  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2375  Arogenate dehydratase  34.78 
 
 		 271 aa  66.6  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.380609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  24.03 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0109  arogenate dehydratase  27.04 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  26.56 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  22.97 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  25.51 
 
 		 449 aa  65.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  22.97 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0100  prephenate dehydratase  27.04 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688966  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  23.97 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  21.76 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2669  extracellular solute-binding protein  21.96 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00514827  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  23.05 
 
 		 451 aa  65.5  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  22.9 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2597  extracellular solute-binding protein family 3  25.42 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189611  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  22.06 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  22.97 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1660  Na+/H+-dicarboxylate symporter  25.56 
 
 		 480 aa  65.1  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000719973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  24.75 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2512  putative cyclohexadienyl dehydratase precursor signal peptide protein  34.78 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.204589  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  33.67 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2035  sodium:dicarboxylate symporter  19.93 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4123  cyclohexadienyl dehydratase  35.11 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0829887  normal  0.672072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>