More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2349 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 409 aa  810    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  61.46 
 
 		 411 aa  511  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  60.98 
 
 		 411 aa  510  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  61.22 
 
 		 411 aa  511  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  61.22 
 
 		 411 aa  511  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  60.98 
 
 		 411 aa  508  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  61.22 
 
 		 411 aa  511  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  61.22 
 
 		 411 aa  510  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  60.98 
 
 		 411 aa  511  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  61.22 
 
 		 411 aa  511  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  60.98 
 
 		 411 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  60 
 
 		 411 aa  498  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  50.5 
 
 		 436 aa  388  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  50.25 
 
 		 436 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  48.39 
 
 		 439 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  48.26 
 
 		 437 aa  375  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  48.02 
 
 		 440 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  48.27 
 
 		 442 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  48.26 
 
 		 437 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  48.51 
 
 		 437 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  48.02 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  47.77 
 
 		 440 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  47.77 
 
 		 440 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  46.5 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  49.73 
 
 		 410 aa  362  6e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  46.29 
 
 		 437 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  47.34 
 
 		 449 aa  359  6e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  47.28 
 
 		 436 aa  358  7e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  45.61 
 
 		 424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  49.51 
 
 		 448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  50.14 
 
 		 417 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  45.36 
 
 		 435 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  45.36 
 
 		 440 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  45.36 
 
 		 440 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  45.86 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  46.67 
 
 		 445 aa  352  7e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  47.77 
 
 		 441 aa  351  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  45.61 
 
 		 430 aa  350  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  44.61 
 
 		 432 aa  349  4e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  45.91 
 
 		 434 aa  349  6e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  44.89 
 
 		 409 aa  348  7e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  46 
 
 		 444 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  45.75 
 
 		 444 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  46.15 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  46 
 
 		 444 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  43.61 
 
 		 433 aa  347  3e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  46 
 
 		 444 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  48 
 
 		 402 aa  344  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  46.02 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  45.17 
 
 		 447 aa  342  5.999999999999999e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  45.77 
 
 		 436 aa  342  7e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  43.86 
 
 		 449 aa  342  9e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  45.57 
 
 		 440 aa  341  1e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  45.27 
 
 		 434 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  44.33 
 
 		 457 aa  338  9e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  46.55 
 
 		 457 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  44.58 
 
 		 457 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  45.61 
 
 		 452 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  47.52 
 
 		 438 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  45.89 
 
 		 425 aa  335  7e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  45.54 
 
 		 409 aa  322  7e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  43.97 
 
 		 445 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  43.03 
 
 		 409 aa  307  3e-82  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  42.22 
 
 		 413 aa  302  9e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  39.08 
 
 		 424 aa  292  9e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  42.64 
 
 		 437 aa  291  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  41.2 
 
 		 428 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  41.06 
 
 		 451 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  37.68 
 
 		 425 aa  275  8e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  39.28 
 
 		 424 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2261  sodium:dicarboxylate symporter  35.29 
 
 		 488 aa  271  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0298  sodium:dicarboxylate symporter  39.29 
 
 		 438 aa  270  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  39.52 
 
 		 423 aa  270  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1020  sodium--dicarboxylate symporter  39.86 
 
 		 479 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  39.75 
 
 		 413 aa  268  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  39.28 
 
 		 423 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  41.01 
 
 		 430 aa  268  2e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  39.71 
 
 		 423 aa  267  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  39.04 
 
 		 423 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  36.63 
 
 		 416 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  36.96 
 
 		 412 aa  266  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  39.04 
 
 		 424 aa  266  4e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  38.8 
 
 		 423 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  38.8 
 
 		 423 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  36.97 
 
 		 409 aa  266  5e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  36.39 
 
 		 416 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  36.63 
 
 		 416 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  36.39 
 
 		 416 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5137  sodium:dicarboxylate symporter  41.69 
 
 		 433 aa  266  5.999999999999999e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  37.84 
 
 		 423 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  37.84 
 
 		 423 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  37.84 
 
 		 423 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  37.84 
 
 		 423 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  40.05 
 
 		 417 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  36.5 
 
 		 409 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  39.04 
 
 		 424 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  37.59 
 
 		 423 aa  265  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  37.62 
 
 		 422 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  37.59 
 
 		 423 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  38.55 
 
 		 423 aa  263  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>