More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003079 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  96.18 
 
 		 419 aa  800    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  100 
 
 		 419 aa  826    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02547  proton/glutamate symporter  82.65 
 
 		 417 aa  684    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  68.7 
 
 		 412 aa  548  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  67.96 
 
 		 416 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  68.45 
 
 		 416 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  68.2 
 
 		 416 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  67.96 
 
 		 416 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1570  sodium:dicarboxylate symporter  67.16 
 
 		 420 aa  541  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  68.4 
 
 		 409 aa  541  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  67.97 
 
 		 409 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  67.48 
 
 		 409 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0145  sodium:dicarboxylate symporter  66.67 
 
 		 416 aa  532  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1116  sodium:dicarboxylate symporter  66.58 
 
 		 408 aa  534  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3625  sodium:dicarboxylate symporter  68.69 
 
 		 408 aa  525  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1046  sodium:dicarboxylate symporter  66.17 
 
 		 408 aa  512  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0737  proton/glutamate symporter  87.82 
 
 		 252 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0146822  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0790  proton/glutamate symporter  83.7 
 
 		 190 aa  312  5.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000536716  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  42.45 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  41.79 
 
 		 434 aa  271  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  42.7 
 
 		 434 aa  270  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  38.86 
 
 		 409 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  39.56 
 
 		 434 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  41.87 
 
 		 445 aa  265  8e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  39.16 
 
 		 436 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  36.83 
 
 		 409 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  39.73 
 
 		 439 aa  261  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  37.41 
 
 		 444 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  37.16 
 
 		 444 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  39.27 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  37.16 
 
 		 444 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  39.27 
 
 		 437 aa  260  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  39.53 
 
 		 437 aa  260  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  39.78 
 
 		 437 aa  260  4e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  38.58 
 
 		 440 aa  259  8e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  39.21 
 
 		 436 aa  258  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  37.06 
 
 		 443 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  37.03 
 
 		 440 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  37.03 
 
 		 440 aa  257  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  38.38 
 
 		 436 aa  256  4e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  38.58 
 
 		 440 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  38.58 
 
 		 440 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  38.59 
 
 		 402 aa  256  5e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  37.03 
 
 		 435 aa  256  5e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  36.67 
 
 		 444 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  38.58 
 
 		 440 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  39.43 
 
 		 437 aa  255  8e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  38.48 
 
 		 442 aa  255  9e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  35.78 
 
 		 424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  39.64 
 
 		 410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  35.55 
 
 		 411 aa  254  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  37.1 
 
 		 432 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  36.97 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  36.17 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  35.85 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  36.05 
 
 		 411 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  36.05 
 
 		 411 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.05 
 
 		 411 aa  249  5e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  36.05 
 
 		 411 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  36.05 
 
 		 411 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.05 
 
 		 411 aa  249  6e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  35.73 
 
 		 438 aa  249  9e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  35.79 
 
 		 411 aa  249  9e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  35.77 
 
 		 411 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3834  glutamate/aspartate:proton symporter  35.92 
 
 		 438 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.918484  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3920  glutamate/aspartate:proton symporter  35.92 
 
 		 438 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3946  glutamate/aspartate:proton symporter  35.92 
 
 		 438 aa  247  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  37.25 
 
 		 443 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  35.9 
 
 		 411 aa  245  8e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  34.61 
 
 		 443 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  35.64 
 
 		 449 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  35.64 
 
 		 430 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  36.75 
 
 		 443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  36.5 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  37.11 
 
 		 447 aa  243  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  36.5 
 
 		 444 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  36.62 
 
 		 417 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0298  sodium:dicarboxylate symporter  37.17 
 
 		 438 aa  242  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  35.8 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  39.13 
 
 		 449 aa  241  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  35.8 
 
 		 423 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  35.8 
 
 		 423 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  36.84 
 
 		 442 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  35.8 
 
 		 423 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  35.56 
 
 		 423 aa  239  9e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  35.56 
 
 		 423 aa  239  9e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  35.56 
 
 		 423 aa  239  9e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  38.39 
 
 		 409 aa  238  1e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2704  sodium:dicarboxylate symporter  35.29 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  35.32 
 
 		 423 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  35.32 
 
 		 423 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  38.74 
 
 		 438 aa  237  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  35.75 
 
 		 443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  35.82 
 
 		 436 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  35.82 
 
 		 436 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.740703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4677  glutamate/aspartate:proton symporter  35.82 
 
 		 436 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  35.82 
 
 		 436 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  35.82 
 
 		 436 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0155  glutamate/aspartate:proton symporter  36.24 
 
 		 442 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  36.34 
 
 		 440 aa  232  9e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>