More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0956 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 437 aa  853    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11013  proton/glutamate symporter  49.68 
 
 		 481 aa  429  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1194  hypothetical protein  52.72 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654767 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  44.16 
 
 		 443 aa  330  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  44.15 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  43.76 
 
 		 435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  43.76 
 
 		 440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  43.76 
 
 		 440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  44.21 
 
 		 444 aa  325  9e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  44.21 
 
 		 444 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  43.98 
 
 		 444 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  43.75 
 
 		 444 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  43.19 
 
 		 432 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  43.93 
 
 		 430 aa  317  4e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  42.39 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  40.14 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  42.52 
 
 		 449 aa  310  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  45.39 
 
 		 417 aa  306  7e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  44.29 
 
 		 402 aa  300  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  42.02 
 
 		 409 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  42.72 
 
 		 437 aa  295  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  41.65 
 
 		 425 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  42.19 
 
 		 434 aa  291  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  41.22 
 
 		 442 aa  290  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  41.36 
 
 		 409 aa  290  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  42.46 
 
 		 436 aa  290  4e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  42.17 
 
 		 436 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1002  sodium:dicarboxylate symporter  41.65 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.541825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  42.15 
 
 		 436 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  42.31 
 
 		 410 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  40.43 
 
 		 439 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  41.31 
 
 		 441 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  42.86 
 
 		 449 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  40.42 
 
 		 437 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  43.43 
 
 		 447 aa  282  9e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  40.79 
 
 		 437 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  40.79 
 
 		 437 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  40.6 
 
 		 434 aa  280  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  40.84 
 
 		 434 aa  280  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  41.03 
 
 		 440 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  40.79 
 
 		 440 aa  279  7e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  40.79 
 
 		 440 aa  279  7e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  40.79 
 
 		 440 aa  279  7e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  39.91 
 
 		 445 aa  278  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  41.33 
 
 		 411 aa  277  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  41.09 
 
 		 411 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  41.09 
 
 		 411 aa  276  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  39.72 
 
 		 437 aa  276  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  41.33 
 
 		 411 aa  275  8e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  41.09 
 
 		 411 aa  275  9e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  41.59 
 
 		 411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  40.86 
 
 		 411 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  40.86 
 
 		 411 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  40.86 
 
 		 411 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  40.86 
 
 		 411 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  41.57 
 
 		 411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  40.53 
 
 		 409 aa  273  3e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  39.81 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2261  sodium:dicarboxylate symporter  36.16 
 
 		 488 aa  271  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3229  sodium:dicarboxylate symporter  39.39 
 
 		 439 aa  270  5e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  39.05 
 
 		 457 aa  270  5e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  40 
 
 		 433 aa  269  7e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  38.6 
 
 		 457 aa  268  2e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1279  sodium:dicarboxylate symporter  36.77 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0428035  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0661  sodium:dicarboxylate symporter  38.06 
 
 		 441 aa  263  4.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0107528  normal  0.201117 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  41.82 
 
 		 438 aa  262  8e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  38.27 
 
 		 424 aa  261  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  38.69 
 
 		 457 aa  261  1e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  39.61 
 
 		 413 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1353  excitatory amino acid transporter  38.39 
 
 		 427 aa  260  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6400  sodium:dicarboxylate symporter  39.86 
 
 		 470 aa  259  7e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  39.63 
 
 		 445 aa  256  7e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  38.44 
 
 		 451 aa  256  7e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1033  proton glutamate symport protein  38.29 
 
 		 432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.207746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  36.32 
 
 		 422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  43.64 
 
 		 448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  37.67 
 
 		 430 aa  254  3e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  38.88 
 
 		 409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0909  sodium:dicarboxylate symporter  37.96 
 
 		 432 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1770  Sodium/dicarboxylate symporter  40.68 
 
 		 405 aa  252  7e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  42.75 
 
 		 436 aa  249  5e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  37.12 
 
 		 423 aa  249  7e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  37.12 
 
 		 423 aa  249  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  37.12 
 
 		 423 aa  249  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  35.99 
 
 		 416 aa  249  9e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  37.12 
 
 		 423 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  37.12 
 
 		 423 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  37.12 
 
 		 424 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2738  Sodium:dicarboxylate symporter  39.01 
 
 		 413 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  35.99 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  35.99 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  35.99 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  37.12 
 
 		 423 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  37.12 
 
 		 424 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  35.27 
 
 		 409 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  34.78 
 
 		 412 aa  246  6e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  37.76 
 
 		 452 aa  246  9e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  36.41 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  36.41 
 
 		 424 aa  244  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1020  sodium--dicarboxylate symporter  38.72 
 
 		 479 aa  244  3e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>