More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0144 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  99.28 
 
 		 416 aa  810    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  96.03 
 
 		 412 aa  770    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 416 aa  816    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1046  sodium:dicarboxylate symporter  81.89 
 
 		 408 aa  648    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3625  sodium:dicarboxylate symporter  87.65 
 
 		 408 aa  687    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0145  sodium:dicarboxylate symporter  94.71 
 
 		 416 aa  774    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  96.77 
 
 		 409 aa  771    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  96.28 
 
 		 409 aa  766    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  99.52 
 
 		 416 aa  812    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  96.53 
 
 		 409 aa  769    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 416 aa  816    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1116  sodium:dicarboxylate symporter  79.1 
 
 		 408 aa  631  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1570  sodium:dicarboxylate symporter  73.79 
 
 		 420 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02547  proton/glutamate symporter  68.12 
 
 		 417 aa  546  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  67.89 
 
 		 419 aa  545  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  69.25 
 
 		 419 aa  543  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0737  proton/glutamate symporter  73.62 
 
 		 252 aa  355  7.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0146822  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  38.73 
 
 		 444 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  40 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  38.48 
 
 		 444 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  38.48 
 
 		 444 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  39.5 
 
 		 440 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  39.5 
 
 		 440 aa  291  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 		 432 aa  291  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  39.5 
 
 		 435 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  37.99 
 
 		 444 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  38.24 
 
 		 443 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  38.67 
 
 		 409 aa  289  7e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  38.78 
 
 		 433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  39.02 
 
 		 430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  37.99 
 
 		 449 aa  281  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  39.01 
 
 		 411 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  38.59 
 
 		 437 aa  271  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  38.36 
 
 		 439 aa  269  8e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  39.18 
 
 		 437 aa  268  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  39.89 
 
 		 440 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  36.39 
 
 		 409 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  39.34 
 
 		 440 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  39.34 
 
 		 440 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  39.62 
 
 		 440 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  37.95 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  37.29 
 
 		 434 aa  265  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  39.34 
 
 		 437 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  39.34 
 
 		 437 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  40.11 
 
 		 433 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  38.54 
 
 		 436 aa  263  6e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  36.32 
 
 		 411 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  38.72 
 
 		 410 aa  261  2e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  36.32 
 
 		 411 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.32 
 
 		 411 aa  259  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  36.08 
 
 		 411 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.08 
 
 		 411 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  36.08 
 
 		 411 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  36.08 
 
 		 411 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  34.62 
 
 		 442 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  38.06 
 
 		 434 aa  256  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  37.53 
 
 		 436 aa  256  7e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  39.56 
 
 		 434 aa  256  7e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  35.84 
 
 		 411 aa  255  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  36.08 
 
 		 411 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  37.59 
 
 		 423 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  35.84 
 
 		 411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  37.35 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  37.35 
 
 		 423 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  37.35 
 
 		 423 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  37.35 
 
 		 423 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  37.35 
 
 		 423 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  37.35 
 
 		 423 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  37.11 
 
 		 423 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  37.11 
 
 		 423 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  36.99 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  38.96 
 
 		 437 aa  248  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  36.62 
 
 		 437 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  35.48 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  36 
 
 		 443 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  36.71 
 
 		 442 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03949  glutamate/aspartate:proton symporter  34.04 
 
 		 437 aa  243  7e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4633  glutamate/aspartate:proton symporter  34.04 
 
 		 437 aa  243  7e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03909  hypothetical protein  34.04 
 
 		 437 aa  243  7e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  34.04 
 
 		 437 aa  243  7e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  35.56 
 
 		 417 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  36.44 
 
 		 441 aa  242  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5090  glutamate/aspartate:proton symporter  36.47 
 
 		 442 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  33.8 
 
 		 437 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  33.8 
 
 		 437 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5604  sodium:dicarboxylate symporter  35.99 
 
 		 442 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  33.8 
 
 		 437 aa  241  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  33.8 
 
 		 437 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5968  sodium:dicarboxylate symporter  35.99 
 
 		 442 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431964  hitchhiker  0.00472549 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3915  sodium:dicarboxylate symporter  33.8 
 
 		 437 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  33.57 
 
 		 436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.740703 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  33.57 
 
 		 436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  33.57 
 
 		 436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  38.9 
 
 		 438 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6468  sodium:dicarboxylate symporter  35.75 
 
 		 442 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955844  normal  0.0248013 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  33.57 
 
 		 436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  36.68 
 
 		 402 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4677  glutamate/aspartate:proton symporter  33.57 
 
 		 436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  32.17 
 
 		 438 aa  240  4e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6252  sodium:dicarboxylate symporter  36.36 
 
 		 442 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  normal  0.842573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>