More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2359 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  73.23 
 
 		 448 aa  635    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 449 aa  885    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  65.21 
 
 		 447 aa  584  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  64.75 
 
 		 434 aa  558  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  61.17 
 
 		 436 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  60.73 
 
 		 436 aa  531  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  61.17 
 
 		 445 aa  531  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  62.27 
 
 		 439 aa  533  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  60 
 
 		 437 aa  531  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  60 
 
 		 440 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  60 
 
 		 440 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  60 
 
 		 440 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  60.23 
 
 		 437 aa  526  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  60.41 
 
 		 434 aa  525  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  60.05 
 
 		 433 aa  525  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  59.78 
 
 		 440 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  60 
 
 		 437 aa  526  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  60.23 
 
 		 437 aa  527  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  60.42 
 
 		 442 aa  527  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  59.95 
 
 		 434 aa  523  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  59.19 
 
 		 436 aa  521  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  60.19 
 
 		 437 aa  520  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  60.14 
 
 		 441 aa  499  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  60.45 
 
 		 438 aa  496  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  55.3 
 
 		 436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  52.31 
 
 		 457 aa  428  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  51.85 
 
 		 457 aa  425  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  53.83 
 
 		 457 aa  422  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  51.74 
 
 		 452 aa  394  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  52.42 
 
 		 411 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  52.15 
 
 		 411 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  51.61 
 
 		 411 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  51.61 
 
 		 411 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  51.61 
 
 		 411 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  51.61 
 
 		 411 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  51.61 
 
 		 411 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  50 
 
 		 409 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  51.61 
 
 		 411 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  51.61 
 
 		 411 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  52.29 
 
 		 411 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  42.66 
 
 		 440 aa  362  1e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  50.26 
 
 		 411 aa  361  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  47.34 
 
 		 409 aa  359  6e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  49.73 
 
 		 417 aa  358  8e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  47.7 
 
 		 435 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  47.7 
 
 		 440 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  47.7 
 
 		 440 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  44.05 
 
 		 424 aa  353  4e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  47.43 
 
 		 430 aa  353  5e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  45.57 
 
 		 432 aa  350  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  45.36 
 
 		 433 aa  350  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  43.81 
 
 		 443 aa  350  4e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  44.74 
 
 		 449 aa  348  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  46.9 
 
 		 410 aa  348  1e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  44.03 
 
 		 445 aa  347  2e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  43.93 
 
 		 425 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  46.76 
 
 		 444 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  46.76 
 
 		 444 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  46.49 
 
 		 444 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  46.76 
 
 		 444 aa  339  5e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  41.54 
 
 		 451 aa  318  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  42.82 
 
 		 413 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  40.67 
 
 		 402 aa  296  7e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  41.51 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01133  hypothetical protein  40.93 
 
 		 424 aa  286  8e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  42.86 
 
 		 437 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004292  proton/glutamate symport protein  42.24 
 
 		 424 aa  282  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0413758  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1325  proton glutamate symport protein  41.19 
 
 		 427 aa  276  4e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151644  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  41.25 
 
 		 432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1020  sodium--dicarboxylate symporter  37.04 
 
 		 479 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  38.26 
 
 		 437 aa  273  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  38.26 
 
 		 437 aa  273  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  38.26 
 
 		 437 aa  273  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  38.26 
 
 		 437 aa  273  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03949  glutamate/aspartate:proton symporter  38.26 
 
 		 437 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03909  hypothetical protein  38.26 
 
 		 437 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  41.08 
 
 		 430 aa  273  4.0000000000000004e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4633  glutamate/aspartate:proton symporter  38.26 
 
 		 437 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  38.26 
 
 		 437 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3882  sodium:dicarboxylate symporter  39.95 
 
 		 424 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3915  sodium:dicarboxylate symporter  38.26 
 
 		 437 aa  273  6e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3781  sodium:dicarboxylate symporter  41.25 
 
 		 421 aa  272  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549433  hitchhiker  0.000150842 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  39.16 
 
 		 409 aa  268  1e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4677  glutamate/aspartate:proton symporter  37.36 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  37.36 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  37.36 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  37.36 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.740703 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  37.36 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  45.99 
 
 		 428 aa  267  2e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4883  sodium:dicarboxylate symporter  41.87 
 
 		 445 aa  266  7e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  41.62 
 
 		 441 aa  265  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  41.99 
 
 		 425 aa  263  4e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  41.51 
 
 		 409 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  36.04 
 
 		 443 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  36.55 
 
 		 443 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  37.14 
 
 		 443 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  41.16 
 
 		 416 aa  261  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  42.33 
 
 		 413 aa  260  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0642  sodium:dicarboxylate symporter  39.62 
 
 		 416 aa  260  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3378  sodium:dicarboxylate symporter  39.62 
 
 		 416 aa  260  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>