More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1582 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  83.75 
 
 		 437 aa  737    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  86.04 
 
 		 437 aa  768    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  84.44 
 
 		 442 aa  744    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  85.02 
 
 		 436 aa  747    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  85.01 
 
 		 438 aa  706    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  94.71 
 
 		 440 aa  821    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  94.48 
 
 		 440 aa  819    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  81.11 
 
 		 439 aa  710    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  91.53 
 
 		 441 aa  766    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 437 aa  865    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  94.71 
 
 		 440 aa  821    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  99.31 
 
 		 437 aa  860    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  83.41 
 
 		 436 aa  731    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  83.18 
 
 		 436 aa  728    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  95.4 
 
 		 440 aa  828    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  96.57 
 
 		 437 aa  843    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  60.51 
 
 		 445 aa  528  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  60 
 
 		 449 aa  526  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  59.21 
 
 		 434 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  59.91 
 
 		 433 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  58.95 
 
 		 434 aa  516  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  58.51 
 
 		 434 aa  512  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  60.32 
 
 		 447 aa  511  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  58.96 
 
 		 448 aa  495  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  50.81 
 
 		 457 aa  425  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  50.35 
 
 		 457 aa  422  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  52.88 
 
 		 436 aa  412  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  50.46 
 
 		 452 aa  408  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  50.83 
 
 		 457 aa  396  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  47.88 
 
 		 440 aa  385  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  50 
 
 		 411 aa  378  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  50.74 
 
 		 411 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  50.5 
 
 		 411 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  50.5 
 
 		 411 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  50.5 
 
 		 411 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  50.5 
 
 		 411 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  50.5 
 
 		 411 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  50.5 
 
 		 411 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  49.75 
 
 		 411 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  49.88 
 
 		 411 aa  375  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  48.26 
 
 		 409 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  46.75 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  49.5 
 
 		 411 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  47.29 
 
 		 443 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  48.25 
 
 		 444 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  48.25 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  47.42 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  48.25 
 
 		 444 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  48 
 
 		 444 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  46.8 
 
 		 424 aa  365  1e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  49.06 
 
 		 435 aa  364  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  49.06 
 
 		 440 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  49.06 
 
 		 440 aa  363  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  46.8 
 
 		 449 aa  359  5e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  45.63 
 
 		 432 aa  359  7e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  45.48 
 
 		 409 aa  355  6.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  45.93 
 
 		 445 aa  355  1e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  45.81 
 
 		 433 aa  352  7e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  46.24 
 
 		 410 aa  347  3e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  46.95 
 
 		 417 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  44.69 
 
 		 402 aa  327  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  41.99 
 
 		 413 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  42.14 
 
 		 451 aa  302  8.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01133  hypothetical protein  42.4 
 
 		 424 aa  302  9e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  40.29 
 
 		 424 aa  296  3e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004292  proton/glutamate symport protein  42.4 
 
 		 424 aa  292  6e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0413758  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  43.94 
 
 		 428 aa  289  8e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  42.53 
 
 		 409 aa  287  2e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1020  sodium--dicarboxylate symporter  40.18 
 
 		 479 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1353  excitatory amino acid transporter  39.49 
 
 		 427 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1325  proton glutamate symport protein  40.68 
 
 		 427 aa  281  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151644  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  41.13 
 
 		 427 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  41.25 
 
 		 432 aa  280  3e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  42.04 
 
 		 426 aa  280  5e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  42.27 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  38.7 
 
 		 424 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  40.33 
 
 		 430 aa  277  3e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  43.35 
 
 		 416 aa  275  8e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  39.67 
 
 		 417 aa  273  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  38.37 
 
 		 423 aa  274  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  37.86 
 
 		 423 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  42.4 
 
 		 416 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  37.86 
 
 		 423 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  37.86 
 
 		 423 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  37.86 
 
 		 424 aa  272  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3882  sodium:dicarboxylate symporter  39.9 
 
 		 424 aa  271  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  41.93 
 
 		 416 aa  271  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3781  sodium:dicarboxylate symporter  40.29 
 
 		 421 aa  271  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549433  hitchhiker  0.000150842 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  40.84 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0719  sodium:dicarboxylate symporter  40.4 
 
 		 418 aa  270  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  37.38 
 
 		 423 aa  270  5e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  40.67 
 
 		 419 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  40.67 
 
 		 419 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1002  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 		 432 aa  269  8e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.541825 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  37.62 
 
 		 423 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  40.41 
 
 		 419 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  37.62 
 
 		 424 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3853  sodium:dicarboxylate symporter  39.15 
 
 		 414 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000161512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3727  sodium:dicarboxylate symporter  39.15 
 
 		 414 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0595  sodium:dicarboxylate symporter  39.65 
 
 		 414 aa  268  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.1634  normal  0.0311958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>