More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3625 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  87.65 
 
 		 412 aa  706    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  87.9 
 
 		 416 aa  713    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3625  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 408 aa  793    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  88.15 
 
 		 416 aa  714    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  88.56 
 
 		 409 aa  712    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  87.65 
 
 		 416 aa  711    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  88.06 
 
 		 409 aa  708    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0145  sodium:dicarboxylate symporter  85.68 
 
 		 416 aa  693    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  88.06 
 
 		 409 aa  709    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  87.65 
 
 		 416 aa  711    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1046  sodium:dicarboxylate symporter  78.19 
 
 		 408 aa  620  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1116  sodium:dicarboxylate symporter  74.51 
 
 		 408 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1570  sodium:dicarboxylate symporter  74.07 
 
 		 420 aa  597  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02547  proton/glutamate symporter  69.9 
 
 		 417 aa  545  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  67.96 
 
 		 419 aa  541  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  69.46 
 
 		 419 aa  541  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0737  proton/glutamate symporter  77.09 
 
 		 252 aa  355  7.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0146822  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  40.41 
 
 		 444 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  40.15 
 
 		 444 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  40.15 
 
 		 444 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  38.5 
 
 		 440 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  38.5 
 
 		 440 aa  293  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  39.64 
 
 		 444 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  38.5 
 
 		 435 aa  292  6e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  39.13 
 
 		 424 aa  292  7e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  40.77 
 
 		 409 aa  292  9e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  39.39 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  38.46 
 
 		 432 aa  287  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  38.11 
 
 		 430 aa  285  8e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  37.05 
 
 		 433 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  39.84 
 
 		 439 aa  278  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  37.85 
 
 		 449 aa  277  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  39.52 
 
 		 437 aa  276  5e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  40.64 
 
 		 410 aa  272  1e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  39.78 
 
 		 436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  39.4 
 
 		 411 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  39.45 
 
 		 437 aa  269  8e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  37.25 
 
 		 409 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  40.16 
 
 		 437 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  40.16 
 
 		 437 aa  266  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  40.16 
 
 		 440 aa  265  8e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  39.89 
 
 		 440 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  39.89 
 
 		 440 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  39.02 
 
 		 436 aa  263  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  38.44 
 
 		 442 aa  263  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  39.89 
 
 		 440 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  38.36 
 
 		 436 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  36.54 
 
 		 434 aa  261  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  36.43 
 
 		 411 aa  256  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  38.75 
 
 		 449 aa  256  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  39.4 
 
 		 433 aa  256  5e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  37.7 
 
 		 411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  38.44 
 
 		 417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.18 
 
 		 411 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  38.8 
 
 		 445 aa  253  5.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  39.13 
 
 		 434 aa  253  6e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  37.09 
 
 		 423 aa  253  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  37.4 
 
 		 411 aa  252  7e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  37.4 
 
 		 411 aa  252  7e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  37.4 
 
 		 411 aa  252  7e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  37.4 
 
 		 411 aa  252  7e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  39.29 
 
 		 434 aa  252  8.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  36.84 
 
 		 423 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  38.04 
 
 		 411 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  38.08 
 
 		 441 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  37.09 
 
 		 423 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  36.84 
 
 		 423 aa  251  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  36.84 
 
 		 423 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  37.09 
 
 		 423 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  36.84 
 
 		 423 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  38.63 
 
 		 437 aa  250  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  38.71 
 
 		 402 aa  250  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  35.93 
 
 		 411 aa  250  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  36.84 
 
 		 423 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  35.93 
 
 		 411 aa  249  6e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  36.84 
 
 		 423 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  36.88 
 
 		 437 aa  248  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  34.62 
 
 		 438 aa  247  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  34.62 
 
 		 438 aa  246  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 		 438 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  36.57 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  36.57 
 
 		 444 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  37.78 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  34.4 
 
 		 443 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  34.77 
 
 		 442 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0298  sodium:dicarboxylate symporter  34.64 
 
 		 438 aa  239  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  36.14 
 
 		 457 aa  239  8e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  34.38 
 
 		 443 aa  239  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  36.86 
 
 		 457 aa  238  1e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  33.74 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  33.74 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  34.14 
 
 		 443 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4677  glutamate/aspartate:proton symporter  33.74 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  33.74 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  33.74 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.740703 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11013  proton/glutamate symporter  34.66 
 
 		 481 aa  237  3e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  37.13 
 
 		 457 aa  237  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0277  glutamate/aspartate:proton symporter  35.45 
 
 		 437 aa  236  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  36.59 
 
 		 422 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0155  glutamate/aspartate:proton symporter  34.77 
 
 		 442 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>