More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11013 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11013  proton/glutamate symporter  100 
 
 		 481 aa  962    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  49.68 
 
 		 437 aa  422  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1194  hypothetical protein  44.97 
 
 		 444 aa  355  1e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654767 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  40.49 
 
 		 425 aa  323  5e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  39.09 
 
 		 439 aa  292  8e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  38.85 
 
 		 437 aa  289  8e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  39.19 
 
 		 436 aa  286  5e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  39.74 
 
 		 424 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  38.81 
 
 		 444 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  38.81 
 
 		 444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  38.59 
 
 		 440 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  38.59 
 
 		 440 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  39.22 
 
 		 435 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  38.59 
 
 		 444 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  39.02 
 
 		 442 aa  281  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  38.33 
 
 		 436 aa  281  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  38.38 
 
 		 444 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  38.68 
 
 		 432 aa  276  5e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  39.57 
 
 		 433 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  39.44 
 
 		 443 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  38.46 
 
 		 436 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  38.94 
 
 		 437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  39.68 
 
 		 430 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  39.67 
 
 		 417 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  37.37 
 
 		 449 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  38.92 
 
 		 402 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  37.5 
 
 		 441 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  38.09 
 
 		 425 aa  263  4.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  37.94 
 
 		 433 aa  262  8e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1279  sodium:dicarboxylate symporter  39.34 
 
 		 441 aa  262  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0428035  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  37.18 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  35.93 
 
 		 449 aa  256  8e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  35.86 
 
 		 447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  36.4 
 
 		 457 aa  251  2e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  35.61 
 
 		 440 aa  250  4e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1002  sodium:dicarboxylate symporter  37.78 
 
 		 432 aa  249  8e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.541825 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  35.92 
 
 		 457 aa  248  1e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  38.59 
 
 		 438 aa  248  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1353  excitatory amino acid transporter  37.12 
 
 		 427 aa  247  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  36.21 
 
 		 424 aa  247  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  34.37 
 
 		 445 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  37.17 
 
 		 409 aa  246  6e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3229  sodium:dicarboxylate symporter  33.33 
 
 		 439 aa  246  6.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  36.33 
 
 		 457 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  37.21 
 
 		 411 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  36.86 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  36.79 
 
 		 411 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  36.23 
 
 		 411 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  36.23 
 
 		 411 aa  242  9e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.23 
 
 		 411 aa  242  9e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  36.23 
 
 		 411 aa  242  9e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  36.23 
 
 		 411 aa  242  9e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  35.73 
 
 		 411 aa  242  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  36.15 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  35.94 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  38.28 
 
 		 410 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  35.2 
 
 		 448 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0917  Sodium:dicarboxylate symporter  38.54 
 
 		 420 aa  238  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0420042  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  33.54 
 
 		 409 aa  237  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  33.54 
 
 		 412 aa  237  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  35.42 
 
 		 434 aa  237  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  33.12 
 
 		 409 aa  237  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  36.61 
 
 		 409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  33.12 
 
 		 409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  35.03 
 
 		 445 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  35.34 
 
 		 434 aa  233  6e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  33.47 
 
 		 422 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  46.51 
 
 		 437 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  33.05 
 
 		 416 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  45.51 
 
 		 440 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  34.63 
 
 		 409 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  46.18 
 
 		 437 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02547  proton/glutamate symporter  36.17 
 
 		 417 aa  231  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  33.05 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  33.05 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  33.05 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  37.08 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  45.51 
 
 		 440 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  45.51 
 
 		 440 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  33.33 
 
 		 425 aa  230  5e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  45.51 
 
 		 440 aa  229  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6400  sodium:dicarboxylate symporter  37.41 
 
 		 470 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1093  sodium:dicarboxylate symporter  35.42 
 
 		 425 aa  229  1e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1046  sodium:dicarboxylate symporter  31.6 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  32.84 
 
 		 438 aa  228  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2261  sodium:dicarboxylate symporter  31.71 
 
 		 488 aa  228  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0661  sodium:dicarboxylate symporter  31.18 
 
 		 441 aa  226  6e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0107528  normal  0.201117 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  33.62 
 
 		 444 aa  226  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  33.62 
 
 		 444 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  34.69 
 
 		 413 aa  224  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  34.58 
 
 		 430 aa  224  4e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  32.77 
 
 		 423 aa  223  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  33.26 
 
 		 443 aa  223  7e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  33.97 
 
 		 423 aa  223  8e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  33.4 
 
 		 438 aa  222  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  32.56 
 
 		 423 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  32.56 
 
 		 423 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3625  sodium:dicarboxylate symporter  33.57 
 
 		 408 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  33.76 
 
 		 424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  32.35 
 
 		 423 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>