More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0743 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  88.37 
 
 		 449 aa  767    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  85.47 
 
 		 424 aa  716    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  81.63 
 
 		 444 aa  705    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  81.16 
 
 		 444 aa  702    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  87.04 
 
 		 432 aa  756    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  81.4 
 
 		 444 aa  702    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 433 aa  863    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  84.85 
 
 		 435 aa  739    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  84.85 
 
 		 440 aa  738    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  85.08 
 
 		 440 aa  741    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  83.85 
 
 		 430 aa  704    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  85.08 
 
 		 443 aa  733    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  81.63 
 
 		 444 aa  705    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  67.25 
 
 		 409 aa  550  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  57.36 
 
 		 417 aa  455  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  56.13 
 
 		 410 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  47.22 
 
 		 417 aa  385  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  46.83 
 
 		 427 aa  381  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  46.6 
 
 		 441 aa  376  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  46.04 
 
 		 416 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  46.94 
 
 		 413 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  46.68 
 
 		 419 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  46.68 
 
 		 419 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  46.68 
 
 		 419 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  47.57 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  46.93 
 
 		 419 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  46.25 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  46 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  46.86 
 
 		 426 aa  363  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  46 
 
 		 417 aa  364  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  44.55 
 
 		 434 aa  363  4e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  47.54 
 
 		 419 aa  360  3e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  46.8 
 
 		 436 aa  359  5e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  46.8 
 
 		 437 aa  359  7e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  47.04 
 
 		 436 aa  358  8e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  45.87 
 
 		 416 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  44.5 
 
 		 442 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  46.06 
 
 		 437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  45.52 
 
 		 434 aa  355  5.999999999999999e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  45.48 
 
 		 445 aa  355  5.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  45.11 
 
 		 433 aa  355  8.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  46.95 
 
 		 402 aa  353  4e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  47.41 
 
 		 434 aa  352  5.9999999999999994e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  47.31 
 
 		 447 aa  352  7e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  45.81 
 
 		 437 aa  352  7e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  45.26 
 
 		 440 aa  352  8e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  45.02 
 
 		 440 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  45.02 
 
 		 440 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  45.02 
 
 		 440 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  45.32 
 
 		 441 aa  350  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  45.36 
 
 		 449 aa  350  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  45.57 
 
 		 437 aa  350  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  43.68 
 
 		 424 aa  350  4e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  44.13 
 
 		 436 aa  348  8e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  43.84 
 
 		 439 aa  348  1e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  43.61 
 
 		 409 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  46.27 
 
 		 413 aa  346  5e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  44.96 
 
 		 437 aa  345  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  45.78 
 
 		 448 aa  335  7.999999999999999e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  42.22 
 
 		 440 aa  334  2e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  45.19 
 
 		 411 aa  333  3e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  44.69 
 
 		 411 aa  332  6e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  45.89 
 
 		 438 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  44.69 
 
 		 411 aa  332  8e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  44.44 
 
 		 411 aa  330  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  44.69 
 
 		 411 aa  331  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  44.2 
 
 		 411 aa  329  6e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  44.2 
 
 		 411 aa  329  6e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  44.2 
 
 		 411 aa  329  6e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  44.2 
 
 		 411 aa  329  6e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  44.44 
 
 		 411 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  43.94 
 
 		 411 aa  325  9e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4883  sodium:dicarboxylate symporter  41.37 
 
 		 445 aa  320  3e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  38.59 
 
 		 409 aa  318  1e-85  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  40.47 
 
 		 430 aa  316  6e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  39.63 
 
 		 445 aa  315  8e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  43.65 
 
 		 428 aa  315  8e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  42.08 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  39.14 
 
 		 457 aa  313  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  38.96 
 
 		 457 aa  311  1e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  44.16 
 
 		 409 aa  306  6e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  43.19 
 
 		 437 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  40.19 
 
 		 425 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  38.19 
 
 		 457 aa  300  3e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  41.19 
 
 		 422 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  44.44 
 
 		 423 aa  299  6e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  39.76 
 
 		 439 aa  297  3e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  39.86 
 
 		 452 aa  296  4e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  43.31 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  43.07 
 
 		 423 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2889  sodium:dicarboxylate symporter  36.92 
 
 		 444 aa  293  4e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.568975  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  42.82 
 
 		 423 aa  292  7e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  43.07 
 
 		 424 aa  291  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  42.82 
 
 		 423 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  42.82 
 
 		 424 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  42.82 
 
 		 423 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5137  sodium:dicarboxylate symporter  40.65 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  42.82 
 
 		 423 aa  289  6e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  42.82 
 
 		 424 aa  289  6e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  38.83 
 
 		 435 aa  289  6e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>